SMARCA5

SMARCA5 (англ. SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 052 амінокислот, а молекулярна маса — 121 905[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSSAAEPPPPPPPESAPSKPAASIASGGSNSSNKGGPEGVAAQAVASAAS
AGPADAEMEEIFDDASPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTE
LFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKDEKQNLLSVGDYRHRRTEQEE
DEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWLISLYENGIN
GILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKR
WVPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKF
NWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSL
LNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADV
EKSLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNIL
MQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGS
RVLIFSQMTRVLDILEDYCMWRNYEYCRLDGQTPHDERQDSINAYNEPNS
TKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQTK
TVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEM
LQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSL
RNFTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFRE
ALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILFYRKTIGYKV
PRNPELPNAAQAQKEEQLKIDEAESLNDEELEEKEKLLTQGFTNWNKRDF
NQFIKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKI
MAQIERGEARIQRRISIKKALDTKIGRYKAPFHQLRISYGTNKGKNYTEE
EDRFLICMLHKLGFDKENVYDELRQCIRNSPQFRFDWFLKSRTAMELQRR
CNTLITLIERENMELEEKEKAEKKKRGPKPSTQKRKMDGAPDGRGRKKKL
KL
SMARCA5
Ідентифікатори
Символи SMARCA5, ISWI, SNF2H, WCRF135, hISWI, hSNF2H, SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5
Зовнішні ІД OMIM: 603375 MGI: 1935129 HomoloGene: 55764 GeneCards: SMARCA5
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8467
93762
Ensembl
ENSG00000153147
ENSMUSG00000031715
UniProt
O60264
Q91ZW3
RefSeq (мРНК)
NM_003601
NM_053124
RefSeq (білок)
NP_003592
NP_444354
Локус (UCSC) Хр. 4: 143.51 – 143.56 Mb н/д
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Aalfs J.D., Narlikar G.J., Kingston R.E. (2001). Functional differences between the human ATP-dependent nucleosome remodeling proteins BRG1 and SNF2H.. J. Biol. Chem. 276: 34270 — 34278. PubMed DOI:10.1074/jbc.M104163200
  • Bozhenok L., Wade P.A., Varga-Weisz P. (2002). WSTF-ISWI chromatin remodeling complex targets heterochromatic replication foci.. EMBO J. 21: 2231 — 2241. PubMed DOI:10.1093/emboj/21.9.2231
  • Dirscherl S.S., Krebs J.E. (2004). Functional diversity of ISWI complexes.. Biochem. Cell Biol. 82: 482 — 489. PubMed DOI:10.1139/o04-044
  • Cavellan E., Asp P., Percipalle P., Oestlund Farrants A.-K. (2006). The WSTF-SNF2h chromatin remodeling complex interacts with several nuclear proteins in transcription.. J. Biol. Chem. 281: 16264 — 16271. PubMed DOI:10.1074/jbc.M600233200

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11101 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, O60264 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.