SETD7

SETD7
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1H3I, 1MT6, 1MUF, 1N6A, 1N6C, 1O9S, 1XQH, 2F69, 3CBM, 3CBO, 3CBP, 3M53, 3M54, 3M55, 3M56, 3M57, 3M58, 3M59, 3M5A, 3OS5, 3VUZ, 3VV0, 4E47, 4J7F, 4J8O, 4JDS, 4JLG, 5EG2, 5AYF
Ідентифікатори
Символи	SETD7, KMT7, SET7, SET7/9, SET9, SET domain containing lysine methyltransferase 7, SET domain containing 7, histone lysine methyltransferase
Зовнішні ІД	OMIM: 606594 MGI: 1920501 HomoloGene: 12741 GeneCards: SETD7
Онтологія гена
Молекулярна функція	• methyltransferase activity; • transferase activity; • p53 binding; • chromatin binding; • protein-lysine N-methyltransferase activity; • GO:0001948 protein binding; • histone-lysine N-methyltransferase activity;
Клітинна компонента	• Нуклеоплазма; • хромосома; • Ядерце; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• regulation of transcription, DNA-templated; • peptidyl-lysine monomethylation; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • peptidyl-lysine methylation; • Метилювання; • heterochromatin organization; • peptidyl-lysine dimethylation; • histone lysine methylation; • response to ethanol; • regulation of histone H3-K9 methylation; • chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	80854
	73251
	ENSG00000145391
	ENSMUSG00000037111
	Q8WTS6
	Q8VHL1
	NM_001306199; NM_001306200; NM_030648
	NM_080793
	NP_001293128; NP_001293129; NP_085151
	NP_542983
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SETD7 (англ. SET domain containing lysine methyltransferase 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 366 амінокислот, а молекулярна маса — 40 721[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSDDEMVEE	AVEGHLDDDG	LPHGFCTVTY	SSTDRFEGNF	VHGEKNGRGK
FFFFDGSTLE	GYYVDDALQG	QGVYTYEDGG	VLQGTYVDGE	LNGPAQEYDT
DGRLIFKGQY	KDNIRHGVCW	IYYPDGGSLV	GEVNEDGEMT	GEKIAYVYPD
ERTALYGKFI	DGEMIEGKLA	TLMSTEEGRP	HFELMPGNSV	YHFDKSTSSC
ISTNALLPDP	YESERVYVAE	SLISSAGEGL	FSKVAVGPNT	VMSFYNGVRI
THQEVDSRDW	ALNGNTLSLD	EETVIDVPEP	YNHVSKYCAS	LGHKANHSFT
PNCIYDMFVH	PRFGPIKCIR	TLRAVEADEE	LTVAYGYDHS	PPGKSGPEAP
EWYQVELKAF	QATQQK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, активаторів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з s-аденозил-l-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Martens J.H., Verlaan M., Kalkhoven E., Zantema A. (2003). Cascade of distinct histone modifications during collagenase gene activation.. Mol. Cell. Biol. 23: 1808 — 1816. PubMed DOI:10.1128/MCB.23.5.1808-1816.2003
Kouskouti A., Scheer E., Staub A., Tora L., Talianidis I. (2004). Gene-specific modulation of TAF10 function by SET9-mediated methylation.. Mol. Cell 14: 175 — 182. PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(04)00182-0
Francis J., Chakrabarti S.K., Garmey J.C., Mirmira R.G. (2005). Pdx-1 links histone H3-Lys-4 methylation to RNA polymerase II elongation during activation of insulin transcription.. J. Biol. Chem. 280: 36244 — 36253. PubMed DOI:10.1074/jbc.M505741200
Hu P., Zhang Y. (2006). Catalytic mechanism and product specificity of the histone lysine methyltransferase SET7/9: an ab initio QM/MM-FE study with multiple initial structures.. J. Am. Chem. Soc. 128: 1272 — 1278. PubMed DOI:10.1021/ja056153+
Couture J.-F., Collazo E., Hauk G., Trievel R.C. (2006). Structural basis for the methylation site specificity of SET7/9.. Nat. Struct. Mol. Biol. 13: 140 — 146. PubMed DOI:10.1038/nsmb1045

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30412 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, Q8WTS6 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30412 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q8WTS6 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.