WDR1

WDR1
Ідентифікатори
Символи	WDR1, AIP1, HEL-S-52, NORI-1, WD repeat domain 1, PFITS
Зовнішні ІД	OMIM: 604734 MGI: 1337100 HomoloGene: 6628 GeneCards: WDR1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin binding; • actin filament binding;
Клітинна компонента	• extracellular region; • myelin sheath; • podosome; • Міжклітинні контакти; • cell projection; • Екзосома; • Цитоскелет; • Мікрофіламенти; • cell-cell junction; • цитоплазма; • гіалоплазма; • cortical actin cytoskeleton; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• platelet degranulation; • sensory perception of sound; • actin cytoskeleton organization; • regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane repolarization; • regulation of oligodendrocyte differentiation; • maintenance of epithelial cell apical/basal polarity; • apical junction assembly; • regulation of actin filament depolymerization; • neutrophil mediated immunity; • regulation of cell shape; • actin filament fragmentation; • Тромбоцитопоез; • positive regulation of actin filament depolymerization; • cortical cytoskeleton organization; • locomotion; • establishment of planar polarity of follicular epithelium; • sarcomere organization; • neutrophil migration; • actin filament depolymerization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	9948
	22388
	ENSG00000071127
	ENSMUSG00000005103
	O75083
	O88342
	NM_005112; NM_017491
	NM_011715
	NP_005103; NP_059830
	NP_035845
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

WDR1 (англ. WD repeat domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 606 амінокислот, а молекулярна маса — 66 194[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPYEIKKVFA	SLPQVERGVS	KIIGGDPKGN	NFLYTNGKCV	ILRNIDNPAL
ADIYTEHAHQ	VVVAKYAPSG	FYIASGDVSG	KLRIWDTTQK	EHLLKYEYQP
FAGKIKDIAW	TEDSKRIAVV	GEGREKFGAV	FLWDSGSSVG	EITGHNKVIN
SVDIKQSRPY	RLATGSDDNC	AAFFEGPPFK	FKFTIGDHSR	FVNCVRFSPD
GNRFATASAD	GQIYIYDGKT	GEKVCALGGS	KAHDGGIYAI	SWSPDSTHLL
SASGDKTSKI	WDVSVNSVVS	TFPMGSTVLD	QQLGCLWQKD	HLLSVSLSGY
INYLDRNNPS	KPLHVIKGHS	KSIQCLTVHK	NGGKSYIYSG	SHDGHINYWD
SETGENDSFA	GKGHTNQVSR	MTVDESGQLI	SCSMDDTVRY	TSLMLRDYSG
QGVVKLDVQP	KCVAVGPGGY	AVVVCIGQIV	LLKDQRKCFS	IDNPGYEPEV
VAVHPGGDTV	AIGGVDGNVR	LYSILGTTLK	DEGKLLEAKG	PVTDVAYSHD
GAFLAVCDAS	KVVTVFSVAD	GYSENNVFYG	HHAKIVCLAW	SPDNEHFASG
GMDMMVYVWT	LSDPETRVKI	QDAHRLHHVS	SLAWLDEHTL	VTTSHDASVK
EWTITY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

Adler H.J., Winnicki R.S., Gong T.-W.L., Lomax M.I. (1999). A gene upregulated in the acoustically damaged chick basilar papilla encodes a novel WD40 repeat protein.. Genomics 56: 59 — 69. PubMed DOI:10.1006/geno.1998.5672
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Cervero P., Himmel M., Kruger M., Linder S. (2012). Proteomic analysis of podosome fractions from macrophages reveals similarities to spreading initiation centres.. Eur. J. Cell Biol. 91: 908 — 922. PubMed DOI:10.1016/j.ejcb.2012.05.005
Lechuga S., Baranwal S., Ivanov A.I. (2015). Actin-interacting protein 1 controls assembly and permeability of intestinal epithelial apical junctions.. Am. J. Physiol. 308: G745 — G756. PubMed DOI:10.1152/ajpgi.00446.2014

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12754 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.
UniProt, O75083 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12754 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

[UniProt-4] UniProt, O75083 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.