SP3

SP3
Ідентифікатори
Символи	SP3, SPR2, Sp3 transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 601804 MGI: 1277166 HomoloGene: 7952 GeneCards: SP3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • chromatin binding; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948 protein binding; • nucleic acid binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • double-stranded DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• PML body; • transcription repressor complex; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • protein-DNA complex;
Біологічний процес	• megakaryocyte differentiation; • regulation of transcription, DNA-templated; • ossification; • lung development; • embryonic placenta development; • in utero embryonic development; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • monocyte differentiation; • protein sumoylation; • transcription, DNA-templated; • embryonic skeletal system development; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • embryonic process involved in female pregnancy; • T cell differentiation; • granulocyte differentiation; • embryonic camera-type eye morphogenesis; • trophectodermal cell differentiation; • enucleate erythrocyte differentiation; • erythrocyte differentiation; • definitive hemopoiesis; • liver development; • B cell differentiation; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • natural killer cell differentiation; • regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6670
	20687
	ENSG00000172845
	ENSMUSG00000027109
	Q02447; Q86TP0
	O70494
	NM_003111; NM_001017371; NM_001172712
	NM_001018042; NM_001098425; NM_011450
	NP_001017371; NP_001166183; NP_003102; NP_003102.1
	NP_001018052; NP_001091895
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SP3 (англ. Sp3 transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 781 амінокислот, а молекулярна маса — 81 925[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTAPEKPVKQ	EEMAALDVDS	GGGGGGGGGH	GEYLQQQQQH	GNGAVAAAAA
AQDTQPSPLA	LLAATCSKIG	PPSPGDDEEE	AAAAAGAPAA	AGATGDLASA
QLGGAPNRWE	VLSATPTTIK	DEAGNLVQIP	SAATSSGQYV	LPLQNLQNQQ
IFSVAPGSDS	SNGTVSSVQY	QVIPQIQSAD	GQQVQIGFTG	SSDNGGINQE
SSQIQIIPGS	NQTLLASGTP	SANIQNLIPQ	TGQVQVQGVA	IGGSSFPGQT
QVVANVPLGL	PGNITFVPIN	SVDLDSLGLS	GSSQTMTAGI	NADGHLINTG
QAMDSSDNSE	RTGERVSPDI	NETNTDTDLF	VPTSSSSQLP	VTIDSTGILQ
QNTNSLTTSS	GQVHSSDLQG	NYIQSPVSEE	TQAQNIQVST	AQPVVQHLQL
QESQQPTSQA	QIVQGITPQT	IHGVQASGQN	ISQQALQNLQ	LQLNPGTFLI
QAQTVTPSGQ	VTWQTFQVQG	VQNLQNLQIQ	NTAAQQITLT	PVQTLTLGQV
AAGGAFTSTP	VSLSTGQLPN	LQTVTVNSID	SAGIQLHPGE	NADSPADIRI
KEEEPDPEEW	QLSGDSTLNT	NDLTHLRVQV	VDEEGDQQHQ	EGKRLRRVAC
TCPNCKEGGG	RGTNLGKKKQ	HICHIPGCGK	VYGKTSHLRA	HLRWHSGERP
FVCNWMYCGK	RFTRSDELQR	HRRTHTGEKK	FVCPECSKRF	MRSDHLAKHI
KTHQNKKGIH	SSSTVLASVE	AARDDTLITA	GGTTLILANI	QQGSVSGIGT
VNTSATSNQD	ILTNTEIPLQ	LVTVSGNETM	E

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Hernandez E.M., Johnson A., Notario V., Chen A., Richert J.R. (2002). AUA as a translation initiation site in vitro for the human transcription factor Sp3.. J. Biochem. Mol. Biol. 35: 273 — 282. PubMed DOI:10.5483/BMBRep.2002.35.3.273
Moran K.M., Crusio R.H., Chan C.H., Grekova M.C., Richert J.R. (2004). Human transcription factor Sp3: genomic structure, identification of a processed pseudogene, and transcript analysis.. Gene 341: 235 — 247. PubMed DOI:10.1016/j.gene.2004.06.055
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Oleksiak M.F., Crawford D.L. (2002). 5' genomic structure of human Sp3.. Mol. Biol. Evol. 19: 2026 — 2029. PubMed DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a004026
Kingsley C., Winoto A. (1992). Cloning of GT box-binding proteins: a novel Sp1 multigene family regulating T-cell receptor gene expression.. Mol. Cell. Biol. 12: 4251 — 4261. PubMed DOI:10.1128/MCB.12.10.4251
Hagen G., Mueller S., Beato M., Suske G. (1992). Cloning by recognition site screening of two novel GT box binding proteins: a family of Sp1 related genes.. Nucleic Acids Res. 20: 5519 — 5525. PubMed DOI:10.1093/nar/20.21.5519

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11208 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, Q02447 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11208 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q02447 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.