S100A12

S100A12
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1E8A, 1GQM, 1ODB, 2M9G, 2WC8, 2WCB, 2WCE, 2WCF
Ідентифікатори
Символи	S100A12, CAAF1, CAGC, CGRP, ENRAGE, MRP-6, MRP6, p6, S100 calcium binding protein A12, EN-RAGE
Зовнішні ІД	OMIM: 603112 HomoloGene: 48361 GeneCards: S100A12
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • RAGE receptor binding; • copper ion binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • клітинна мембрана; • extracellular region; • Цитоскелет; • клітинне ядро; • secretory granule lumen;
Біологічний процес	• mast cell activation; • positive regulation of inflammatory response; • positive regulation of MAP kinase activity; • monocyte chemotaxis; • immune system process; • defense response to fungus; • neutrophil chemotaxis; • defense response to bacterium; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • xenobiotic metabolic process; • Вроджений імунітет; • inflammatory response; • neutrophil degranulation; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; • killing of cells of other organism;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6283
	н/д
	ENSG00000163221
	н/д
	P80511
	н/д
	NM_005621
	н/д
	NP_005612
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

S100A12 (англ. S100 calcium binding protein A12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 92 амінокислот, а молекулярна маса — 10 575[3].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTKLEEHLEG		IVNIFHQYSV		RKGHFDTLSK		GELKQLLTKE		LANTIKNIKD
KAVIDEIFQG		LDANQDEQVD		FQEFISLVAI		ALKAAHYHTH		KE

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фунгіцидів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь. Білок має сайт для зв'язування з іоном міді, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Wicki R., Marenholz I., Mischke D., Schaefer B.W., Heizmann C.W. (1996). Characterization of the human S100A12 (calgranulin C, p6, CAAF1, CGRP) gene, a new member of the S100 gene cluster on chromosome 1q21.. Cell Calcium 20: 459 — 464. PubMed DOI:10.1016/S0143-4160(96)90087-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Marti T., Erttmann K.D., Gallin M.Y. (1996). Host-parasite interaction in human onchocerciasis: identification and sequence analysis of a novel human calgranulin.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 221: 454 — 458. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1996.0616
Guignard F., Mauel J., Markert M. (1995). Identification and characterization of a novel human neutrophil protein related to the S100 family.. Biochem. J. 309: 395 — 401. PubMed DOI:10.1042/bj3090395
Filipek A., Jastrzebska B., Nowotny M., Kuznicki J. (2002). CacyBP/SIP, a calcyclin and Siah-1-interacting protein, binds EF-hand proteins of the S100 family.. J. Biol. Chem. 277: 28848 — 28852. PubMed DOI:10.1074/jbc.M203602200
Moroz O.V., Dodson G.G., Wilson K.S., Lukanidin E., Bronstein I.B. (2003). Multiple structural states of S100A12: A key to its functional diversity.. Microsc. Res. Tech. 60: 581 — 592. PubMed DOI:10.1002/jemt.10300

Примітки

Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10489 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P80511 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10489 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-3] UniProt, P80511 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.