SRI

SRI
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1JUO, 2JC2, 4U8D, 4UPG, 4USL
Ідентифікатори
Символи	SRI, CP-22, CP22, SCN, V19, sorcin
Зовнішні ІД	OMIM: 182520 MGI: 98419 HomoloGene: 37736 GeneCards: SRI
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • transmembrane transporter binding; • calcium channel regulator activity; • зв'язування з іоном металу; • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity; • protease binding; • GO:0001948 protein binding; • protein heterodimerization activity; • identical protein binding; • signaling receptor binding;
Клітинна компонента	• axon terminus; • dendritic spine neck; • везикула; • гіалоплазма; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • T-tubule; • клітинна мембрана; • внутрішньоклітинний; • sarcoplasmic reticulum; • Нуклеоплазма; • smooth endoplasmic reticulum; • Аксон; • chromaffin granule membrane; • Z disc; • мітохондрія; • sarcoplasmic reticulum membrane; • Екзосома; • цитоплазма;
Біологічний процес	• regulation of calcium ion transport; • regulation of heart contraction; • cytoplasmic sequestering of transcription factor; • muscle organ development; • positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol; • negative regulation of heart rate; • Протеоліз; • negative regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity; • regulation of cardiac muscle cell contraction; • heart development; • intracellular sequestering of iron ion; • regulation of striated muscle contraction; • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding; • regulation of high voltage-gated calcium channel activity; • Потенціал дії; • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; • regulation of cell communication by electrical coupling; • regulation of cell communication by electrical coupling involved in cardiac conduction; • regulation of relaxation of muscle; • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum; • calcium ion transport; • Сигнальна трансдукція; • negative regulation of cardiac muscle contraction; • транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6717
	109552
	ENSG00000075142
	ENSMUSG00000003161
	P30626
	Q6P069
	NM_001256891; NM_001256892; NM_003130; NM_198901
	NM_001080974; NM_025618
	NP_001243820; NP_001243821; NP_003121; NP_944490
	NP_001074443; NP_079894
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SRI (англ. Sorcin) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 198 амінокислот, а молекулярна маса — 21 676[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAYPGHPGAG	GGYYPGGYGG	APGGPAFPGQ	TQDPLYGYFA	AVAGQDGQID
ADELQRCLTQ	SGIAGGYKPF	NLETCRLMVS	MLDRDMSGTM	GFNEFKELWA
VLNGWRQHFI	SFDTDRSGTV	DPQELQKALT	TMGFRLSPQA	VNSIAKRYST
NGKITFDDYI	ACCVKLRALT	DSFRRRDTAQ	QGVVNFPYDD	FIQCVMSV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

Wang S.L., Tam M.F., Ho Y.S., Pai S.H., Kao M.C. (1995). Isolation and molecular cloning of human sorcin a calcium-binding protein in vincristine-resistant HOB1 lymphoma cells.. Biochim. Biophys. Acta 1260: 285 — 293. PubMed DOI:10.1016/0167-4781(94)00206-I
Lee W.P. (1996). Purification, cDNA cloning, and expression of human sorcin in vincristine-resistant HOB1 lymphoma cell lines.. Arch. Biochem. Biophys. 325: 217 — 226. PubMed DOI:10.1006/abbi.1996.0027
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Hansen C., Tarabykina S., la Cour J.M., Lollike K., Berchtold M.W. (2003). The PEF family proteins sorcin and grancalcin interact in vivo and in vitro.. FEBS Lett. 545: 151 — 154. PubMed DOI:10.1016/S0014-5793(03)00518-0
Xie X., Dwyer M.D., Swenson L., Parker M.H., Botfield M.C. (2001). Crystal structure of calcium-free human sorcin: a member of the penta-EF-hand protein family.. Protein Sci. 10: 2419 — 2425. PubMed DOI:10.1110/ps.36701

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11292 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, P30626 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11292 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P30626 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.