TRDMT1

TRDMT1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1G55
Ідентифікатори
Символи	TRDMT1, DMNT2, DNMT2, MHSAIIP, PUMET, RNMT1, tRNA aspartic acid methyltransferase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602478 MGI: 1274787 HomoloGene: 3249 GeneCards: TRDMT1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• methyltransferase activity; • transferase activity; • tRNA methyltransferase activity; • RNA binding; • tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• response to amphetamine; • Метилювання; • tRNA methylation; • tRNA modification; • tRNA processing;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1787
	13434
	ENSG00000107614
	ENSMUSG00000026723
	O14717
	O55055
NM_004412; NM_176081; NM_176083; NM_176084; NM_176085;
	NM_176086; NM_001321006; NM_001321007; NM_001351219; NM_001351220; NM_001351221; NM_001351222; NM_001351223
	NM_010067
NP_001307935; NP_001307936; NP_004403; NP_001338148; NP_001338149;
	NP_001338150; NP_001338151; NP_001338152
	NP_034197
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRDMT1 (англ. TRNA aspartic acid methyltransferase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислот, а молекулярна маса — 44 597[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPLRVLELY	SGVGGMHHAL	RESCIPAQVV	AAIDVNTVAN	EVYKYNFPHT
QLLAKTIEGI	TLEEFDRLSF	DMILMSPPCQ	PFTRIGRQGD	MTDSRTNSFL
HILDILPRLQ	KLPKYILLEN	VKGFEVSSTR	DLLIQTIENC	GFQYQEFLLS
PTSLGIPNSR	LRYFLIAKLQ	SEPLPFQAPG	QVLMEFPKIE	SVHPQKYAMD
VENKIQEKNV	EPNISFDGSI	QCSGKDAILF	KLETAEEIHR	KNQQDSDLSV
KMLKDFLEDD	TDVNQYLLPP	KSLLRYALLL	DIVQPTCRRS	VCFTKGYGSY
IEGTGSVLQT	AEDVQVENIY	KSLTNLSQEE	QITKLLILKL	RYFTPKEIAN
LLGFPPEFGF	PEKITVKQRY	RLLGNSLNVH	VVAKLIKILY	E

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг тРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

Yoder J.A., Bestor T.H. (1998). A candidate mammalian DNA methyltransferase related to pmt1p of fission yeast.. Hum. Mol. Genet. 7: 279 — 284. PubMed DOI:10.1093/hmg/7.2.279
Van den Wyngaert I., Sprengel J., Kass S.U., Luyten W.H.M.L. (1998). Cloning and analysis of a novel human putative DNA methyltransferase.. FEBS Lett. 426: 283 — 289. PubMed DOI:10.1016/S0014-5793(98)00362-7
Okano M., Xie S., Li E. (1998). Dnmt2 is not required for de novo and maintenance methylation of viral DNA in embryonic stem cells.. Nucleic Acids Res. 26: 2536 — 2540. PubMed DOI:10.1093/nar/26.11.2536
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Franchina M., Hooper J., Kay P.H. (2001). Five novel alternatively spliced transcripts of DNA (cytosine-5) methyltransferase 2 in human peripheral blood leukocytes.. Int. J. Biochem. Cell Biol. 33: 1104 — 1115. PubMed DOI:10.1016/S1357-2725(01)00074-7

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2977 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, O14717 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2977 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O14717 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.