TOP3A

TOP3A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4CGY, 4CHT
Ідентифікатори
Символи	TOP3A, TOP3, ZGRF7, topoisomerase (DNA) III alpha, DNA topoisomerase III alpha, PEOB5, MGRISCE2
Зовнішні ІД	OMIM: 601243 MGI: 1197527 HomoloGene: 3394 GeneCards: TOP3A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity; • DNA binding; • zinc ion binding; • GO:0001948 protein binding; • isomerase activity; • зв'язування з іоном металу; • DNA topoisomerase activity; • single-stranded DNA binding; • nucleic acid binding;
Клітинна компонента	• PML body; • Нуклеоплазма; • хромосома; • клітинне ядро; • мітохондрія; • мітохондріальний матрикс;
Біологічний процес	• Реплікація ДНК; • DNA topological change; • GO:0007126 Мейоз; • mitochondrial DNA metabolic process; • chromosome separation; • regulation of signal transduction by p53 class mediator;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	7156
	21975
	ENSG00000284238; ENSG00000177302
	ENSMUSG00000002814
	Q13472
	O70157
	NM_004618; NM_001320759
	NM_009410
	NP_001307688; NP_004609
	NP_033436
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TOP3A (англ. DNA topoisomerase III alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 001 амінокислот, а молекулярна маса — 112 372[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MIFPVARYAL	RWLRRPEDRA	FSRAAMEMAL	RGVRKVLCVA	EKNDAAKGIA
DLLSNGRMRR	REGLSKFNKI	YEFDYHLYGQ	NVTMVMTSVS	GHLLAHDFQM
QFRKWQSCNP	LVLFEAEIEK	YCPENFVDIK	KTLERETRQC	QALVIWTDCD
REGENIGFEI	IHVCKAVKPN	LQVLRARFSE	ITPHAVRTAC	ENLTEPDQRV
SDAVDVRQEL	DLRIGAAFTR	FQTLRLQRIF	PEVLAEQLIS	YGSCQFPTLG
FVVERFKAIQ	AFVPEIFHRI	KVTHDHKDGI	VEFNWKRHRL	FNHTACLVLY
QLCVEDPMAT	VVEVRSKPKS	KWRPQALDTV	ELEKLASRKL	RINAKETMRI
AEKLYTQGYI	SYPRTETNIF	PRDLNLTVLV	EQQTPDPRWG	AFAQSILERG
GPTPRNGNKS	DQAHPPIHPT	KYTNNLQGDE	QRLYEFIVRH	FLACCSQDAQ
GQETTVEIDI	AQERFVAHGL	MILARNYLDV	YPYDHWSDKI	LPVYEQGSHF
QPSTVEMVDG	ETSPPKLLTE	ADLIALMEKH	GIGTDATHAE	HIETIKARMY
VGLTPDKRFL	PGHLGMGLVE	GYDSMGYEMS	KPDLRAELEA	DLKLICDGKK
DKFVVLRQQV	QKYKQVFIEA	VAKAKKLDEA	LAQYFGNGTE	LAQQEDIYPA
MPEPIRKCPQ	CNKDMVLKTK	KNGGFYLSCM	GFPECRSAVW	LPDSVLEASR
DSSVCPVCQP	HPVYRLKLKF	KRGSLPPTMP	LEFVCCIGGC	DDTLREILDL
RFSGGPPRAS	QPSGRLQANQ	SLNRMDNSQH	PQPADSRQTG	SSKALAQTLP
PPTAAGESNS	VTCNCGQEAV	LLTVRKEGPN	RGRQFFKCNG	GSCNFFLWAD
SPNPGAGGPP	ALAYRPLGAS	LGCPPGPGIH	LGGFGNPGDG	SGSGTSCLCS
QPSVTRTVQK	DGPNKGRQFH	TCAKPREQQC	GFFQWVDENT	APGTSGAPSW
TGDRGRTLES	EARSKRPRAS	SSDMGSTAKK	PRKCSLCHQP	GHTRPFCPQN
R

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, топоізомераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, іоном магнію.

Література

Hanai R., Caron P.R., Wang J.C. (1996). Human TOP3: a single-copy gene encoding DNA topoisomerase III.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 3653 — 3657. PubMed DOI:10.1073/pnas.93.8.3653
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Yang J., Bachrati C.Z., Ou J., Hickson I.D., Brown G.W. (2010). Human topoisomerase IIIalpha is a single-stranded DNA decatenase that is stimulated by BLM and RMI1.. J. Biol. Chem. 285: 21426 — 21436. PubMed DOI:10.1074/jbc.M110.123216

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11992 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q13472 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11992 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q13472 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.