XPO1

XPO1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1W9C, 2L1L, 3GB8, 4BSM, 4BSN, 5DIS
Ідентифікатори
Символи	XPO1, CRM1, emb, exp1, exportin 1, CRM-1
Зовнішні ІД	OMIM: 602559 MGI: 2144013 HomoloGene: 2554 GeneCards: XPO1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding; • transporter activity; • GO:0001948 protein binding; • RNA binding; • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore; • nuclear export signal receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Тільце Кахаля; • Ядерна мембрана; • мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • nuclear envelope; • Нуклеоплазма; • annulate lamellae; • клітинне ядро; • Кінетохор; • Ядерце; • гіалоплазма; • host cell; • protein-containing complex; • Рибонуклеопротеїни; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• ribosomal small subunit export from nucleus; • GO:0046795 intracellular transport of virus; • regulation of centrosome duplication; • mRNA transport; • regulation of mRNA stability; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • protein export from nucleus; • regulation of protein catabolic process; • protein localization to nucleus; • protein transport; • ribosomal large subunit export from nucleus; • intracellular protein transport; • GO:0022415 viral process; • sister chromatid cohesion; • ribosomal subunit export from nucleus; • regulation of protein export from nucleus; • ribosome biogenesis; • транспорт; • nucleocytoplasmic transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7514
	103573
	ENSG00000082898
	ENSMUSG00000020290
	O14980
	Q6P5F9
	NM_003400
	NM_001035226; NM_134014
	NP_003391
	NP_001030303; NP_598775
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

XPO1 (англ. Exportin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 071 амінокислот, а молекулярна маса — 123 386[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPAIMTMLAD	HAARQLLDFS	QKLDINLLDN	VVNCLYHGEG	AQQRMAQEVL
THLKEHPDAW	TRVDTILEFS	QNMNTKYYGL	QILENVIKTR	WKILPRNQCE
GIKKYVVGLI	IKTSSDPTCV	EKEKVYIGKL	NMILVQILKQ	EWPKHWPTFI
SDIVGASRTS	ESLCQNNMVI	LKLLSEEVFD	FSSGQITQVK	SKHLKDSMCN
EFSQIFQLCQ	FVMENSQNAP	LVHATLETLL	RFLNWIPLGY	IFETKLISTL
IYKFLNVPMF	RNVSLKCLTE	IAGVSVSQYE	EQFVTLFTLT	MMQLKQMLPL
NTNIRLAYSN	GKDDEQNFIQ	NLSLFLCTFL	KEHDQLIEKR	LNLRETLMEA
LHYMLLVSEV	EETEIFKICL	EYWNHLAAEL	YRESPFSTSA	SPLLSGSQHF
DVPPRRQLYL	PMLFKVRLLM	VSRMAKPEEV	LVVENDQGEV	VREFMKDTDS
INLYKNMRET	LVYLTHLDYV	DTERIMTEKL	HNQVNGTEWS	WKNLNTLCWA
IGSISGAMHE	EDEKRFLVTV	IKDLLGLCEQ	KRGKDNKAII	ASNIMYIVGQ
YPRFLRAHWK	FLKTVVNKLF	EFMHETHDGV	QDMACDTFIK	IAQKCRRHFV
QVQVGEVMPF	IDEILNNINT	IICDLQPQQV	HTFYEAVGYM	IGAQTDQTVQ
EHLIEKYMLL	PNQVWDSIIQ	QATKNVDILK	DPETVKQLGS	ILKTNVRACK
AVGHPFVIQL	GRIYLDMLNV	YKCLSENISA	AIQANGEMVT	KQPLIRSMRT
VKRETLKLIS	GWVSRSNDPQ	MVAENFVPPL	LDAVLIDYQR	NVPAAREPEV
LSTMAIIVNK	LGGHITAEIP	QIFDAVFECT	LNMINKDFEE	YPEHRTNFFL
LLQAVNSHCF	PAFLAIPPTQ	FKLVLDSIIW	AFKHTMRNVA	DTGLQILFTL
LQNVAQEEAA	AQSFYQTYFC	DILQHIFSVV	TDTSHTAGLT	MHASILAYMF
NLVEEGKIST	SLNPGNPVNN	QIFLQEYVAN	LLKSAFPHLQ	DAQVKLFVTG
LFSLNQDIPA	FKEHLRDFLV	QIKEFAGEDT	SDLFLEEREI	ALRQADEEKH
KRQMSVPGIF	NPHEIPEEMC	D

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Fornerod M., Ohno M., Yoshida M., Mattaj I.W. (1997). CRM1 is an export receptor for leucine-rich nuclear export signals.. Cell 90: 1051 — 1060. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)80371-2
Ossareh-Nazari B., Bachelerie F., Dargemont C. (1997). Evidence for a role of CRM1 in signal-mediated nuclear protein export.. Science 278: 141 — 144. PubMed DOI:10.1126/science.278.5335.141
Askjaer P., Jensen T.H., Nilsson J., Englmeier L., Kjems J. (1998). The specificity of the CRM1-Rev nuclear export signal interaction is mediated by RanGTP.. J. Biol. Chem. 273: 33414 — 33422. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.50.33414
Farjot G., Sergeant A., Mikaelian I. (1999). A new nucleoporin-like protein interacts with both HIV-1 Rev nuclear export signal and CRM-1.. J. Biol. Chem. 274: 17309 — 17317. PubMed DOI:10.1074/jbc.274.24.17309
Lindsay M.E., Holaska J.M., Welch K., Paschal B.M., Macara I.G. (2001). Ran-binding protein 3 is a cofactor for Crm1-mediated nuclear protein export.. J. Cell Biol. 153: 1391 — 1402. PubMed DOI:10.1083/jcb.153.7.1391

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12825 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, O14980 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12825 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O14980 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.