TSEN15

TSEN15
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2GW6
Ідентифікатори
Символи	TSEN15, C1orf19, sen15, tRNA splicing endonuclease subunit 15, PCH2F
Зовнішні ІД	OMIM: 608756 MGI: 1913887 HomoloGene: 12002 GeneCards: TSEN15
Онтологія гена
Молекулярна функція	• tRNA-intron endonuclease activity; • nucleic acid binding; • nuclease activity;
Клітинна компонента	• Ядерце; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• mRNA processing; • RNA phosphodiester bond hydrolysis; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • tRNA processing; • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	116461
	66637
	ENSG00000198860
	ENSMUSG00000014980
	Q8WW01
	Q8R3W5
	NM_001127394; NM_001300764; NM_001300766; NM_052965; NM_001363643
	NM_025677
	NP_001120866; NP_001287693; NP_001287695; NP_443197; NP_001350572
	NP_079953
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TSEN15 (англ. TRNA splicing endonuclease subunit 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 171 амінокислот, а молекулярна маса — 18 641[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEERGDSEPT	PGCSGLGPGG	VRGFGDGGGA	PSWAPEDAWM	GTHPKYLEMM
ELDIGDATQV	YVAFLVYLDL	MESKSWHEVN	CVGLPELQLI	CLVGTEIEGE
GLQTVVPTPI	TASLSHNRIR	EILKASRKLQ	GDPDLPMSFT	LAIVESDSTI
VYYKLTDGFM	LPDPQNISLR	R

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, процесинг тРНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Paushkin S.V., Patel M., Furia B.S., Peltz S.W., Trotta C.R. (2004). Identification of a human endonuclease complex reveals a link between tRNA splicing and pre-mRNA 3' end formation.. Cell 117: 311 — 321. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(04)00342-3
Song J., Markley J.L. (2007). Three-dimensional structure determined for a subunit of human tRNA splicing endonuclease (Sen15) reveals a novel dimeric fold.. J. Mol. Biol. 366: 155 — 164. PubMed DOI:10.1016/j.jmb.2006.11.024

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16791 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, Q8WW01 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16791 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q8WW01 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.