ROBO1

ROBO1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2EO9, 2V9Q, 2V9T, 4HLJ
Ідентифікатори
Символи	ROBO1, DUTT1, SAX3, roundabout guidance receptor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602430 MGI: 1274781 HomoloGene: 2206 GeneCards: ROBO1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• LRR domain binding; • GO:0001948 protein binding; • identical protein binding; • axon guidance receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • cell projection; • мембрана; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • Аксон; • клітинна мембрана; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane;
Біологічний процес	• positive regulation of Rho protein signal transduction; • negative regulation of chemokine-mediated signaling pathway; • Диференціація клітин; • negative regulation of mammary gland epithelial cell proliferation; • Roundabout signaling pathway; • positive regulation of axonogenesis; • нейробіологія розвитку; • cell migration involved in sprouting angiogenesis; • axon guidance; • multicellular organism development; • хемотаксис; • heart development; • Адгезія клітин; • negative regulation of cell migration; • negative regulation of negative chemotaxis; • axon midline choice point recognition; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • chemorepulsion involved in postnatal olfactory bulb interneuron migration; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • positive regulation of MAP kinase activity; • positive regulation of vascular endothelial growth factor signaling pathway; • outflow tract septum morphogenesis; • aortic valve morphogenesis; • pulmonary valve morphogenesis; • endocardial cushion formation; • positive regulation of gene expression; • negative regulation of gene expression; • positive regulation of Notch signaling pathway involved in heart induction; • aorta development; • ventricular septum morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6091
	19876
	ENSG00000169855
	ENSMUSG00000022883
	Q9Y6N7
	O89026
	NM_001145845; NM_002941; NM_133631
	NM_019413
	NP_001139317; NP_002932; NP_598334
	NP_062286
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ROBO1 (англ. Roundabout guidance receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 651 амінокислот, а молекулярна маса — 180 930[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKWKHVPFLV	MISLLSLSPN	HLFLAQLIPD	PEDVERGNDH	GTPIPTSDND
DNSLGYTGSR	LRQEDFPPRI	VEHPSDLIVS	KGEPATLNCK	AEGRPTPTIE
WYKGGERVET	DKDDPRSHRM	LLPSGSLFFL	RIVHGRKSRP	DEGVYVCVAR
NYLGEAVSHN	ASLEVAILRD	DFRQNPSDVM	VAVGEPAVME	CQPPRGHPEP
TISWKKDGSP	LDDKDERITI	RGGKLMITYT	RKSDAGKYVC	VGTNMVGERE
SEVAELTVLE	RPSFVKRPSN	LAVTVDDSAE	FKCEARGDPV	PTVRWRKDDG
ELPKSRYEIR	DDHTLKIRKV	TAGDMGSYTC	VAENMVGKAE	ASATLTVQEP
PHFVVKPRDQ	VVALGRTVTF	QCEATGNPQP	AIFWRREGSQ	NLLFSYQPPQ
SSSRFSVSQT	GDLTITNVQR	SDVGYYICQT	LNVAGSIITK	AYLEVTDVIA
DRPPPVIRQG	PVNQTVAVDG	TFVLSCVATG	SPVPTILWRK	DGVLVSTQDS
RIKQLENGVL	QIRYAKLGDT	GRYTCIASTP	SGEATWSAYI	EVQEFGVPVQ
PPRPTDPNLI	PSAPSKPEVT	DVSRNTVTLS	WQPNLNSGAT	PTSYIIEAFS
HASGSSWQTV	AENVKTETSA	IKGLKPNAIY	LFLVRAANAY	GISDPSQISD
PVKTQDVLPT	SQGVDHKQVQ	RELGNAVLHL	HNPTVLSSSS	IEVHWTVDQQ
SQYIQGYKIL	YRPSGANHGE	SDWLVFEVRT	PAKNSVVIPD	LRKGVNYEIK
ARPFFNEFQG	ADSEIKFAKT	LEEAPSAPPQ	GVTVSKNDGN	GTAILVSWQP
PPEDTQNGMV	QEYKVWCLGN	ETRYHINKTV	DGSTFSVVIP	FLVPGIRYSV
EVAASTGAGS	GVKSEPQFIQ	LDAHGNPVSP	EDQVSLAQQI	SDVVKQPAFI
AGIGAACWII	LMVFSIWLYR	HRKKRNGLTS	TYAGIRKVPS	FTFTPTVTYQ
RGGEAVSSGG	RPGLLNISEP	AAQPWLADTW	PNTGNNHNDC	SISCCTAGNG
NSDSNLTTYS	RPADCIANYN	NQLDNKQTNL	MLPESTVYGD	VDLSNKINEM
KTFNSPNLKD	GRFVNPSGQP	TPYATTQLIQ	SNLSNNMNNG	SGDSGEKHWK
PLGQQKQEVA	PVQYNIVEQN	KLNKDYRAND	TVPPTIPYNQ	SYDQNTGGSY
NSSDRGSSTS	GSQGHKKGAR	TPKVPKQGGM	NWADLLPPPP	AHPPPHSNSE
EYNISVDESY	DQEMPCPVPP	ARMYLQQDEL	EEEEDERGPT	PPVRGAASSP
AAVSYSHQST	ATLTPSPQEE	LQPMLQDCPE	ETGHMQHQPD	RRRQPVSPPP
PPRPISPPHT	YGYISGPLVS	DMDTDAPEEE	EDEADMEVAK	MQTRRLLLRG
LEQTPASSVG	DLESSVTGSM	INGWGSASEE	DNISSGRSSV	SSSDGSFFTD
ADFAQAVAAA	AEYAGLKVAR	RQMQDAAGRR	HFHASQCPRP	TSPVSTDSNM
SAAVMQKTRP	AKKLKHQPGH	LRRETYTDDL	PPPPVPPPAI	KSPTAQSKTQ
LEVRPVVVPK	LPSMDARTDR	SSDRKGSSYK	GREVLDGRQV	VDMRTNPGDP
REAQEQQNDG	KGRGNKAAKR	DLPPAKTHLI	QEDILPYCRP	TFPTSNNPRD
PSSSSSMSSR	GSGSRQREQA	NVGRRNIAEM	QVLGGYERGE	DNNEELEETE
S

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як хемотаксис, диференціація, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Bashaw G.J., Kidd T., Murray D., Pawson T., Goodman C.S. (2000). Repulsive axon guidance: Abelson and Enabled play opposing roles downstream of the roundabout receptor.. Cell 101: 703 — 715. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)80883-1

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10249 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, Q9Y6N7 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10249 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y6N7 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.