SUMO1

SUMO1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4WJQ, 1A5R, 1TGZ, 1WYW, 1Y8R, 1Z5S, 2ASQ, 2BF8, 2G4D, 2IO2, 2IY0, 2IY1, 2KQS, 2LAS, 2MW5, 2PE6, 2UYZ, 2VRR, 3KYC, 3KYD, 3RZW, 3UIP, 4WJN, 4WJO, 4WJP, 5AEK, 2N1V, 2N1A
Ідентифікатори
Символи	SUMO1, DAP1, GMP1, OFC10, PIC1, SENP2, SMT3, SMT3C, SMT3H3, UBL1, small ubiquitin-like modifier 1, small ubiquitin like modifier 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601912 MGI: 1197010 HomoloGene: 2514 GeneCards: SUMO1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transcription factor binding; • potassium channel regulator activity; • GO:0001948 protein binding; • protein tag; • ubiquitin protein ligase binding; • RNA binding; • transcription corepressor binding; • protein C-terminus binding; • SUMO transferase activity; • enzyme binding; • protein-macromolecule adaptor activity; • glucocorticoid receptor binding; • small protein activating enzyme binding; • ubiquitin-like protein ligase binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • PML body; • nuclear speck; • Ядерні тільця; • Ядерна мембрана; • мембрана; • voltage-gated potassium channel complex; • клітинна мембрана; • Синапс; • Ядерна пора; • Нуклеоплазма; • Гетерохроматин; • XY body; • Дендрит (нейробіологія); • Ядерце; • fibrillar center; • клітинне ядро; • nuclear stress granule; • SUMO activating enzyme complex; • nuclear envelope; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• roof of mouth development; • regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of protein stability; • positive regulation of protein-containing complex assembly; • protein localization to nuclear pore; • protein stabilization; • negative regulation of action potential; • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; • regulation of protein localization; • regulation of cardiac muscle cell contraction; • global genome nucleotide-excision repair; • PML body organization; • regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway; • GO:0022415 viral process; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • double-strand break repair via nonhomologous end joining; • regulation of calcium ion transmembrane transport; • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • negative regulation of delayed rectifier potassium channel activity; • positive regulation of ATPase-coupled calcium transmembrane transporter activity; • Репарація ДНК; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • cellular response to heat; • cellular response to cadmium ion; • protein sumoylation; • negative regulation of DNA binding;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7341
	22218
	ENSG00000116030
	ENSMUSG00000026021
	P63165
	P63166
	NM_003352; NM_001005781; NM_001005782
	NM_009460
NP_001005781; NP_001005782; NP_003343; NP_001358321; NP_001358322;
	NP_001358323
	NP_033486
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SUMO1 (англ. Small ubiquitin-like modifier 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 101 амінокислот, а молекулярна маса — 11 557[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSDQEAKPST	EDLGDKKEGE	YIKLKVIGQD	SSEIHFKVKM	TTHLKKLKES
YCQRQGVPMN	SLRFLFEGQR	IADNHTPKEL	GMEEEDVIEV	YQEQTGGHST
V

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

Shen Z., Pardington-Purtymun P.E., Comeaux J.C., Moyzis R.K., Chen D.J. (1996). UBL1, a human ubiquitin-like protein associating with human RAD51/RAD52 proteins.. Genomics 36: 271 — 279. PubMed DOI:10.1006/geno.1996.0462
Mahajan R., Delphin C., Guan T., Gerace L., Melchior F. (1997). A small ubiquitin-related polypeptide involved in targeting RanGAP1 to nuclear pore complex protein RanBP2.. Cell 88: 97 — 107. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)81862-0
Matunis M.J., Coutavas E., Blobel G. (1996). A novel ubiquitin-like modification modulates the partitioning of the Ran-GTPase-activating protein RanGAP1 between the cytosol and the nuclear pore complex.. J. Cell Biol. 135: 1457 — 1470. PubMed DOI:10.1083/jcb.135.6.1457
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kamitani T., Nguyen H.P., Yeh E.T.H. (1997). Preferential modification of nuclear proteins by a novel ubiquitin-like molecule.. J. Biol. Chem. 272: 14001 — 14004. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.22.14001
Minty A., Dumont X., Kaghad M., Caput D. (2000). Covalent modification of p73alpha by SUMO-1. Two-hybrid screening with p73 identifies novel SUMO-1-interacting proteins and a SUMO-1 interaction motif.. J. Biol. Chem. 275: 36316 — 36323. PubMed DOI:10.1074/jbc.M004293200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12502 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, P63165 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12502 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P63165 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.