TAPBP

TAPBP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3F8U
Ідентифікатори
Символи	TAPBP, NGS17, TAPA, TPN, TPSN, TAP binding protein (tapasin), TAP binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 601962 MGI: 1201689 HomoloGene: 2401 GeneCards: TAPBP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding; • TAP2 binding; • unfolded protein binding; • ABC-type peptide antigen transporter activity; • GO:0001948 protein binding; • MHC class I protein binding; • TAP1 binding; • TAP complex binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • Golgi membrane; • TAP complex; • MHC class I peptide loading complex; • Ендоплазматичний ретикулум; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • phagocytic vesicle membrane; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane;
Біологічний процес	• retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I; • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I; • regulation of protein complex stability; • Імунна відповідь; • peptide antigen stabilization; • Регуляція експресії генів; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • vesicle fusion with endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment (ERGIC) membrane; • amide transport; • protein-containing complex assembly; • MHC class Ib protein complex assembly; • peptide transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6892
	21356
ENSG00000231925; ENSG00000236490; ENSG00000206281; ENSG00000206208; ENSG00000112493;
	н/д
	ENSMUSG00000024308
	O15533
	Q9R233
	NM_003190; NM_172208; NM_172209
	NM_001025313; NM_009318
	NP_003181; NP_757345; NP_757346
	NP_001020484; NP_033344
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TAPBP (англ. TAP binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 448 амінокислот, а молекулярна маса — 47 626[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKSLSLLLAV	ALGLATAVSA	GPAVIECWFV	EDASGKGLAK	RPGALLLRQG
PGEPPPRPDL	DPELYLSVHD	PAGALQAAFR	RYPRGAPAPH	CEMSRFVPLP
ASAKWASGLT	PAQNCPRALD	GAWLMVSISS	PVLSLSSLLR	PQPEPQQEPV
LITMATVVLT	VLTHTPAPRV	RLGQDALLDL	SFAYMPPTSE	AASSLAPGPP
PFGLEWRRQH	LGKGHLLLAA	TPGLNGQMPA	AQEGAVAFAA	WDDDEPWGPW
TGNGTFWLPR	VQPFQEGTYL	ATIHLPYLQG	QVTLELAVYK	PPKVSLMPAT
LARAAPGEAP	PELLCLVSHF	YPSGGLEVEW	ELRGGPGGRS	QKAEGQRWLS
ALRHHSDGSV	SLSGHLQPPP	VTTEQHGARY	ACRIHHPSLP	ASGRSAEVTL
EVAGLSGPSL	EDSVGLFLSA	FLLLGLFKAL	GWAAVYLSTC	KDSKKKAE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Li S., Sjoegren H.-O., Hellman U., Pettersson R.F., Wang P. (1997). Cloning and functional characterization of a subunit of the transporter associated with antigen processing.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 8708 — 8713. PubMed DOI:10.1073/pnas.94.16.8708
Herberg J.A., Beck S., Trowsdale J. (1998). TAPASIN, DAXX, RGL2, HKE2 and four new genes (BING 1, 3 to 5) form a dense cluster at the centromeric end of the MHC.. J. Mol. Biol. 277: 839 — 857. PubMed DOI:10.1006/jmbi.1998.1637
Gao B., Williams A., Sewell A., Elliott T. (2004). Generation of a functional, soluble tapasin protein from an alternatively spliced mRNA.. Genes Immun. 5: 101 — 108. PubMed DOI:10.1038/sj.gene.6364043
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Bangia N., Lehner P.J., Hughes E.A., Surman M., Cresswell P. (1999). The N-terminal region of tapasin is required to stabilize the MHC class I loading complex.. Eur. J. Immunol. 29: 1858 — 1870. PubMed DOI:10.1002/(SICI)1521-4141(199906)29:06<1858::AID-IMMU1858>3.0.CO;2-C
Li S., Paulsson K.M., Chen S., Sjoegren H.-O., Wang P. (2000). Tapasin is required for efficient peptide binding to transporter associated with antigen processing.. J. Biol. Chem. 275: 1581 — 1586. PubMed DOI:10.1074/jbc.275.3.1581

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11566 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, O15533 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11566 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O15533 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.