TREM1

TREM1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1Q8M, 1SMO
Ідентифікатори
Символи	TREM1, CD354, TREM-1, triggering receptor expressed on myeloid cells 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605085 MGI: 1930005 HomoloGene: 10243 GeneCards: TREM1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• scaffold protein binding; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • extracellular region; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• GO:0007243 intracellular signal transduction; • humoral immune response; • regulation of immune response; • Вроджений імунітет; • leukocyte migration; • acute inflammatory response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	54210
	58217
	ENSG00000124731
	ENSMUSG00000042265
	Q9NP99
	Q9JKE2
	NM_001242589; NM_001242590; NM_018643
	NM_021406; NM_001347399
	NP_001229518; NP_001229519; NP_061113
	NP_001334328; NP_067381
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TREM1 (англ. Triggering receptor expressed on myeloid cells 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 234 амінокислот, а молекулярна маса — 26 387[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRKTRLWGLL	WMLFVSELRA	ATKLTEEKYE	LKEGQTLDVK	CDYTLEKFAS
SQKAWQIIRD	GEMPKTLACT	ERPSKNSHPV	QVGRIILEDY	HDHGLLRVRM
VNLQVEDSGL	YQCVIYQPPK	EPHMLFDRIR	LVVTKGFSGT	PGSNENSTQN
VYKIPPTTTK	ALCPLYTSPR	TVTQAPPKST	ADVSTPDSEI	NLTNVTDIIR
VPVFNIVILL	AGGFLSKSLV	FSVLFAVTLR	SFVP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Bouchon A., Dietrich J., Colonna M. (2000). Inflammatory responses can be triggered by TREM-1, a novel receptor expressed on neutrophils and monocytes.. J. Immunol. 164: 4991 — 4995. PubMed DOI:10.4049/jimmunol.164.10.4991
Gingras M.-C., Lapillonne H., Margolin J.F. (2002). TREM-1, MDL-1, and DAP12 expression is associated with a mature stage of myeloid development.. Mol. Immunol. 38: 817 — 824. PubMed DOI:10.1016/S0161-5890(02)00004-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Bouchon A., Facchetti F., Weigand M.A., Colonna M. (2001). TREM-1 amplifies inflammation and is a crucial mediator of septic shock.. Nature 410: 1103 — 1107. PubMed DOI:10.1038/35074114
Radaev S., Kattah M., Rostro B., Colonna M., Sun P.D. (2003). Crystal structure of the human myeloid cell activating receptor TREM-1.. Structure 11: 1527 — 1535. PubMed DOI:10.1016/j.str.2003.11.001

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17760 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, Q9NP99 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17760 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9NP99 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.