SRF

SRF
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1HBX, 1K6O, 1SRS
Ідентифікатори
Символи	SRF, MCM1, serum response factor
Зовнішні ІД	OMIM: 600589 MGI: 106658 HomoloGene: 31135 GeneCards: SRF
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein dimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity; • primary miRNA binding; • transcription factor binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • protein homodimerization activity; • serum response element binding; • chromatin binding; • GO:0001948 protein binding; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • chromatin DNA binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • histone deacetylase binding; • RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• dorsal aorta morphogenesis; • bronchus cartilage development; • muscle cell cellular homeostasis; • lung smooth muscle development; • regulation of water loss via skin; • transcription by RNA polymerase II; • stress fiber assembly; • cell migration involved in sprouting angiogenesis; • platelet activation; • cardiac myofibril assembly; • heart looping; • клітинне старіння; • face development; • regulation of cell adhesion; • long-term synaptic depression; • neuron projection development; • morphogenesis of an epithelial sheet; • positive regulation of filopodium assembly; • primitive streak formation; • cellular response to glucose stimulus; • negative regulation of cell population proliferation; • response to cytokine; • regulation of transcription, DNA-templated; • heart trabecula formation; • actin filament organization; • thymus development; • angiogenesis involved in wound healing; • Тромбоцитопоез; • neuron development; • in utero embryonic development; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • heart development; • positive regulation of cell differentiation; • branching involved in blood vessel morphogenesis; • positive regulation of axon extension; • positive regulation of smooth muscle contraction; • trachea cartilage development; • response to toxic substance; • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of transcription by glucose; • regulation of smooth muscle cell differentiation; • epithelial structure maintenance; • associative learning; • skin morphogenesis; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • epithelial cell-cell adhesion; • neuron migration; • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • eyelid development in camera-type eye; • thyroid gland development; • negative regulation of amyloid-beta clearance; • negative regulation of cell migration; • developmental growth; • hematopoietic stem cell differentiation; • Гаструляція; • trophectodermal cell differentiation; • positive thymic T cell selection; • response to hormone; • cell-matrix adhesion; • sarcomere organization; • actin cytoskeleton organization; • megakaryocyte development; • response to hypoxia; • positive regulation of transcription via serum response element binding; • lung morphogenesis; • mesoderm formation; • cardiac vascular smooth muscle cell differentiation; • mRNA transcription by RNA polymerase II; • multicellular organism development; • tangential migration from the subventricular zone to the olfactory bulb; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in myocardial precursor cell differentiation; • Довготривала пам'ять; • contractile actin filament bundle assembly; • bicellular tight junction assembly; • leukocyte differentiation; • hippocampus development; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • erythrocyte development; • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; • forebrain development; • cell-cell adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6722
	20807
	ENSG00000112658
	ENSMUSG00000015605
	P11831
	Q9JM73
	NM_003131; NM_001292001
	NM_020493
	NP_001278930; NP_003122; NP_003122.1
	NP_065239
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SRF (англ. Serum response factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 51 593[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLPTQAGAAA	ALGRGSALGG	SLNRTPTGRP	GGGGGTRGAN	GGRVPGNGAG
LGPGRLEREA	AAAAATTPAP	TAGALYSGSE	GDSESGEEEE	LGAERRGLKR
SLSEMEIGMV	VGGPEASAAA	TGGYGPVSGA	VSGAKPGKKT	RGRVKIKMEF
IDNKLRRYTT	FSKRKTGIMK	KAYELSTLTG	TQVLLLVASE	TGHVYTFATR
KLQPMITSET	GKALIQTCLN	SPDSPPRSDP	TTDQRMSATG	FEETDLTYQV
SESDSSGETK	DTLKPAFTVT	NLPGTTSTIQ	TAPSTSTTMQ	VSSGPSFPIT
NYLAPVSASV	SPSAVSSANG	TVLKSTGSGP	VSSGGLMQLP	TSFTLMPGGA
VAQQVPVQAI	QVHQAPQQAS	PSRDSSTDLT	QTSSSGTVTL	PATIMTSSVP
TTVGGHMMYP	SPHAVMYAPT	SGLGDGSLTV	LNAFSQAPST	MQVSHSQVQE
PGGVPQVFLT	ASSGTVQIPV	SAVQLHQMAV	IGQQAGSSSN	LTELQVVNLD
TAHSTKSE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі. Бере участь у проліферації клітин до гладенько-м'язових в асоціації з міокардином.[5]

Література

Norman C., Runswick M., Pollock R., Treisman R. (1988). Isolation and properties of cDNA clones encoding SRF, a transcription factor that binds to the c-fos serum response element.. Cell 55: 989 — 1003. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(88)90244-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Janknecht R., Ernst W.H., Houthaeve T., Nordheim A. (1993). C-terminal phosphorylation of the serum-response factor.. Eur. J. Biochem. 216: 469 — 475. PubMed DOI:10.1111/j.1432-1033.1993.tb18165.x
Liu Z.-P., Wang Z., Yanagisawa H., Olson E.N. (2005). Phenotypic modulation of smooth muscle cells through interaction of Foxo4 and myocardin.. Dev. Cell 9: 261 — 270. PubMed DOI:10.1016/j.devcel.2005.05.017
Sundberg-Smith L.J., DiMichele L.A., Sayers R.L., Mack C.P., Taylor J.M. (2008). The LIM protein leupaxin is enriched in smooth muscle and functions as an serum response factor cofactor to induce smooth muscle cell gene transcription.. Circ. Res. 102: 1502 — 1511. PubMed DOI:10.1161/CIRCRESAHA.107.170357
Shi N., Guo X., Chen S.Y. (2014). Olfactomedin 2, a novel regulator for transforming growth factor-beta-induced smooth muscle differentiation of human embryonic stem cell-derived mesenchymal cells.. Mol. Biol. Cell 25: 4106 — 4114. PubMed DOI:10.1091/mbc.E14-08-1255

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11291 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P11831 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
Du, Kevin L.; Ip, Hon S.; Li, Jian; Chen, Mary; Dandre, Frederic; Yu, William; Lu, Min Min; Owens, Gary K. та ін. (2003-4). Myocardin Is a Critical Serum Response Factor Cofactor in the Transcriptional Program Regulating Smooth Muscle Cell Differentiation. Molecular and Cellular Biology 23 (7). с. 2425–2437. ISSN 0270-7306. PMID 12640126. doi:10.1128/MCB.23.7.2425-2437.2003. Процитовано 21 грудня 2018.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11291 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P11831 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[5] Du, Kevin L.; Ip, Hon S.; Li, Jian; Chen, Mary; Dandre, Frederic; Yu, William; Lu, Min Min; Owens, Gary K. та ін. (2003-4). Myocardin Is a Critical Serum Response Factor Cofactor in the Transcriptional Program Regulating Smooth Muscle Cell Differentiation. Molecular and Cellular Biology 23 (7). с. 2425–2437. ISSN 0270-7306. PMID 12640126. doi:10.1128/MCB.23.7.2425-2437.2003. Процитовано 21 грудня 2018.