TOPORS

TOPORS
Ідентифікатори
Символи	TOPORS, LUN, P53BP3, RP31, TP53BPL, TOP1 binding arginine/serine rich protein, TOP1 binding arginine/serine rich protein, E3 ubiquitin ligase
Зовнішні ІД	OMIM: 609507 MGI: 2146189 HomoloGene: 4237 GeneCards: TOPORS
Пов'язані генетичні захворювання
	retinitis pigmentosa 31[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0003823 antigen binding; • DNA binding; • SUMO transferase activity; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • зв'язування з іоном металу; • ubiquitin-protein transferase activity; • DNA topoisomerase binding; • GO:0001948 protein binding; • transferase activity;
Клітинна компонента	• ciliary basal body; • PML body; • nuclear speck; • spindle pole; • ubiquitin ligase complex; • gamma-tubulin complex; • photoreceptor connecting cilium; • midbody; • cytoplasmic dynein complex; • Центріоль; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; • retina layer formation; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • protein polyubiquitination; • negative regulation of apoptotic process; • retinal cone cell development; • protein monoubiquitination; • photoreceptor cell outer segment organization; • protein sumoylation; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • protein K48-linked ubiquitination; • regulation of cell population proliferation; • positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity; • retinal rod cell development; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • protein localization to nucleus; • maintenance of protein location in nucleus; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10210
	106021
	ENSG00000197579
	ENSMUSG00000036822
	Q9NS56
	Q80Z37
	NM_005802; NM_001195622
	NM_134097
	NP_001182551; NP_005793
	NP_598858
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TOPORS (англ. TOP1 binding arginine/serine rich protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 045 амінокислот, а молекулярна маса — 119 198[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSQPPLGSP	LSREEGEAPP	PAPASEGRRR	SRRVRLRGSC	RHRPSFLGCR
ELAASAPARP	APASSEIMAS	AAKEFKMDNF	SPKAGTSKLQ	QTVPADASPD
SKCPICLDRF	DNVSYLDRCL	HKFCFRCVQE	WSKNKAECPL	CKQPFDSIFH
SVRAEDDFKE	YVLRPSYNGS	FVTPDRRFRY	RTTLTRERNA	SVYSPSGPVN
RRTTTPPDSG	VLFEGLGIST	RPRDVEIPQF	MRQIAVRRPT	TADERSLRKI
QEQDIINFRR	TLYRAGARVR	NIEDGGRYRD	ISAEFFRRNP	ACLHRLVPWL
KRELTVLFGA	HGSLVNIVQH	IIMSNVTRYD	LESQAFVSDL	RPFLLNRTEH
FIHEFISFAR	SPFNMAAFDQ	HANYDCPAPS	YEEGSHSDSS	VITISPDEAE
TQELDINVAT	VSQAPWDDET	PGPSYSSSEQ	VHVTMSSLLN	TSDSSDEELV
TGGATSQIQG	VQTNDDLNND	SDDSSDNCVI	VGFVKPLAER	TPELVELSSD
SEDLGSYEKM	ETVKTQEQEQ	SYSSGDSDVS	RCSSPHSVLG	KDEQINKGHC
DSSTRIKSKK	EEKRSTSLSS	PRNLNSSVRG	DRVYSPYNHR	HRKRGRSRSS
DSRSQSRSGH	DQKNHRKHHG	KKRMKSKRSR	SRESSRPRGR	RDKKRSRTRD
SSWSRRSQTL	SLSSESTSRS	RSRSSDHGKR	RSRSRNRDRY	YLRNNYGSRY
KWEYTYYSRN	KDRDGYESSY	RRRTLSRAHY	SRQSSSPEFR	VQSFSERTNA
RKKNNHSERK	YYYYERHRSR	SLSSNRSRTA	STGTDRVRNE	KPGGKRKYKT
RHLEGTNEVA	QPSREFASKA	KDSHYQKSSS	KLDGNYKNES	DTFSDSRSSD
RETKHKRRKR	KTRSLSVEIV	YEGKATDTTK	HHKKKKKKHK	KKHKKHHGDN
ASRSPVVITI	DSDSDKDSEV	KEDTECDNSG	PQDPLQNEFL	APSLEPFETK
DVVTIEAEFG	VLDKECDIAT	LSNNLNNANK	TVDNIPPLAA	SVEQTLDVRE
ESTFVSDLEN	QPSNIVSLQT	EPSRQLPSPR	TSLMSVCLGR	DCDMS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Zhou R., Wen H., Ao S.-Z. (1999). Identification of a novel gene encoding a p53-associated protein.. Gene 235: 93 — 101. PubMed DOI:10.1016/S0378-1119(99)00203-6
Rasheed Z.A., Saleem A., Ravee Y., Pandolfi P.P., Rubin E.H. (2002). The topoisomerase I-binding RING protein, topors, is associated with promyelocytic leukemia nuclear bodies.. Exp. Cell Res. 277: 152 — 160. PubMed DOI:10.1006/excr.2002.5550
Weger S., Hammer E., Engstler M. (2003). The DNA topoisomerase I binding protein topors as a novel cellular target for SUMO-1 modification: characterization of domains necessary for subcellular localization and sumolation.. Exp. Cell Res. 290: 13 — 27. PubMed DOI:10.1016/S0014-4827(03)00292-1
Weger S., Hammer E., Heilbronn R. (2005). Topors acts as a SUMO-1 E3 ligase for p53 in vitro and in vivo.. FEBS Lett. 579: 5007 — 5012. PubMed DOI:10.1016/j.febslet.2005.07.088
Renner F., Moreno R., Schmitz M.L. (2010). SUMOylation-dependent localization of IKKepsilon in PML nuclear bodies is essential for protection against DNA-damage-triggered cell death.. Mol. Cell 37: 503 — 515. PubMed DOI:10.1016/j.molcel.2010.01.018

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з TOPORS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21653 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, Q9NS56 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TOPORS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21653 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9NS56 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.