SND1

SND1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2E6N, 2HQE, 2HQX, 2O4X, 3BDL, 3OMC, 3OMG, 4QMG
Ідентифікатори
Символи	SND1, TDRD11, p100, staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1, Tudor-SN
Зовнішні ІД	OMIM: 602181 MGI: 1929266 HomoloGene: 8665 GeneCards: SND1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • GO:0001104 transcription coregulator activity; • nucleic acid binding; • nuclease activity; • RNA binding; • cadherin binding; • endonuclease activity; • endoribonuclease activity; • hydrolase activity; • RISC complex binding;
Клітинна компонента	• Меланосома; • RISC; • Екзосома; • мітохондрія; • мембрана; • dense body; • цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• Сайленсинг генів; • GO:0022415 viral process; • regulation of transcription, DNA-templated; • osteoblast differentiation; • transcription, DNA-templated; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • Деградація РНК; • regulation of cell cycle process; • miRNA catabolic process; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	27044
	56463
	ENSG00000197157
	ENSMUSG00000001424
	Q7KZF4
	Q78PY7
	NM_014390
	NM_019776
	NP_055205
	NP_062750
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SND1 (англ. Staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 910 амінокислот, а молекулярна маса — 101 997[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASSAQSGGS	SGGPAVPTVQ	RGIIKMVLSG	CAIIVRGQPR	GGPPPERQIN
LSNIRAGNLA	RRAAATQPDA	KDTPDEPWAF	PAREFLRKKL	IGKEVCFTIE
NKTPQGREYG	MIYLGKDTNG	ENIAESLVAE	GLATRREGMR	ANNPEQNRLS
ECEEQAKAAK	KGMWSEGNGS	HTIRDLKYTI	ENPRHFVDSH	HQKPVNAIIE
HVRDGSVVRA	LLLPDYYLVT	VMLSGIKCPT	FRREADGSET	PEPFAAEAKF
FTESRLLQRD	VQIILESCHN	QNILGTILHP	NGNITELLLK	EGFARCVDWS
IAVYTRGAEK	LRAAERFAKE	RRLRIWRDYV	APTANLDQKD	KQFVAKVMQV
LNADAIVVKL	NSGDYKTIHL	SSIRPPRLEG	ENTQDKNKKL	RPLYDIPYMF
EAREFLRKKL	IGKKVNVTVD	YIRPASPATE	TVPAFSERTC	ATVTIGGINI
AEALVSKGLA	TVIRYRQDDD	QRSSHYDELL	AAEARAIKNG	KGLHSKKEVP
IHRVADISGD	TQKAKQFLPF	LQRAGRSEAV	VEYVFSGSRL	KLYLPKETCL
ITFLLAGIEC	PRGARNLPGL	VQEGEPFSEE	ATLFTKELVL	QREVEVEVES
MDKAGNFIGW	LHIDGANLSV	LLVEHALSKV	HFTAERSSYY	KSLLSAEEAA
KQKKEKVWAH	YEEQPVEEVM	PVLEEKERSA	SYKPVFVTEI	TDDLHFYVQD
VETGTQLEKL	MENMRNDIAS	HPPVEGSYAP	RRGEFCIAKF	VDGEWYRARV
EKVESPAKIH	VFYIDYGNRE	VLPSTRLGTL	SPAFSTRVLP	AQATEYAFAF
IQVPQDDDAR	TDAVDSVVRD	IQNTQCLLNV	EHLSAGCPHV	TLQFADSKGD
VGLGLVKEGL	VMVEVRKEKQ	FQKVITEYLN	AQESAKSARL	NLWRYGDFRA
DDADEFGYSR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Tong X., Drapkin R., Yalamanchili R., Mosialos G., Kieff E. (1995). The Epstein-Barr virus nuclear protein 2 acidic domain forms a complex with a novel cellular coactivator that can interact with TFIIE.. Mol. Cell. Biol. 15: 4735 — 4744. PubMed DOI:10.1128/MCB.15.9.4735
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Tijms M.A., Snijder E.J. (2003). Equine arteritis virus non-structural protein 1, an essential factor for viral subgenomic mRNA synthesis, interacts with the cellular transcription co-factor p100.. J. Gen. Virol. 84: 2317 — 2322. PubMed DOI:10.1099/vir.0.19297-0

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30646 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.
UniProt, Q7KZF4 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 7

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30646 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q7KZF4 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.