TIMP3

TIMP3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3CKI
Ідентифікатори
Символи	TIMP3, HSMRK222, K222, K222TA2, SFD, TIMP metallopeptidase inhibitor 3
Зовнішні ІД	OMIM: 188826 MGI: 98754 HomoloGene: 36322 GeneCards: TIMP3
Пов'язані генетичні захворювання
	Sorsby's fundus dystrophy[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidase inhibitor activity; • GO:0048551 enzyme inhibitor activity; • зв'язування з іоном металу; • protease binding; • GO:0001948 protein binding; • metalloendopeptidase inhibitor activity;
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця; • Базальна мембрана; • Екзосома; • клітинне ядро; • extracellular region; • platelet dense granule lumen; • extracellular space; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• cellular response to organic substance; • negative regulation of peptidase activity; • response to stimulus; • positive regulation of TRAIL-activated apoptotic signaling pathway; • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • negative regulation of membrane protein ectodomain proteolysis; • зір; • platelet degranulation; • response to organic substance; • negative regulation of metalloendopeptidase activity; • response to hormone; • negative regulation of endopeptidase activity; • response to cytokine;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7078
	21859
	ENSG00000100234
	ENSMUSG00000020044
	P35625
	P39876
	NM_000362
	NM_011595
	NP_000353
	NP_035725
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TIMP3 (англ. TIMP metallopeptidase inhibitor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 24 145[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTPWLGLIVL	LGSWSLGDWG	AEACTCSPSH	PQDAFCNSDI	VIRAKVVGKK
LVKEGPFGTL	VYTIKQMKMY	RGFTKMPHVQ	YIHTEASESL	CGLKLEVNKY
QYLLTGRVYD	GKMYTGLCNF	VERWDQLTLS	QRKGLNYRYH	LGCNCKIKSC
YYLPCFVTSK	NECLWTDMLS	NFGYPGYQSK	HYACIRQKGG	YCSWYRGWAP
PDKSIINATD	P

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів металоферментів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Silbiger S.M., Jacobsen V.L., Cupples R.L., Koski R.A. (1994). Cloning of cDNAs encoding human TIMP-3, a novel member of the tissue inhibitor of metalloproteinase family.. Gene 141: 293 — 297. PubMed DOI:10.1016/0378-1119(94)90588-6
Stoehr H., Roomp K., Felbor U., Weber B.H.F. (1995). Genomic organization of the human tissue inhibitor of metalloproteinases-3 (TIMP3).. Genome Res. 5: 483 — 487. PubMed DOI:10.1101/gr.5.5.483
Ruiz A.C., Brett P., Bok D. (1996). TIMP-3 is expressed in the human retinal pigment epithelium.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 226: 467 — 474. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1996.1379
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Apte S.S., Mattei M.-G., Olsen B.R. (1994). Cloning of the cDNA encoding human tissue inhibitor of metalloproteinases-3 (TIMP-3) and mapping of the TIMP3 gene to chromosome 22.. Genomics 19: 86 — 90. PubMed DOI:10.1006/geno.1994.1016
Kishnani N.S., Staskus P.W., Yang T.-T., Masiarz F.R., Hawkes S.P. (1995). Identification and characterization of human tissue inhibitor of metalloproteinase-3 and detection of three additional metalloproteinase inhibitor activities in extracellular matrix.. Matrix Biol. 14: 479 — 488. PubMed DOI:10.1016/0945-053X(95)90005-5

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з TIMP3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11822 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P35625 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TIMP3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11822 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P35625 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.