SPEN
SPEN (англ. Spen family transcriptional repressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 664 амінокислот, а молекулярна маса — 402 248[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MVRETRHLWV | GNLPENVREE | KIIEHFKRYG | RVESVKILPK | RGSEGGVAAF | ||||
| VDFVDIKSAQ | KAHNSVNKMG | DRDLRTDYNE | PGTIPSAARG | LDDTVSIASR | ||||
| SREVSGFRGG | GGGPAYGPPP | SLHAREGRYE | RRLDGASDNR | ERAYEHSAYG | ||||
| HHERGTGGFD | RTRHYDQDYY | RDPRERTLQH | GLYYASRSRS | PNRFDAHDPR | ||||
| YEPRAREQFT | LPSVVHRDIY | RDDITREVRG | RRPERNYQHS | RSRSPHSSQS | ||||
| RNQSPQRLAS | QASRPTRSPS | GSGSRSRSSS | SDSISSSSST | SSDSSDSSSS | ||||
| SSDDSPARSV | QSAAVPAPTS | QLLSSLEKDE | PRKSFGIKVQ | NLPVRSTDTS | ||||
| LKDGLFHEFK | KFGKVTSVQI | HGTSEERYGL | VFFRQQEDQE | KALTASKGKL | ||||
| FFGMQIEVTA | WIGPETESEN | EFRPLDERID | EFHPKATRTL | FIGNLEKTTT | ||||
| YHDLRNIFQR | FGEIVDIDIK | KVNGVPQYAF | LQYCDIASVC | KAIKKMDGEY | ||||
| LGNNRLKLGF | GKSMPTNCVW | LDGLSSNVSD | QYLTRHFCRY | GPVVKVVFDR | ||||
| LKGMALVLYN | EIEYAQAAVK | ETKGRKIGGN | KIKVDFANRE | SQLAFYHCME | ||||
| KSGQDIRDFY | EMLAERREER | RASYDYNQDR | TYYESVRTPG | TYPEDSRRDY | ||||
| PARGREFYSE | WETYQGDYYE | SRYYDDPREY | RDYRNDPYEQ | DIREYSYRQR | ||||
| ERERERERFE | SDRDRDHERR | PIERSQSPVH | LRRPQSPGAS | PSQAERLPSD | ||||
| SERRLYSRSS | DRSGSCSSLS | PPRYEKLDKS | RLERYTKNEK | TDKERTFDPE | ||||
| RVERERRLIR | KEKVEKDKTD | KQKRKGKVHS | PSSQSSETDQ | ENEREQSPEK | ||||
| PRSCNKLSRE | KADKEGIAKN | RLELMPCVVL | TRVKEKEGKV | IDHTPVEKLK | ||||
| AKLDNDTVKS | SALDQKLQVS | QTEPAKSDLS | KLESVRMKVP | KEKGLSSHVE | ||||
| VVEKEGRLKA | RKHLKPEQPA | DGVSAVDLEK | LEARKRRFAD | SNLKAEKQKP | ||||
| EVKKSSPEME | DARVLSKKQP | DVSSREVILL | REGEAERKPV | RKEILKRESK | ||||
| KIKLDRLNTV | ASPKDCQELA | SISVGSGSRP | SSDLQARLGE | LAGESVENQE | ||||
| VQSKKPIPSK | PQLKQLQVLD | DQGPEREDVR | KNYCSLRDET | PERKSGQEKS | ||||
| HSVNTEEKIG | IDIDHTQSYR | KQMEQSRRKQ | QMEMEIAKSE | KFGSPKKDVD | ||||
| EYERRSLVHE | VGKPPQDVTD | DSPPSKKKRM | DHVDFDICTK | RERNYRSSRQ | ||||
| ISEDSERTGG | SPSVRHGSFH | EDEDPIGSPR | LLSVKGSPKV | DEKVLPYSNI | ||||
| TVREESLKFN | PYDSSRREQM | ADMAKIKLSV | LNSEDELNRW | DSQMKQDAGR | ||||
| FDVSFPNSII | KRDSLRKRSV | RDLEPGEVPS | DSDEDGEHKS | HSPRASALYE | ||||
| SSRLSFLLRD | REDKLRERDE | RLSSSLERNK | FYSFALDKTI | TPDTKALLER | ||||
| AKSLSSSREE | NWSFLDWDSR | FANFRNNKDK | EKVDSAPRPI | PSWYMKKKKI | ||||
| RTDSEGKMDD | KKEDHKEEEQ | ERQELFASRF | LHSSIFEQDS | KRLQHLERKE | ||||
| EDSDFISGRI | YGKQTSEGAN | STTDSIQEPV | VLFHSRFMEL | TRMQQKEKEK | ||||
| DQKPKEVEKQ | EDTENHPKTP | ESAPENKDSE | LKTPPSVGPP | SVTVVTLESA | ||||
| PSALEKTTGD | KTVEAPLVTE | EKTVEPATVS | EEAKPASEPA | PAPVEQLEQV | ||||
| DLPPGADPDK | EAAMMPAGVE | EGSSGDQPPY | LDAKPPTPGA | SFSQAESNVD | ||||
| PEPDSTQPLS | KPAQKSEEAN | EPKAEKPDAT | ADAEPDANQK | AEAAPESQPP | ||||
| ASEDLEVDPP | VAAKDKKPNK | SKRSKTPVQA | AAVSIVEKPV | TRKSERIDRE | ||||
| KLKRSNSPRG | EAQKLLELKM | EAEKITRTAS | KNSAADLEHP | EPSLPLSRTR | ||||
| RRNVRSVYAT | MGDHENRSPV | KEPVEQPRVT | RKRLERELQE | AAAVPTTPRR | ||||
| GRPPKTRRRA | DEEEENEAKE | PAETLKPPEG | WRSPRSQKTA | AGGGPQGKKG | ||||
