SHROOM3

SHROOM3 (англ. Shroom family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 996 амінокислот, а молекулярна маса — 216 857[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MMRTTEDFHKPSATLNSNTATKGRYIYLEAFLEGGAPWGFTLKGGLEHGE
PLIISKVEEGGKADTLSSKLQAGDEVVHINEVTLSSSRKEAVSLVKGSYK
TLRLVVRRDVCTDPGHADTGASNFVSPEHLTSGPQHRKAAWSGGVKLRLK
HRRSEPAGRPHSWHTTKSGEKQPDASMMQISQGMIGPPWHQSYHSSSSTS
DLSNYDHAYLRRSPDQCSSQGSMESLEPSGAYPPCHLSPAKSTGSIDQLS
HFHNKRDSAYSSFSTSSSILEYPHPGISGRERSGSMDNTSARGGLLEGMR
QADIRYVKTVYDTRRGVSAEYEVNSSALLLQGREARASANGQGYDKWSNI
PRGKGVPPPSWSQQCPSSLETATDNLPPKVGAPLPPARSDSYAAFRHRER
PSSWSSLDQKRLCRPQANSLGSLKSPFIEEQLHTVLEKSPENSPPVKPKH
NYTQKAQPGQPLLPTSIYPVPSLEPHFAQVPQPSVSSNGMLYPALAKESG
YIAPQGACNKMATIDENGNQNGSGRPGFAFCQPLEHDLLSPVEKKPEATA
KYVPSKVHFCSVPENEEDASLKRHLTPPQGNSPHSNERKSTHSNKPSSHP
HSLKCPQAQAWQAGEDKRSSRLSEPWEGDFQEDHNANLWRRLEREGLGQS
LSGNFGKTKSAFSSLQNIPESLRRHSSLELGRGTQEGYPGGRPTCAVNTK
AEDPGRKAAPDLGSHLDRQVSYPRPEGRTGASASFNSTDPSPEEPPAPSH
PHTSSLGRRGPGPGSASALQGFQYGKPHCSVLEKVSKFEQREQGSQRPSV
GGSGFGHNYRPHRTVSTSSTSGNDFEETKAHIRFSESAEPLGNGEQHFKN
GELKLEEASRQPCGQQLSGGASDSGRGPQRPDARLLRSQSTFQLSSEPER
EPEWRDRPGSPESPLLDAPFSRAYRNSIKDAQSRVLGATSFRRRDLELGA
PVASRSWRPRPSSAHVGLRSPEASASASPHTPRERHSVTPAEGDLARPVP
PAARRGARRRLTPEQKKRSYSEPEKMNEVGIVEEAEPAPLGPQRNGMRFP
ESSVADRRRLFERDGKACSTLSLSGPELKQFQQSALADYIQRKTGKRPTS
AAGCSLQEPGPLRERAQSAYLQPGPAALEGSGLASASSLSSLREPSLQPR
REATLLPATVAETQQAPRDRSSSFAGGRRLGERRRGDLLSGANGGTRGTQ
RGDETPREPSSWGARAGKSMSAEDLLERSDVLAGPVHVRSRSSPATADKR
QDVLLGQDSGFGLVKDPCYLAGPGSRSLSCSERGQEEMLPLFHHLTPRWG
GSGCKAIGDSSVPSECPGTLDHQRQASRTPCPRPPLAGTQGLVTDTRAAP
LTPIGTPLPSAIPSGYCSQDGQTGRQPLPPYTPAMMHRSNGHTLTQPPGP
RGCEGDGPEHGVEEGTRKRVSLPQWPPPSRAKWAHAAREDSLPEESSAPD
FANLKHYQKQQSLPSLCSTSDPDTPLGAPSTPGRISLRISESVLRDSPPP
HEDYEDEVFVRDPHPKATSSPTFEPLPPPPPPPPSQETPVYSMDDFPPPP
PHTVCEAQLDSEDPEGPRPSFNKLSKVTIARERHMPGAAHVVGSQTLASR
LQTSIKGSEAESTPPSFMSVHAQLAGSLGGQPAPIQTQSLSHDPVSGTQG
LEKKVSPDPQKSSEDIRTEALAKEIVHQDKSLADILDPDSRLKTTMDLME
GLFPRDVNLLKENSVKRKAIQRTVSSSGCEGKRNEDKEAVSMLVNCPAYY
SVSAPKAELLNKIKEMPAEVNEEEEQADVNEKKAELIGSLTHKLETLQEA
KGSLLTDIKLNNALGEEVEALISELCKPNEFDKYRMFIGDLDKVVNLLLS
LSGRLARVENVLSGLGEDASNEERSSLYEKRKILAGQHEDARELKENLDR
RERVVLGILANYLSEEQLQDYQHFVKMKSTLLIEQRKLDDKIKLGQEQVK
CLLESLPSDFIPKAGALALPPNLTSEPIPAGGCTFSGIFPTLTSPL
SHROOM3
Ідентифікатори
Символи SHROOM3, APXL3, SHRM, ShrmL, MSTP013, shroom family member 3
Зовнішні ІД OMIM: 604570 MGI: 1351655 HomoloGene: 9263 GeneCards: SHROOM3
Пов'язані генетичні захворювання
захворювання нирок[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
57619
27428
Ensembl
ENSG00000138771
ENSMUSG00000029381
UniProt
Q8TF72
Q9QXN0
RefSeq (мРНК)
NM_020859
NM_001077595
NM_001077596
NM_015756
RefSeq (білок)
NP_065910
NP_001071063
NP_001071064
NP_056571
Локус (UCSC) Хр. 4: 76.44 – 76.78 Mb Хр. 5: 92.68 – 92.97 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пдтримання форми клітини, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах.

Література

  • Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.. DNA Res. 7: 143 — 150. PubMed DOI:10.1093/dnares/7.2.143
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.