TNRC6A
TNRC6A (англ. Trinucleotide repeat containing 6A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 962 амінокислот, а молекулярна маса — 210 297[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MRELEAKATK | DVERNLSRDL | VQEEEQLMEE | KKKKKDDKKK | KEAAQKKATE | ||||
| QKIKVPEQIK | PSVSQPQPAN | SNNGTSTATS | TNNNAKRATA | NNQQPQQQQQ | ||||
| QQQPQQQQPQ | QQPQPQPQQQ | QPQQQPQALP | RYPREVPPRF | RHQEHKQLLK | ||||
| RGQHFPVIAA | NLGSAVKVLN | SQSESSALTN | QQPQNNGEVQ | NSKNQSDINH | ||||
| STSGSHYENS | QRGPVSSTSD | SSTNCKNAVV | SDLSEKEAWP | SAPGSDPELA | ||||
| SECMDADSAS | SSESERNITI | MASGNTGGEK | DGLRNSTGLG | SQNKFVVGSS | ||||
| SNNVGHGSST | GPWGFSHGAI | ISTCQVSVDA | PESKSESSNN | RMNAWGTVSS | ||||
| SSNGGLNPST | LNSASNHGAW | PVLENNGLAL | KGPVGSGSSG | INIQCSTIGQ | ||||
| MPNNQSINSK | VSGGSTHGTW | GSLQETCESE | VSGTQKVSFS | GQPQNITTEM | ||||
| TGPNNTTNFM | TSSLPNSGSV | QNNELPSSNT | GAWRVSTMNH | PQMQAPSGMN | ||||
| GTSLSHLSNG | ESKSGGSYGT | TWGAYGSNYS | GDKCSGPNGQ | ANGDTVNATL | ||||
| MQPGVNGPMG | TNFQVNTNKG | GGVWESGAAN | SQSTSWGSGN | GANSGGSRRG | ||||
| WGTPAQNTGT | NLPSVEWNKL | PSNQHSNDSA | NGNGKTFTNG | WKSTEEEDQG | ||||
| SATSQTNEQS | SVWAKTGGTV | ESDGSTESTG | RLEEKGTGES | QSRDRRKIDQ | ||||
| HTLLQSIVNR | TDLDPRVLSN | SGWGQTPIKQ | NTAWDTETSP | RGERKTDNGT | ||||
| EAWGSSATQT | FNSGACIDKT | SPNGNDTSSV | SGWGDPKPAL | RWGDSKGSNC | ||||
| QGGWEDDSAA | TGMVKSNQWG | NCKEEKAAWN | DSQKNKQGWG | DGQKSSQGWS | ||||
| VSASDNWGET | SRNNHWGEAN | KKSSSGGSDS | DRSVSGWNEL | GKTSSFTWGN | ||||
| NINPNNSSGW | DESSKPTPSQ | GWGDPPKSNQ | SLGWGDSSKP | VSSPDWNKQQ | ||||
| DIVGSWGIPP | ATGKPPGTGW | LGGPIPAPAK | EEEPTGWEEP | SPESIRRKME | ||||
| IDDGTSAWGD | PSKYNYKNVN | MWNKNVPNGN | SRSDQQAQVH | QLLTPASAIS | ||||
| NKEASSGSGW | GEPWGEPSTP | ATTVDNGTSA | WGKPIDSGPS | WGEPIAAASS | ||||
| TSTWGSSSVG | PQALSKSGPK | SMQDGWCGDD | MPLPGNRPTG | WEEEEDVEIG | ||||
| MWNSNSSQEL | NSSLNWPPYT | KKMSSKGLSG | KKRRRERGMM | KGGNKQEEAW | ||||
| INPFVKQFSN | ISFSRDSPEE | NVQSNKMDLS | GGMLQDKRME | IDKHSLNIGD | ||||
| YNRTVGKGPG | SRPQISKESS | MERNPYFDKD | GIVADESQNM | QFMSSQSMKL | ||||
| PPSNSALPNQ | ALGSIAGLGM | QNLNSVRQNG | NPSMFGVGNT | AAQPRGMQQP | ||||
| PAQPLSSSQP | NLRAQVPPPL | LSPQVPVSLL | KYAPNNGGLN | PLFGPQQVAM | ||||
| LNQLSQLNQL | SQISQLQRLL | AQQQRAQSQR | SVPSGNRPQQ | DQQGRPLSVQ | ||||
| QQMMQQSRQL | DPNLLVKQQT | PPSQQQPLHQ | PAMKSFLDNV | MPHTTPELQK | ||||
| GPSPINAFSN | FPIGLNSNLN | VNMDMNSIKE | PQSRLRKWTT | VDSISVNTSL | ||||
| DQNSSKHGAI | SSGFRLEESP | FVPYDFMNSS | TSPASPPGSI | GDGWPRAKSP | ||||
| NGSSSVNWPP | EFRPGEPWKG | YPNIDPETDP | YVTPGSVINN | LSINTVREVD | ||||
| HLRDRNSGSS | SSLNTTLPST | SAWSSIRASN | YNVPLSSTAQ | STSARNSDSK | ||||
| LTWSPGSVTN | TSLAHELWKV | PLPPKNITAP | SRPPPGLTGQ | KPPLSTWDNS | ||||
| PLRIGGGWGN | SDARYTPGSS | WGESSSGRIT | NWLVLKNLTP | QIDGSTLRTL | ||||
| CMQHGPLITF | HLNLPHGNAL | VRYSSKEEVV | KAQKSLHMCV | LGNTTILAEF | ||||
| ASEEEISRFF | AQSQSLTPSP | GWQSLGSSQS | RLGSLDCSHS | FSSRTDLNHW | ||||
| NGAGLSGTNC | GDLHGTSLWG | TPHYSTSLWG | PPSSSDPRGI | SSPSPINAFL | ||||
| SVDHLGGGGE | SM |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.. DNA Res. 7: 143 — 150. PubMed DOI:10.1093/dnares/7.2.143
- Sen G.L., Blau H.M. (2005). Argonaute 2/RISC resides in sites of mammalian mRNA decay known as cytoplasmic bodies.. Nat. Cell Biol. 7: 633 — 636. PubMed DOI:10.1038/ncb1265
- Wakiyama M., Takimoto K., Ohara O., Yokoyama S. (2007). Let-7 microRNA-mediated mRNA deadenylation and translational repression in a mammalian cell-free system.. Genes Dev. 21: 1857 — 1862. PubMed DOI:10.1101/gad.1566707
- Jagannath A., Wood M.J.A. (2009). Localization of double-stranded small interfering RNA to cytoplasmic processing bodies is Ago2 dependent and results in up-regulation of GW182 and Argonaute-2.. Mol. Biol. Cell 20: 521 — 529. PubMed DOI:10.1091/mbc.E08-08-0796
- Zipprich J.T., Bhattacharyya S., Mathys H., Filipowicz W. (2009). Importance of the C-terminal domain of the human GW182 protein TNRC6C for translational repression.. RNA 15: 781 — 793. PubMed DOI:10.1261/rna.1448009
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11969 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
- UniProt, Q8NDV7 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.