TRIM63

TRIM63
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3DDT, 4M3L, 2D8U
Ідентифікатори
Символи	TRIM63, IRF, MURF1, MURF2, RNF28, SMRZ, tripartite motif containing 63
Зовнішні ІД	OMIM: 606131 MGI: 2447992 HomoloGene: 41878 GeneCards: TRIM63
Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding; • GO:0001948 protein binding; • titin binding; • signal transducer activity; • зв'язування з іоном металу; • ubiquitin-protein transferase activity; • transferase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • M band; • contractile fiber; • Z disc; • Мікротрубочки; • клітинне ядро; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• skeletal muscle atrophy; • м'язове скорочення; • response to glucocorticoid; • response to interleukin-1; • Убіквітин-залежний протеоліз; • response to electrical stimulus involved in regulation of muscle adaptation; • Сигнальна трансдукція; • negative regulation of cardiac muscle hypertrophy;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	84676
	433766
	ENSG00000158022
	ENSMUSG00000028834
	Q969Q1
	Q38HM4
	NM_032588
	NM_001039048; NM_001369245
	NP_115977
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRIM63 (англ. Tripartite motif containing 63) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 353 амінокислот, а молекулярна маса — 40 248[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDYKSSLIQD	GNPMENLEKQ	LICPICLEMF	TKPVVILPCQ	HNLCRKCAND
IFQAANPYWT	SRGSSVSMSG	GRFRCPTCRH	EVIMDRHGVY	GLQRNLLVEN
IIDIYKQECS	SRPLQKGSHP	MCKEHEDEKI	NIYCLTCEVP	TCSMCKVFGI
HKACEVAPLQ	SVFQGQKTEL	NNCISMLVAG	NDRVQTIITQ	LEDSRRVTKE
NSHQVKEELS	QKFDTLYAIL	DEKKSELLQR	ITQEQEKKLS	FIEALIQQYQ
EQLDKSTKLV	ETAIQSLDEP	GGATFLLTAK	QLIKSIVEAS	KGCQLGKTEQ
GFENMDFFTL	DLEHIADALR	AIDFGTDEEE	EEFIEEEDQE	EEESTEGKEE
GHQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, м'язових білків. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Є маркером м'язової атрофії[5].

Література

Dai K.-S., Liew C.-C. (2001). A novel human striated muscle RING zinc finger protein, SMRZ, interacts with SMT3b via its RING domain.. J. Biol. Chem. 276: 23992 — 23999. PubMed DOI:10.1074/jbc.M011208200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
McElhinny A.S., Kakinuma K., Sorimachi H., Labeit S., Gregorio C.C. (2002). Muscle-specific RING finger-1 interacts with titin to regulate sarcomeric M-line and thick filament structure and may have nuclear functions via its interaction with glucocorticoid modulatory element binding protein-1.. J. Cell Biol. 157: 125 — 136. PubMed DOI:10.1083/jcb.200108089

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16007 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, Q969Q1 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
Bodine, Sue C.; Baehr, Leslie M. (2014). Skeletal muscle atrophy and the E3 ubiquitin ligases MuRF1 and MAFbx/atrogin-1. American Journal of Physiology-Endocrinology and Metabolism 307 (6): E469–E484. ISSN 0193-1849. doi:10.1152/ajpendo.00204.2014.(англ.)

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16007 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q969Q1 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[BodineBaehr2014-5] Bodine, Sue C.; Baehr, Leslie M. (2014). Skeletal muscle atrophy and the E3 ubiquitin ligases MuRF1 and MAFbx/atrogin-1. American Journal of Physiology-Endocrinology and Metabolism 307 (6): E469–E484. ISSN 0193-1849. doi:10.1152/ajpendo.00204.2014.(англ.)