| KNEPKVDATR | PEATTEVGPQ | IGVKESSMEP | KAAEEEAGSE | QKRDRKDAGT | ||||
| DKNPPETAPV | EVVEKKPAPE | KNSKSKRGRS | RNSRLAVDKS | ASLKNVDAAV | ||||
| SPRGAAAQAG | ERESGVVAVS | PEKSESPQKE | DGLSSQLKSD | PVDPDKEPEK | ||||
| EDVSASGPSP | EATQLAKQME | LEQAVEHIAK | LAEASASAAY | KADAPEGLAP | ||||
| EDRDKPAHQA | SETELAAAIG | SIINDISGEP | ENFPAPPPYP | GESQTDLQPP | ||||
| AGAQALQPSE | EGMETDEAVS | GILETEAATE | SSRPPVNAPD | PSAGPTDTKE | ||||
| ARGNSSETSH | SVPEAKGSKE | VEVTLVRKDK | GRQKTTRSRR | KRNTNKKVVA | ||||
| PVESHVPESN | QAQGESPAAN | EGTTVQHPEA | PQEEKQSEKP | HSTPPQSCTS | ||||
| DLSKIPSTEN | SSQEISVEER | TPTKASVPPD | LPPPPQPAPV | DEEPQARFRV | ||||
| HSIIESDPVT | PPSDPSIPIP | TLPSVTAAKL | SPPVASGGIP | HQSPPTKVTE | ||||
| WITRQEEPRA | QSTPSPALPP | DTKASDVDTS | SSTLRKILMD | PKYVSATSVT | ||||
| STSVTTAIAE | PVSAAPCLHE | APPPPVDSKK | PLEEKTAPPV | TNNSEIQASE | ||||
| VLVAADKEKV | APVIAPKITS | VISRMPVSID | LENSQKITLA | KPAPQTLTGL | ||||
| VSALTGLVNV | SLVPVNALKG | PVKGSVTTLK | SLVSTPAGPV | NVLKGPVNVL | ||||
| TGPVNVLTTP | VNATVGTVNA | APGTVNAAAS | AVNATASAVT | VTAGAVTAAS | ||||
| GGVTATTGTV | TMAGAVIAPS | TKCKQRASAN | ENSRFHPGSM | PVIDDRPADA | ||||
| GSGAGLRVNT | SEGVVLLSYS | GQKTEGPQRI | SAKISQIPPA | SAMDIEFQQS | ||||
| VSKSQVKPDS | VTASQPPSKG | PQAPAGYANV | ATHSTLVLTA | QTYNASPVIS | ||||
| SVKADRPSLE | KPEPIHLSVS | TPVTQGGTVK | VLTQGINTPP | VLVHNQLVLT | ||||
| PSIVTTNKKL | ADPVTLKIET | KVLQPANLGS | TLTPHHPPAL | PSKLPTEVNH | ||||
| VPSGPSIPAD | RTVSHLAAAK | LDAHSPRPSG | PGPSSFPRAS | HPSSTASTAL | ||||
| STNATVMLAA | GIPVPQFISS | IHPEQSVIMP | PHSITQTVSL | SHLSQGEVRM | ||||
| NTPTLPSITY | SIRPEALHSP | RAPLQPQQIE | VRAPQRASTP | QPAPAGVPAL | ||||
| ASQHPPEEEV | HYHLPVARAT | APVQSEVLVM | QSEYRLHPYT | VPRDVRIMVH | ||||
| PHVTAVSEQP | RAADGVVKVP | PASKAPQQPG | KEAAKTPDAK | AAPTPTPAPV | ||||
| PVPVPLPAPA | PAPHGEARIL | TVTPSNQLQG | LPLTPPVVVT | HGVQIVHSSG | ||||
| ELFQEYRYGD | IRTYHPPAQL | THTQFPAASS | VGLPSRTKTA | AQGPPPEGEP | ||||
| LQPPQPVQST | QPAQPAPPCP | PSQLGQPGQP | PSSKMPQVSQ | EAKGTQTGVE | ||||
| QPRLPAGPAN | RPPEPHTQVQ | RAQAETGPTS | FPSPVSVSMK | PDLPVSLPTQ | ||||
| TAPKQPLFVP | TTSGPSTPPG | LVLPHTEFQP | APKQDSSPHL | TSQRPVDMVQ | ||||
| LLKKYPIVWQ | GLLALKNDTA | AVQLHFVSGN | NVLAHRSLPL | SEGGPPLRIA | ||||
| QRMRLEATQL | EGVARRMTVE | TDYCLLLALP | CGRDQEDVVS | QTESLKAAFI | ||||
| TYLQAKQAAG | IINVPNPGSN | QPAYVLQIFP | PCEFSESHLS | RLAPDLLASI | ||||
| SNISPHLMIV | IASV |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Shi Y., Hon M., Evans R.M. (2002). The peroxisome proliferator-activated receptor delta, an integrator of transcriptional repression and nuclear receptor signaling.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 2613 — 2618. PubMed DOI:10.1073/pnas.052707099
- Ariyoshi M., Schwabe J.W.R. (2003). A conserved structural motif reveals the essential transcriptional repression function of Spen proteins and their role in developmental signaling.. Genes Dev. 17: 1909 — 1920. PubMed DOI:10.1101/gad.266203
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17575 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
- UniProt, Q96T58 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.