TNFRSF8

TNFRSF8
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1D01
Ідентифікатори
Символи	TNFRSF8, CD30, D1S166E, Ki-1, tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, TNF receptor superfamily member 8
Зовнішні ІД	OMIM: 153243 MGI: 99908 HomoloGene: 949 GeneCards: TNFRSF8
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transmembrane signaling receptor activity; • tumor necrosis factor-activated receptor activity; • nerve growth factor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • integral component of plasma membrane; • Екзосома; • мембрана; • клітинна мембрана; • клітинне ядро; • neuron projection;
Біологічний процес	• apoptotic signaling pathway; • cellular response to mechanical stimulus; • response to lipopolysaccharide; • inflammatory response; • Імунна відповідь; • Сигнальна трансдукція; • negative regulation of cell population proliferation; • positive regulation of apoptotic process; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • axon guidance; • negative regulation of neuron projection development; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	943
	21941
	ENSG00000120949
	ENSMUSG00000028602
	P28908
	Q60846
	NM_001243; NM_001281430; NM_152942
	NM_009401
	NP_001234; NP_001268359
	NP_033427
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TNFRSF8 (англ. TNF receptor superfamily member 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 595 амінокислот, а молекулярна маса — 63 747[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRVLLAALGL	LFLGALRAFP	QDRPFEDTCH	GNPSHYYDKA	VRRCCYRCPM
GLFPTQQCPQ	RPTDCRKQCE	PDYYLDEADR	CTACVTCSRD	DLVEKTPCAW
NSSRVCECRP	GMFCSTSAVN	SCARCFFHSV	CPAGMIVKFP	GTAQKNTVCE
PASPGVSPAC	ASPENCKEPS	SGTIPQAKPT	PVSPATSSAS	TMPVRGGTRL
AQEAASKLTR	APDSPSSVGR	PSSDPGLSPT	QPCPEGSGDC	RKQCEPDYYL
DEAGRCTACV	SCSRDDLVEK	TPCAWNSSRT	CECRPGMICA	TSATNSCARC
VPYPICAAET	VTKPQDMAEK	DTTFEAPPLG	TQPDCNPTPE	NGEAPASTSP
TQSLLVDSQA	SKTLPIPTSA	PVALSSTGKP	VLDAGPVLFW	VILVLVVVVG
SSAFLLCHRR	ACRKRIRQKL	HLCYPVQTSQ	PKLELVDSRP	RRSSTQLRSG
ASVTEPVAEE	RGLMSQPLME	TCHSVGAAYL	ESLPLQDASP	AGGPSSPRDL
PEPRVSTEHT	NNKIEKIYIM	KADTVIVGTV	KAELPEGRGL	AGPAEPELEE
ELEADHTPHY	PEQETEPPLG	SCSDVMLSVE	EEGKEDPLPT	AASGK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Lee S.Y., Park C.G., Choi Y. (1996). T cell receptor-dependent cell death of T cell hybridomas mediated by the CD30 cytoplasmic domain in association with tumor necrosis factor receptor-associated factors.. J. Exp. Med. 183: 669 — 674. PubMed DOI:10.1084/jem.183.2.669
Boucher L.-M., Marengere L.E., Lu Y., Thukral S., Mak T.W. (1997). Binding sites of cytoplasmic effectors TRAF1, 2, and 3 on CD30 and other members of the TNF receptor superfamily.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 233: 592 — 600. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1997.6509
Ye H., Park Y.C., Kreishman M., Kieff E., Wu H. (1999). The structural basis for the recognition of diverse receptor sequences by TRAF2.. Mol. Cell 4: 321 — 330. PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(00)80334-2

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11923 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P28908 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11923 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P28908 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.