SPON1

SPON1 (англ. Spondin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 807 амінокислот, а молекулярна маса — 90 973[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRLSPAPLKLSRTPALLALALPLAAALAFSDETLDKVPKSEGYCSRILRA
QGTRREGYTEFSLRVEGDPDFYKPGTSYRVTLSAAPPSYFRGFTLIALRE
NREGDKEEDHAGTFQIIDEEETQFMSNCPVAVTESTPRRRTRIQVFWIAP
PAGTGCVILKASIVQKRIIYFQDEGSLTKKLCEQDSTFDGVTDKPILDCC
ACGTAKYRLTFYGNWSEKTHPKDYPRRANHWSAIIGGSHSKNYVLWEYGG
YASEGVKQVAELGSPVKMEEEIRQQSDEVLTVIKAKAQWPAWQPLNVRAA
PSAEFSVDRTRHLMSFLTMMGPSPDWNVGLSAEDLCTKECGWVQKVVQDL
IPWDAGTDSGVTYESPNKPTIPQEKIRPLTSLDHPQSPFYDPEGGSITQV
ARVVIERIARKGEQCNIVPDNVDDIVADLAPEEKDEDDTPETCIYSNWSP
WSACSSSTCDKGKRMRQRMLKAQLDLSVPCPDTQDFQPCMGPGCSDEDGS
TCTMSEWITWSPCSISCGMGMRSRERYVKQFPEDGSVCTLPTEETEKCTV
NEECSPSSCLMTEWGEWDECSATCGMGMKKRHRMIKMNPADGSMCKAETS
QAEKCMMPECHTIPCLLSPWSEWSDCSVTCGKGMRTRQRMLKSLAELGDC
NEDLEQVEKCMLPECPIDCELTEWSQWSECNKSCGKGHVIRTRMIQMEPQ
FGGAPCPETVQRKKCRIRKCLRNPSIQKLRWREARESRRSEQLKEESEGE
QFPGCRMRPWTAWSECTKLCGGGIQERYMTVKKRFKSSQFTSCKDKKEIR
ACNVHPC
SPON1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SPON1, VSGP/F-spondin, f-spondin, Spondin 1
Зовнішні ІД OMIM: 604989 MGI: 2385287 HomoloGene: 4453 GeneCards: SPON1
Пов'язані генетичні захворювання
туберкульоз[1]
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10418
233744
Ensembl
ENSG00000262655
ENSMUSG00000038156
UniProt
Q9HCB6
Q8VCC9
RefSeq (мРНК)
NM_006108
NM_145584
RefSeq (білок)
NP_006099
NP_663559
Локус (UCSC) Хр. 11: 13.96 – 14.27 Mb Хр. 7: 113.77 – 114.04 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Tan K., Duquette M., Liu J.H., Lawler J., Wang J.H. (2008). The crystal structure of the heparin-binding reelin-N domain of f-spondin.. J. Mol. Biol. 381: 1213 — 1223. PubMed DOI:10.1016/j.jmb.2008.06.045
  • Tan K., Lawler J. (2011). The structure of the Ca+-binding, glycosylated F-spondin domain of F-spondin - A C2-domain variant in an extracellular matrix protein.. BMC Struct. Biol. 11: 22 — 22. PubMed DOI:10.1186/1472-6807-11-22

Примітки
  1. Захворювання, генетично пов'язані з SPON1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11252 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
  5. UniProt, Q9HCB6 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.