TJP1

TJP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2H2B, 2H2C, 2H3M, 2JWE, 2KXR, 2KXS, 2RCZ, 3CYY, 3LH5, 3SHU, 3SHW, 3TSV, 3TSW, 3TSZ, 4OEO, 4OEP, 4Q2Q, 4YYX
Ідентифікатори
Символи	TJP1, ZO-1, Tight junction protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601009 MGI: 98759 HomoloGene: 2445 GeneCards: TJP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calmodulin binding; • GO:0001948 protein binding; • cadherin binding; • protein domain specific binding; • connexin binding; • protein C-terminus binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • bicellular tight junction; • клітинна мембрана; • basolateral plasma membrane; • Щілинні контакти; • apical junction complex; • гіалоплазма; • цитоплазма; • apical part of cell; • Міжклітинні контакти; • podosome; • cell projection; • клітинне ядро; • cell-cell junction; • Адгезивні контакти; • intercalated disc; • apical plasma membrane; • apicolateral plasma membrane; • intercellular canaliculus; • Щільні контакти; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• establishment of endothelial intestinal barrier; • hippo signaling; • cell-cell junction assembly; • regulation of bicellular tight junction assembly; • blastocyst formation; • sensory perception of sound; • response to lipopolysaccharide; • negative regulation of vascular permeability; • response to ethanol; • response to magnetism; • cellular response to glucose stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	7082
	21872
	ENSG00000277401; ENSG00000104067
	ENSMUSG00000030516
	Q07157
	P39447
NM_001301025; NM_001301026; NM_003257; NM_175610; NM_001330239;
	NM_001355012; NM_001355013; NM_001355014; NM_001355015
	NM_001163574; NM_009386
NP_001287954; NP_001287955; NP_001317168; NP_003248; NP_783297;
	NP_001341941; NP_001341942; NP_001341943; NP_001341944; NP_001287954.1; NP_001287955.1
	NP_001157046; NP_033412
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TJP1 (англ. Tight junction protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 748 амінокислот, а молекулярна маса — 195 459[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSARAAAAKS	TAMEETAIWE	QHTVTLHRAP	GFGFGIAISG	GRDNPHFQSG
ETSIVISDVL	KGGPAEGQLQ	ENDRVAMVNG	VSMDNVEHAF	AVQQLRKSGK
NAKITIRRKK	KVQIPVSRPD	PEPVSDNEED	SYDEEIHDPR	SGRSGVVNRR
SEKIWPRDRS	ASRERSLSPR	SDRRSVASSQ	PAKPTKVTLV	KSRKNEEYGL
RLASHIFVKE	ISQDSLAARD	GNIQEGDVVL	KINGTVTENM	SLTDAKTLIE
RSKGKLKMVV	QRDERATLLN	VPDLSDSIHS	ANASERDDIS	EIQSLASDHS
GRSHDRPPRR	SRSRSPDQRS	EPSDHSRHSP	QQPSNGSLRS	RDEERISKPG
AVSTPVKHAD	DHTPKTVEEV	TVERNEKQTP	SLPEPKPVYA	QVGQPDVDLP
VSPSDGVLPN	STHEDGILRP	SMKLVKFRKG	DSVGLRLAGG	NDVGIFVAGV
LEDSPAAKEG	LEEGDQILRV	NNVDFTNIIR	EEAVLFLLDL	PKGEEVTILA
QKKKDVYRRI	VESDVGDSFY	IRTHFEYEKE	SPYGLSFNKG	EVFRVVDTLY
