ZBP1

ZBP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2L4M, 2LNB, 3EYI, 4KA4
Ідентифікатори
Символи	ZBP1, C20orf183, DAI, DLM-1, DLM1, Z-DNA binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606750 MGI: 1927449 HomoloGene: 10972 GeneCards: ZBP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • double-stranded RNA adenosine deaminase activity; • GO:0001948 protein binding; • left-handed Z-DNA binding; • RNA binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• positive regulation of type I interferon production; • immune system process; • Вроджений імунітет; • regulation of type I interferon production; • життєдіяльність; • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	81030
	58203
	ENSG00000124256
	ENSMUSG00000027514
	Q9H171
	Q9QY24
	NM_001160417; NM_001160418; NM_001160419; NM_030776; NM_001323966
	NM_001139519; NM_021394
	NP_001153889; NP_001153890; NP_001153891; NP_001310895; NP_110403
	NP_001132991; NP_067369
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZBP1 (англ. Z-DNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 429 амінокислот, а молекулярна маса — 46 343[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQAPADPGR	EGHLEQRILQ	VLTEAGSPVK	LAQLVKECQA	PKRELNQVLY
RMKKELKVSL	TSPATWCLGG	TDPEGEGPAE	LALSSPAERP	QQHAATIPET
PGPQFSQQRE	EDIYRFLKDN	GPQRALVIAQ	ALGMRTAKDV	NRDLYRMKSR
HLLDMDEQSK	AWTIYRPEDS	GRRAKSASII	YQHNPINMIC	QNGPNSWISI
ANSEAIQIGH	GNIITRQTVS	REDGSAGPRH	LPSMAPGDSS	TWGTLVDPWG
PQDIHMEQSI	LRRVQLGHSN	EMRLHGVPSE	GPAHIPPGSP	PVSATAAGPE
ASFEARIPSP	GTHPEGEAAQ	RIHMKSCFLE	DATIGNSNKM	SISPGVAGPG
GVAGSGEGEP	GEDAGRRPAD	TQSRSHFPRD	IGQPITPSHS	KLTPKLETMT
LGNRSHKAAE	GSHYVDEASH	EGSWWGGGI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК.

Література

Rothenburg S., Schwartz T., Koch-Nolte F., Haag F. (2002). Complex regulation of the human gene for the Z-DNA binding protein DLM-1.. Nucleic Acids Res. 30: 993 — 1000. PubMed DOI:10.1093/nar/30.4.993
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16176 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q9H171 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16176 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9H171 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.