TIRAP

TIRAP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2Y92, 3UB2, 3UB3, 3UB4, 4FZ5, 4LQD
Ідентифікатори
Символи	TIRAP, BACTS1, Mal, MyD88-2, wyatt, toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain containing adaptor protein, TIR domain containing adaptor protein
Зовнішні ІД	OMIM: 606252 MGI: 2152213 HomoloGene: 14285 GeneCards: TIRAP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein-macromolecule adaptor activity; • protein homodimerization activity; • Toll-like receptor 2 binding; • Toll-like receptor 4 binding; • GO:0001948 protein binding; • protein heterodimerization activity; • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding; • protein kinase C binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • клітинна мембрана; • endocytic vesicle; • ruffle membrane;
Біологічний процес	• myeloid cell differentiation; • regulation of innate immune response; • cellular response to bacterial lipopeptide; • positive regulation of toll-like receptor 3 signaling pathway; • positive regulation of interleukin-12 production; • positive regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 1 production; • positive regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production; • immune system process; • positive regulation of JNK cascade; • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway; • positive regulation of interleukin-15 production; • positive regulation of protein homodimerization activity; • cell surface receptor signaling pathway; • response to lipopolysaccharide; • TIRAP-dependent toll-like receptor 4 signaling pathway; • cellular response to lipoteichoic acid; • positive regulation of B cell proliferation; • regulation of interferon-beta production; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of interleukin-8 production; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of neutrophil chemotaxis; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of toll-like receptor 2 signaling pathway; • 3'-UTR-mediated mRNA stabilization; • inflammatory response; • Сигнальна трансдукція; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium; • Вроджений імунітет; • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	114609
	117149
	ENSG00000150455
	ENSMUSG00000032041
	P58753
	Q99JY1
	NM_001039661; NM_052887; NM_148910; NM_001318776; NM_001318777
	NM_001177845; NM_001177846; NM_001177847; NM_054096
	NP_001034750; NP_001305705; NP_001305706; NP_683708
	NP_001171316; NP_001171317; NP_001171318; NP_473437
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TIRAP (англ. TIR domain containing adaptor protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 221 амінокислот, а молекулярна маса — 23 883[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASSTSLPAP	GSRPKKPLGK	MADWFRQTLL	KKPKKRPNSP	ESTSSDASQP
TSQDSPLPPS	LSSVTSPSLP	PTHASDSGSS	RWSKDYDVCV	CHSEEDLVAA
QDLVSYLEGS	TASLRCFLQL	RDATPGGAIV	SELCQALSSS	HCRVLLITPG
FLQDPWCKYQ	MLQALTEAPG	AEGCTIPLLS	GLSRAAYPPE	LRFMYYVDGR
GPDGGFRQVK	EAVMRYLQTL	S

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

Horng T., Barton G.M., Medzhitov R. (2001). TIRAP: an adapter molecule in the Toll signaling pathway.. Nat. Immunol. 2: 835 — 841. PubMed DOI:10.1038/ni0901-835
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Semaan N., Alsaleh G., Gottenberg J.E., Wachsmann D., Sibilia J. (2008). Etk/BMX, a Btk family tyrosine kinase, and Mal contribute to the cross-talk between MyD88 and FAK pathways.. J. Immunol. 180: 3485 — 3491. PubMed DOI:10.4049/jimmunol.180.5.3485
Wan T., Liu T., Zhang H., Tang S., Min W. (2010). AIP1 functions as Arf6-GAP to negatively regulate TLR4 signaling.. J. Biol. Chem. 285: 3750 — 3757. PubMed DOI:10.1074/jbc.M109.069385

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17192 (англ.). Процитовано 19 вересня 2017.
UniProt, P58753 (англ.). Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17192 (англ.). Процитовано 19 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P58753 (англ.). Процитовано 19 вересня 2017.