NGKLGSWLAI	RIGKNHKEVE	RGIIPNKNRA	EQLASVQYTL	PKTAGGDRAD
FWRFRGLRSS	KRNLRKSRED	LSAQPVQTKF	PAYERVVLRE	AGFLRPVTIF
GPIADVAREK	LAREEPDIYQ	IAKSEPRDAG	TDQRSSGIIR	LHTIKQIIDQ
DKHALLDVTP	NAVDRLNYAQ	WYPIVVFLNP	DSKQGVKTMR	MRLCPESRKS
ARKLYERSHK	LRKNNHHLFT	TTINLNSMND	GWYGALKEAI	QQQQNQLVWV
SEGKADGATS	DDLDLHDDRL	SYLSAPGSEY	SMYSTDSRHT	SDYEDTDTEG
GAYTDQELDE	TLNDEVGTPP	ESAITRSSEP	VREDSSGMHH	ENQTYPPYSP
QAQPQPIHRI	DSPGFKPASQ	QKAEASSPVP	YLSPETNPAS	STSAVNHNVN
LTNVRLEEPT	PAPSTSYSPQ	ADSLRTPSTE	AAHIMLRDQE	PSLSSHVDPT
KVYRKDPYPE	EMMRQNHVLK	QPAVSHPGHR	PDKEPNLTYE	PQLPYVEKQA
SRDLEQPTYR	YESSSYTDQF	SRNYEHRLRY	EDRVPMYEEQ	WSYYDDKQPY
PSRPPFDNQH	SQDLDSRQHP	EESSERGYFP	RFEEPAPLSY	DSRPRYEQAP
RASALRHEEQ	PAPGYDTHGR	LRPEAQPHPS	AGPKPAESKQ	YFEQYSRSYE
QVPPQGFTSR	AGHFEPLHGA	AAVPPLIPSS	QHKPEALPSN	TKPLPPPPTQ
TEEEEDPAMK	PQSVLTRVKM	FENKRSASLE	TKKDVNDTGS	FKPPEVASKP
SGAPIIGPKP	TSQNQFSEHD	KTLYRIPEPQ	KPQLKPPEDI	VRSNHYDPEE
DEEYYRKQLS	YFDRRSFENK	PPAHIAASHL	SEPAKPAHSQ	NQSNFSSYSS
KGKPPEADGV	DRSFGEKRYE	PIQATPPPPP	LPSQYAQPSQ	PVTSASLHIH
SKGAHGEGNS	VSLDFQNSLV	SKPDPPPSQN	KPATFRPPNR	EDTAQAAFYP
QKSFPDKAPV	NGTEQTQKTV	TPAYNRFTPK	PYTSSARPFE	RKFESPKFNH
NLLPSETAHK	PDLSSKTPTS	PKTLVKSHSL	AQPPEFDSGV	ETFSIHAEKP
KYQINNISTV	PKAIPVSPSA	VEEDEDEDGH	TVVATARGIF	NSNGGVLSSI
ETGVSIIIPQ	GAIPEGVEQE	IYFKVCRDNS	ILPPLDKEKG	ETLLSPLVMC
GPHGLKFLKP	VELRLPHCDP	KTWQNKCLPG	DPNYLVGANC	VSVLIDHF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
D'Atri F., Nadalutti F., Citi S. (2002). Evidence for a functional interaction between cingulin and ZO-1 in cultured cells.. J. Biol. Chem. 277: 27757 — 27764. PubMed DOI:10.1074/jbc.M203717200
Sallee J.L., Burridge K. (2009). Density-enhanced phosphatase 1 regulates phosphorylation of tight junction proteins and enhances barrier function of epithelial cells.. J. Biol. Chem. 284: 14997 — 15006. PubMed DOI:10.1074/jbc.M901901200
Fanning A.S., Lye M.F., Anderson J.M., Lavie A. (2007). Domain swapping within PDZ2 is responsible for dimerization of ZO proteins.. J. Biol. Chem. 282: 37710 — 37716. PubMed DOI:10.1074/jbc.M707255200
Chen J., Pan L., Wei Z., Zhao Y., Zhang M. (2008). Domain-swapped dimerization of ZO-1 PDZ2 generates specific and regulatory connexin43-binding sites.. EMBO J. 27: 2113 — 2123. PubMed DOI:10.1038/emboj.2008.138
Lye M.F., Fanning A.S., Su Y., Anderson J.M., Lavie A. (2010). Insights into regulated ligand binding sites from the structure of ZO-1 Src homology 3-guanylate kinase module.. J. Biol. Chem. 285: 13907 — 13917. PubMed DOI:10.1074/jbc.M109.093674

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11827 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q07157 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11827 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q07157 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.