TBP

TBP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1TGH, 1C9B, 1JFI, 1NVP, 4ROC, 4ROE, 4ROD, 5IY9, 5IYA, 5FUR, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	TBP, GTF2D, GTF2D1, HDL4, SCA17, TFIID, TATA-box binding protein, TATA-binding protein, TBP1
Зовнішні ІД	OMIM: 600075 MGI: 101838 HomoloGene: 2404 GeneCards: TBP
Пов'язані генетичні захворювання
	spinocerebellar ataxia type 17[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • transcription factor binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948 protein binding; • enzyme binding; • TFIIB-class transcription factor binding; • aryl hydrocarbon receptor binding; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • RNA polymerase III general transcription initiation factor activity; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity; • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • transcription factor TFIID complex; • male pronucleus; • female pronucleus; • Нуклеоплазма; • transcription factor TFIIA complex; • Пронуклеус; • клітинне ядро; • transcription preinitiation complex; • protein-containing complex; • transcription factor TFIIIB complex; • transcription regulator complex;
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase I transcription; • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; • regulation of transcription, DNA-templated; • transcription initiation from RNA polymerase I promoter; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • Сперматогенез; • DNA-templated transcription, initiation; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • GO:0022415 viral process; • regulation of transcription by RNA polymerase III; • transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase III; • RNA polymerase II preinitiation complex assembly; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • RNA polymerase III preinitiation complex assembly; • transcription elongation from RNA polymerase I promoter;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6908
	21374
	ENSG00000112592
	ENSMUSG00000014767
	P20226
	P29037
	NM_003194; NM_001172085
	NM_013684
	NP_001165556; NP_003185
	NP_038712
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TBP (англ. TATA-box binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 37 698[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDQNNSLPPY	AQGLASPQGA	MTPGIPIFSP	MMPYGTGLTP	QPIQNTNSLS
ILEEQQRQQQ	QQQQQQQQQQ	QQQQQQQQQQ	QQQQQQQQQQ	QQQQQAVAAA
AVQQSTSQQA	TQGTSGQAPQ	LFHSQTLTTA	PLPGTTPLYP	SPMTPMTPIT
PATPASESSG	IVPQLQNIVS	TVNLGCKLDL	KTIALRARNA	EYNPKRFAAV
IMRIREPRTT	ALIFSSGKMV	CTGAKSEEQS	RLAARKYARV	VQKLGFPAKF
LDFKIQNMVG	SCDVKFPIRL	EGLVLTHQQF	SSYEPELFPG	LIYRMIKPRI
VLLIFVSGKV	VLTGAKVRAE	IYEAFENIYP	ILKGFRKTT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Peterson M.G., Tanese N., Pugh B.F., Tjian R. (1990). Functional domains and upstream activation properties of cloned human TATA binding protein.. Science 248: 1625 — 1630. PubMed DOI:10.1126/science.2363050
Geisberg J.V., Lee W.S., Berk A.J., Ricciardi R.P. (1994). The zinc finger region of the adenovirus E1A transactivating domain complexes with the TATA box binding protein.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 2488 — 2492. PubMed DOI:10.1073/pnas.91.7.2488
Veschambre P., Simard P., Jalinot P. (1995). Evidence for functional interaction between the HIV-1 Tat transactivator and the TATA box binding protein in vivo.. J. Mol. Biol. 250: 169 — 180. PubMed DOI:10.1006/jmbi.1995.0368
LeRoy G., Orphanides G., Lane W.S., Reinberg D. (1998). Requirement of RSF and FACT for transcription of chromatin templates in vitro.. Science 282: 1900 — 1904. PubMed DOI:10.1126/science.282.5395.1900
Yuan C.X., Gurley W.B. (2000). Potential targets for HSF1 within the preinitiation complex.. Cell Stress Chaperones 5: 229 — 242. PubMed DOI:10.1379/1466-1268(2000)005<0229:PTFHWT>2.0.CO;2
Friedrich J.K., Panov K.I., Cabart P., Russell J., Zomerdijk J.C.B.M. (2005). TBP-TAF complex SL1 directs RNA polymerase I pre-initiation complex formation and stabilizes upstream binding factor at the rDNA promoter.. J. Biol. Chem. 280: 29551 — 29558. PubMed DOI:10.1074/jbc.M501595200

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з TBP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11588 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P20226 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TBP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11588 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P20226 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.