SPP1

SPP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3CXD, 3DSF
Ідентифікатори
Символи	SPP1, BNSP, BSPI, ETA-1, OPN, secreted phosphoprotein 1, Osteopontin
Зовнішні ІД	OMIM: 166490 MGI: 98389 HomoloGene: 20156 GeneCards: SPP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity; • GO:0001948 protein binding; • extracellular matrix binding;
Клітинна компонента	• cell projection; • extracellular region; • perinuclear region of cytoplasm; • Екзосома; • extracellular space; • комплекс Ґольджі; • везикула; • endoplasmic reticulum lumen;
Біологічний процес	• Диференціація клітин; • response to vitamin D; • ossification; • biomineral tissue development; • response to steroid hormone; • extracellular matrix disassembly; • extracellular matrix organization; • response to organic substance; • negative regulation of collateral sprouting of intact axon in response to injury; • decidualization; • inflammatory response; • embryo implantation; • osteoblast differentiation; • positive regulation of bone resorption; • Адгезія клітин; • androgen catabolic process; • посттрансляційна модифікація; • cellular protein metabolic process; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to testosterone stimulus; • positive regulation of estradiol secretion; • regulation of signaling receptor activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6696
	20750
	ENSG00000118785
	ENSMUSG00000029304
	P10451
	P10923
	NM_001251830; NM_000582; NM_001040058; NM_001040060; NM_001251829
	NM_001204201; NM_001204202; NM_001204203; NM_001204233; NM_009263
NP_000573; NP_001035147; NP_001035149; NP_001238758; NP_001238759;
	NP_001035147.1
	NP_001191130; NP_001191131; NP_001191132; NP_001191162; NP_033289
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SPP1 (англ. Secreted phosphoprotein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 314 амінокислот, а молекулярна маса — 35 423[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRIAVICFCL	LGITCAIPVK	QADSGSSEEK	QLYNKYPDAV	ATWLNPDPSQ
KQNLLAPQNA	VSSEETNDFK	QETLPSKSNE	SHDHMDDMDD	EDDDDHVDSQ
DSIDSNDSDD	VDDTDDSHQS	DESHHSDESD	ELVTDFPTDL	PATEVFTPVV
PTVDTYDGRG	DSVVYGLRSK	SKKFRRPDIQ	YPDATDEDIT	SHMESEELNG
AYKAIPVAQD	LNAPSDWDSR	GKDSYETSQL	DDQSAETHSH	KQSRLYKRKA
NDESNEHSDV	IDSQELSKVS	REFHSHEFHS	HEDMLVVDPK	SKEEDKHLKF
RISHELDSAS	SEVN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Секретований назовні.

Література

Kiefer M.C., Bauer D.M., Barr P.J. (1989). The cDNA and derived amino acid sequence for human osteopontin.. Nucleic Acids Res. 17: 3306 — 3306. PubMed DOI:10.1093/nar/17.8.3306
Crosby A.H., Edwards S.J., Murray J.C., Dixon M.J. (1995). Genomic organization of the human osteopontin gene: exclusion of the locus from a causative role in the pathogenesis of dentinogenesis imperfecta type II.. Genomics 27: 155 — 160. PubMed DOI:10.1006/geno.1995.1018
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Senger D.R., Perruzzi C.A., Papadopoulos A., Tenen D.G. (1989). Purification of a human milk protein closely similar to tumor-secreted phosphoproteins and osteopontin.. Biochim. Biophys. Acta 996: 43 — 48. PubMed DOI:10.1016/0167-4838(89)90092-7
Christensen B., Nielsen M.S., Haselmann K.F., Petersen T.E., Sorensen E.S. (2005). Post-translationally modified residues of native human osteopontin are located in clusters: identification of 36 phosphorylation and five O-glycosylation sites and their biological implications.. Biochem. J. 390: 285 — 292. PubMed DOI:10.1042/BJ20050341
Beranova-Giorgianni S., Zhao Y., Desiderio D.M., Giorgianni F. (2006). Phosphoproteomic analysis of the human pituitary.. Pituitary 9: 109 — 120. PubMed DOI:10.1007/s11102-006-8916-x

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11255 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P10451 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11255 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P10451 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.