TRAP1

TRAP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4Z1F, 4Z1G, 4Z1H, 4Z1I, 5F3K, 5F5R
Ідентифікатори
Символи	TRAP1, HSP 75, HSP75, HSP90L, TRAP-1, TNF receptor associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606219 MGI: 1915265 HomoloGene: 9457 GeneCards: TRAP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • unfolded protein binding; • GO:0001948 protein binding; • tumor necrosis factor receptor binding; • ATP binding; • protein kinase binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • мітохондріальний міжмембранний простір; • lipid droplet; • Нуклеоплазма; • мітохондріальний матрикс; • мітохондрія; • мітохондріальна внутрішня мембрана; • Екзосома;
Біологічний процес	• response to stress; • negative regulation of cellular respiration; • Згортання білків; • negative regulation of reactive oxygen species biosynthetic process; • translational attenuation; • chaperone-mediated protein folding; • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to hydrogen peroxide;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10131
	68015
	ENSG00000126602
	ENSMUSG00000005981
	Q12931
	Q9CQN1
	NM_001272049; NM_016292
	NM_026508
	NP_001258978; NP_057376
	NP_080784
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRAP1 (англ. TNF receptor associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 704 амінокислот, а молекулярна маса — 80 110[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARELRALLL	WGRRLRPLLR	APALAAVPGG	KPILCPRRTT	AQLGPRRNPA
WSLQAGRLFS	TQTAEDKEEP	LHSIISSTES	VQGSTSKHEF	QAETKKLLDI
VARSLYSEKE	VFIRELISNA	SDALEKLRHK	LVSDGQALPE	MEIHLQTNAE
KGTITIQDTG	IGMTQEELVS	NLGTIARSGS	KAFLDALQNQ	AEASSKIIGQ
FGVGFYSAFM	VADRVEVYSR	SAAPGSLGYQ	WLSDGSGVFE	IAEASGVRTG
TKIIIHLKSD	CKEFSSEARV	RDVVTKYSNF	VSFPLYLNGR	RMNTLQAIWM
MDPKDVREWQ	HEEFYRYVAQ	AHDKPRYTLH	YKTDAPLNIR	SIFYVPDMKP
SMFDVSRELG	SSVALYSRKV	LIQTKATDIL	PKWLRFIRGV	VDSEDIPLNL
SRELLQESAL	IRKLRDVLQQ	RLIKFFIDQS	KKDAEKYAKF	FEDYGLFMRE
GIVTATEQEV	KEDIAKLLRY	ESSALPSGQL	TSLSEYASRM	RAGTRNIYYL
CAPNRHLAEH	SPYYEAMKKK	DTEVLFCFEQ	FDELTLLHLR	EFDKKKLISV
ETDIVVDHYK	EEKFEDRSPA	AECLSEKETE	ELMAWMRNVL	GSRVTNVKVT
LRLDTHPAMV	TVLEMGAARH	FLRMQQLAKT	QEERAQLLQP	TLEINPRHAL
IKKLNQLRAS	EPGLAQLLVD	QIYENAMIAA	GLVDDPRAMV	GRLNELLVKA
LERH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Song H.Y., Dunbar J.D., Zhang Y.X., Guo D., Donner D.B. (1995). Identification of a protein with homology to hsp90 that binds the type 1 tumor necrosis factor receptor.. J. Biol. Chem. 270: 3574 — 3581. PubMed DOI:10.1074/jbc.270.28.16630

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16264 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.
UniProt, Q12931 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16264 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q12931 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.