TJP2

TJP2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2OSG, 3E17
Ідентифікатори
Символи	TJP2, C9DUPq21.11, DFNA51, DUP9q21.11, PFIC4, X104, ZO2, Tight junction protein 2, FHCA1
Зовнішні ІД	OMIM: 607709 MGI: 1341872 HomoloGene: 3541 GeneCards: TJP2
Пов'язані генетичні захворювання
	аметропія[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein-macromolecule adaptor activity; • protein domain specific binding; • guanylate kinase activity; • GO:0001948 protein binding; • cadherin binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • bicellular tight junction; • Адгезивні контакти; • клітинна мембрана; • Міжклітинні контакти; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• establishment of endothelial intestinal barrier; • hippo signaling; • regulation of membrane permeability; • intestinal absorption; • GMP metabolic process; • GDP metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9414
	21873
	ENSG00000119139
	ENSMUSG00000024812
	Q9UDY2
	Q9Z0U1
NM_001170414; NM_001170415; NM_001170416; NM_001170630; NM_004817;
	NM_201629; NM_001369870; NM_001369871; NM_001369872; NM_001369873; NM_001369874; NM_001369875
	NM_001198985; NM_011597; NM_001360391; NM_001360392; NM_001376368
	NP_001163885; NP_001163886; NP_001163887; NP_004808; NP_963923
	NP_001185914; NP_035727; NP_001347320; NP_001347321
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TJP2 (англ. Tight junction protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 190 амінокислот, а молекулярна маса — 133 958[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPVRGDRGFP	PRRELSGWLR	APGMEELIWE	QYTVTLQKDS	KRGFGIAVSG
GRDNPHFENG	ETSIVISDVL	PGGPADGLLQ	ENDRVVMVNG	TPMEDVLHSF
AVQQLRKSGK	VAAIVVKRPR	KVQVAALQAS	PPLDQDDRAF	EVMDEFDGRS
FRSGYSERSR	LNSHGGRSRS	WEDSPERGRP	HERARSRERD	LSRDRSRGRS
LERGLDQDHA	RTRDRSRGRS	LERGLDHDFG	PSRDRDRDRS	RGRSIDQDYE
RAYHRAYDPD	YERAYSPEYR	RGARHDARSR	GPRSRSREHP	HSRSPSPEPR
GRPGPIGVLL	MKSRANEEYG	LRLGSQIFVK	EMTRTGLATK	DGNLHEGDII
LKINGTVTEN	MSLTDARKLI	EKSRGKLQLV	VLRDSQQTLI	NIPSLNDSDS
EIEDISEIES	NRSFSPEERR	HQYSDYDYHS	SSEKLKERPS	SREDTPSRLS
RMGATPTPFK	STGDIAGTVV	PETNKEPRYQ	EDPPAPQPKA	APRTFLRPSP
EDEAIYGPNT	KMVRFKKGDS	VGLRLAGGND	VGIFVAGIQE	GTSAEQEGLQ
EGDQILKVNT	QDFRGLVRED	AVLYLLEIPK	GEMVTILAQS	RADVYRDILA
CGRGDSFFIR	SHFECEKETP	QSLAFTRGEV	FRVVDTLYDG	KLGNWLAVRI
GNELEKGLIP	NKSRAEQMAS	VQNAQRDNAG	DRADFWRMRG	QRSGVKKNLR
KSREDLTAVV	SVSTKFPAYE	RVLLREAGFK	RPVVLFGPIA	DIAMEKLANE
LPDWFQTAKT	EPKDAGSEKS	TGVVRLNTVR	QIIEQDKHAL	LDVTPKAVDL
LNYTQWFPIV	IFFNPDSRQG	VKTMRQRLNP	TSNKSSRKLF	DQANKLKKTC
AHLFTATINL	NSANDSWFGS	LKDTIQHQQG	EAVWVSEGKM	EGMDDDPEDR
MSYLTAMGAD	YLSCDSRLIS	DFEDTDGEGG	AYTDNELDEP	AEEPLVSSIT
RSSEPVQHEE	SIRKPSPEPR	AQMRRAASSD	QLRDNSPPPA	FKPEPPKAKT
QNKEESYDFS	KSYEYKSNPS	AVAGNETPGA	STKGYPPPVA	AKPTFGRSIL
KPSTPIPPQE	GEEVGESSEE	QDNAPKSVLG	KVKIFEKMDH	KARLQRMQEL
QEAQNARIEI	AQKHPDIYAV	PIKTHKPDPG	TPQHTSSRPP	EPQKAPSRPY
QDTRGSYGSD	AEEEEYRQQL	SEHSKRGYYG	QSARYRDTEL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

Duclos F., Rodius F., Wrogemann K., Mandel J.-L., Koenig M. (1994). The Friedreich ataxia region: characterization of two novel genes and reduction of the critical region to 300 kb.. Hum. Mol. Genet. 3: 909 — 914. PubMed DOI:10.1093/hmg/3.6.909
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Metais J.-Y., Navarro C., Santoni M.-J., Audebert S., Borg J.-P. (2005). hScrib interacts with ZO-2 at the cell-cell junctions of epithelial cells.. FEBS Lett. 579: 3725 — 3730. PubMed DOI:10.1016/j.febslet.2005.05.062

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з TJP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11828 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, Q9UDY2 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TJP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11828 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9UDY2 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.