STAT1

STAT1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3WWT, 1BF5, 1YVL, 2KA6
Ідентифікатори
Символи	STAT1, CANDF7, IMD31A, IMD31B, IMD31C, ISGF-3, STAT91, signal transducer and activator of transcription 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600555 MGI: 103063 HomoloGene: 21428 GeneCards: STAT1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • protein homodimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity; • signal transducer activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948 protein binding; • identical protein binding; • enzyme binding; • tumor necrosis factor receptor binding; • double-stranded DNA binding; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • cadherin binding; • histone acetyltransferase binding; • histone binding; • ubiquitin-like protein ligase binding; • promoter-specific chromatin binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding; • CCR5 chemokine receptor binding; • protein phosphatase 2A binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Нуклеоплазма; • Ядерце; • perinuclear region of cytoplasm; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • Аксон; • Дендрит (нейробіологія); • protein-containing complex;
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process; • metanephric mesenchymal cell proliferation involved in metanephros development; • regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to interferon-beta; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis; • metanephric mesenchymal cell differentiation; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • renal tubule development; • response to interferon-beta; • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of endothelial cell proliferation; • regulation of type I interferon-mediated signaling pathway; • regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway; • positive regulation of mesenchymal cell proliferation; • negative regulation of metanephric nephron tubule epithelial cell differentiation; • negative regulation of angiogenesis; • negative regulation by virus of viral protein levels in host cell; • GO:0022415 viral process; • endothelial cell migration; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • Сигнальна трансдукція; • macrophage derived foam cell differentiation; • positive regulation of erythrocyte differentiation; • type I interferon signaling pathway; • cellular response to interferon-gamma; • positive regulation of defense response to virus by host; • positive regulation of interferon-alpha production; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • defense response to virus; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • receptor signaling pathway via JAK-STAT; • response to nutrient; • кровообіг; • positive regulation of cell population proliferation; • response to mechanical stimulus; • response to organic cyclic compound; • cellular response to insulin stimulus; • response to cytokine; • response to hydrogen peroxide; • response to peptide hormone; • positive regulation of smooth muscle cell proliferation; • response to cAMP; • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process; • cellular response to cytokine stimulus; • cellular response to organic cyclic compound; • positive regulation of transcription of Notch receptor target; • cytokine-mediated signaling pathway; • interleukin-21-mediated signaling pathway; • interleukin-6-mediated signaling pathway; • interleukin-27-mediated signaling pathway; • interleukin-35-mediated signaling pathway; • interleukin-9-mediated signaling pathway; • defense response; • regulation of cell population proliferation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6772
	20846
	ENSG00000115415
	ENSMUSG00000026104
	P42224
	P42225
	NM_007315; NM_139266
	NM_001205313; NM_001205314; NM_009283; NM_001357627
	NP_009330; NP_644671
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

STAT1 (англ. Signal transducer and activator of transcription 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 750 амінокислот, а молекулярна маса — 87 335[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSQWYELQQL	DSKFLEQVHQ	LYDDSFPMEI	RQYLAQWLEK	QDWEHAANDV
SFATIRFHDL	LSQLDDQYSR	FSLENNFLLQ	HNIRKSKRNL	QDNFQEDPIQ
MSMIIYSCLK	EERKILENAQ	RFNQAQSGNI	QSTVMLDKQK	ELDSKVRNVK
DKVMCIEHEI	KSLEDLQDEY	DFKCKTLQNR	EHETNGVAKS	DQKQEQLLLK
KMYLMLDNKR	KEVVHKIIEL	LNVTELTQNA	LINDELVEWK	RRQQSACIGG
PPNACLDQLQ	NWFTIVAESL	QQVRQQLKKL	EELEQKYTYE	HDPITKNKQV
LWDRTFSLFQ	QLIQSSFVVE	RQPCMPTHPQ	RPLVLKTGVQ	FTVKLRLLVK
LQELNYNLKV	KVLFDKDVNE	RNTVKGFRKF	NILGTHTKVM	NMEESTNGSL
AAEFRHLQLK	EQKNAGTRTN	EGPLIVTEEL	HSLSFETQLC	QPGLVIDLET
TSLPVVVISN	VSQLPSGWAS	ILWYNMLVAE	PRNLSFFLTP	PCARWAQLSE
VLSWQFSSVT	KRGLNVDQLN	MLGEKLLGPN	ASPDGLIPWT	RFCKENINDK
NFPFWLWIES	ILELIKKHLL	PLWNDGCIMG	FISKERERAL	LKDQQPGTFL
LRFSESSREG	AITFTWVERS	QNGGEPDFHA	VEPYTKKELS	AVTFPDIIRN
YKVMAAENIP	ENPLKYLYPN	IDKDHAFGKY	YSRPKEAPEP	MELDGPKGTG
YIKTELISVS	EVHPSRLQTT	DNLLPMSPEE	FDEVSRIVGS	VEFDSMMNTV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, антивірусний захист, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Schindler C., Fu X.-Y., Improta T., Aebersold R., Darnell J.E. Jr. (1992). Proteins of transcription factor ISGF-3: one gene encodes the 91- and 84-kDa ISGF-3 proteins that are activated by interferon alpha.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 7836 — 7839. PubMed DOI:10.1073/pnas.89.16.7836
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Yan R., Qureshi S., Zhong Z., Wen Z., Darnell J.E. Jr. (1995). The genomic structure of the STAT genes: multiple exons in coincident sites in Stat1 and Stat2.. Nucleic Acids Res. 23: 459 — 463. PubMed DOI:10.1093/nar/23.3.459
Fu X.Y. (1992). A transcription factor with SH2 and SH3 domains is directly activated by an interferon alpha-induced cytoplasmic protein tyrosine kinase(s).. Cell 70: 323 — 335. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(92)90106-M
Wen Z., Zhong Z., Darnell J.E. Jr. (1995). Maximal activation of transcription by Stat1 and Stat3 requires both tyrosine and serine phosphorylation.. Cell 82: 241 — 250. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(95)90311-9
Li X., Leung S., Kerr I.M., Stark G.R. (1997). Functional subdomains of STAT2 required for preassociation with the alpha interferon receptor and for signaling.. Mol. Cell. Biol. 17: 2048 — 2056. PubMed DOI:10.1128/MCB.17.4.2048

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11362 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, P42224 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11362 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P42224 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.