SMARCA5
SMARCA5 (англ. SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 052 амінокислот, а молекулярна маса — 121 905[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSSAAEPPPP | PPPESAPSKP | AASIASGGSN | SSNKGGPEGV | AAQAVASAAS | ||||
AGPADAEMEE | IFDDASPGKQ | KEIQEPDPTY | EEKMQTDRAN | RFEYLLKQTE | ||||
LFAHFIQPAA | QKTPTSPLKM | KPGRPRIKKD | EKQNLLSVGD | YRHRRTEQEE | ||||
DEELLTESSK | ATNVCTRFED | SPSYVKWGKL | RDYQVRGLNW | LISLYENGIN | ||||
GILADEMGLG | KTLQTISLLG | YMKHYRNIPG | PHMVLVPKST | LHNWMSEFKR | ||||
WVPTLRSVCL | IGDKEQRAAF | VRDVLLPGEW | DVCVTSYEML | IKEKSVFKKF | ||||
NWRYLVIDEA | HRIKNEKSKL | SEIVREFKTT | NRLLLTGTPL | QNNLHELWSL | ||||
LNFLLPDVFN | SADDFDSWFD | TNNCLGDQKL | VERLHMVLRP | FLLRRIKADV | ||||
EKSLPPKKEV | KIYVGLSKMQ | REWYTRILMK | DIDILNSAGK | MDKMRLLNIL | ||||
MQLRKCCNHP | YLFDGAEPGP | PYTTDMHLVT | NSGKMVVLDK | LLPKLKEQGS | ||||
RVLIFSQMTR | VLDILEDYCM | WRNYEYCRLD | GQTPHDERQD | SINAYNEPNS | ||||
TKFVFMLSTR | AGGLGINLAT | ADVVILYDSD | WNPQVDLQAM | DRAHRIGQTK | ||||
TVRVFRFITD | NTVEERIVER | AEMKLRLDSI | VIQQGRLVDQ | NLNKIGKDEM | ||||
LQMIRHGATH | VFASKESEIT | DEDIDGILER | GAKKTAEMNE | KLSKMGESSL | ||||
RNFTMDTESS | VYNFEGEDYR | EKQKIAFTEW | IEPPKRERKA | NYAVDAYFRE | ||||
ALRVSEPKAP | KAPRPPKQPN | VQDFQFFPPR | LFELLEKEIL | FYRKTIGYKV | ||||
PRNPELPNAA | QAQKEEQLKI | DEAESLNDEE | LEEKEKLLTQ | GFTNWNKRDF | ||||
NQFIKANEKW | GRDDIENIAR | EVEGKTPEEV | IEYSAVFWER | CNELQDIEKI | ||||
MAQIERGEAR | IQRRISIKKA | LDTKIGRYKA | PFHQLRISYG | TNKGKNYTEE | ||||
EDRFLICMLH | KLGFDKENVY | DELRQCIRNS | PQFRFDWFLK | SRTAMELQRR | ||||
CNTLITLIER | ENMELEEKEK | AEKKKRGPKP | STQKRKMDGA | PDGRGRKKKL | ||||
KL |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Aalfs J.D., Narlikar G.J., Kingston R.E. (2001). Functional differences between the human ATP-dependent nucleosome remodeling proteins BRG1 and SNF2H.. J. Biol. Chem. 276: 34270 — 34278. PubMed DOI:10.1074/jbc.M104163200
- Bozhenok L., Wade P.A., Varga-Weisz P. (2002). WSTF-ISWI chromatin remodeling complex targets heterochromatic replication foci.. EMBO J. 21: 2231 — 2241. PubMed DOI:10.1093/emboj/21.9.2231
- Dirscherl S.S., Krebs J.E. (2004). Functional diversity of ISWI complexes.. Biochem. Cell Biol. 82: 482 — 489. PubMed DOI:10.1139/o04-044
- Cavellan E., Asp P., Percipalle P., Oestlund Farrants A.-K. (2006). The WSTF-SNF2h chromatin remodeling complex interacts with several nuclear proteins in transcription.. J. Biol. Chem. 281: 16264 — 16271. PubMed DOI:10.1074/jbc.M600233200
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11101 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
- UniProt, O60264 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.