ZEB1

ZEB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2E19
Ідентифікатори
Символи	ZEB1, zinc finger E-box binding homeobox 1, AREB6, BZP, DELTAEF1, FECD6, NIL2A, PPCD3, TCF8, ZFHEP, ZFHX1A
Зовнішні ІД	OMIM: 189909 MGI: 1344313 HomoloGene: 31779 GeneCards: ZEB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • zinc ion binding; • transcription factor binding; • chromatin binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • nucleic acid binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • E-box binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• transcription regulator complex; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• pattern specification process; • embryonic skeletal system morphogenesis; • regulation of smooth muscle cell differentiation; • animal organ development; • Диференціація клітин; • semicircular canal morphogenesis; • regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • нейробіологія розвитку; • regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • regulation of T cell differentiation in thymus; • central nervous system development; • cartilage development; • regulation of mesenchymal cell proliferation; • embryonic camera-type eye morphogenesis; • cochlea morphogenesis; • Імунна відповідь; • embryonic morphogenesis; • cellular response to amino acid stimulus; • проліферація; • negative regulation of epithelial cell differentiation; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of cell population proliferation; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of neuron differentiation; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of endothelial cell differentiation; • cytokine-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	6935
	21417
	ENSG00000148516
	ENSMUSG00000024238
	P37275
	Q64318
NM_001128128; NM_001174093; NM_001174094; NM_001174095; NM_001174096;
	NM_030751; NM_001323638; NM_001323641; NM_001323642; NM_001323643; NM_001323644; NM_001323645; NM_001323646; NM_001323647; NM_001323648; NM_001323649; NM_001323650; NM_001323651; NM_001323652; NM_001323653; NM_001323654; NM_001323655; NM_001323656; NM_001323657; NM_001323658; NM_001323659; NM_001323660; NM_001323661; NM_001323662; NM_001323663; NM_001323664; NM_001323665; NM_001323666; NM_001323671; NM_001323672; NM_001323673; NM_001323674; NM_001323675; NM_001323676; NM_001323677; NM_001323678
	NM_011546; NM_001360981; NM_001360982
NP_001121600; NP_001167564; NP_001167565; NP_001167566; NP_001167567;
	NP_001310567; NP_001310570; NP_001310571; NP_001310572; NP_001310573; NP_001310574; NP_001310575; NP_001310576; NP_001310577; NP_001310578; NP_001310579; NP_001310580; NP_001310581; NP_001310582; NP_001310583; NP_001310584; NP_001310585; NP_001310586; NP_001310587; NP_001310588; NP_001310589; NP_001310590; NP_001310591; NP_001310592; NP_001310593; NP_001310594; NP_001310595; NP_001310600; NP_001310601; NP_001310602; NP_001310603; NP_001310604; NP_001310605; NP_001310606; NP_001310607; NP_110378
	NP_035676; NP_001347910; NP_001347911
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZEB1 (англ. Zinc finger E-box binding homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 124 амінокислот, а молекулярна маса — 124 074[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADGPRCKRR	KQANPRRNNV	TNYNTVVETN	SDSDDEDKLH	IVEEESVTDA
ADCEGVPEDD	LPTDQTVLPG	RSSEREGNAK	NCWEDDRKEG	QEILGPEAQA
DEAGCTVKDD	ECESDAENEQ	NHDPNVEEFL	QQQDTAVIFP	EAPEEDQRQG
TPEASGHDEN	GTPDAFSQLL	TCPYCDRGYK	RFTSLKEHIK	YRHEKNEDNF
SCSLCSYTFA	YRTQLERHMT	SHKSGRDQRH	VTQSGCNRKF	KCTECGKAFK
YKHHLKEHLR	IHSGEKPYEC	PNCKKRFSHS	GSYSSHISSK	KCISLIPVNG
RPRTGLKTSQ	CSSPSLSASP	GSPTRPQIRQ	KIENKPLQEQ	LSVNQIKTEP
VDYEFKPIVV	ASGINCSTPL	QNGVFTGGGP	LQATSSPQGM	VQAVVLPTVG
LVSPISINLS	DIQNVLKVAV	DGNVIRQVLE	NNQANLASKE	QETINASPIQ
QGGHSVISAI	SLPLVDQDGT	TKIIINYSLE	QPSQLQVVPQ	NLKKENPVAT
NSCKSEKLPE	DLTVKSEKDK	SFEGGVNDST	CLLCDDCPGD	INALPELKHY
DLKQPTQPPP	LPAAEAEKPE	SSVSSATGDG	NLSPSQPPLK	NLLSLLKAYY
ALNAQPSAEE	LSKIADSVNL	PLDVVKKWFE	KMQAGQISVQ	SSEPSSPEPG
KVNIPAKNND	QPQSANANEP	QDSTVNLQSP	LKMTNSPVLP	VGSTTNGSRS
STPSPSPLNL	SSSRNTQGYL	YTAEGAQEEP	QVEPLDLSLP	KQQGELLERS
TITSVYQNSV	YSVQEEPLNL	SCAKKEPQKD	SCVTDSEPVV	NVIPPSANPI
NIAIPTVTAQ	LPTIVAIADQ	NSVPCLRALA	ANKQTILIPQ	VAYTYSTTVS
PAVQEPPLKV	IQPNGNQDER	QDTSSEGVSN	VEDQNDSDST	PPKKKMRKTE
NGMYACDLCD	KIFQKSSSLL	RHKYEHTGKR	PHECGICKKA	FKHKHHLIEH
MRLHSGEKPY	QCDKCGKRFS	HSGSYSQHMN	HRYSYCKREA	EERDSTEQEE
AGPEILSNEH	VGARASPSQG	DSDERESLTR	EEDEDSEKEE	EEEDKEMEEL
QEEKECEKPQ	GDEEEEEEEE	EVEEEEVEEA	ENEGEEAKTE	GLMKDDRAES
QASSLGQKVG	ESSEQVSEEK	TNEA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Long J., Zuo D., Park M. (2005). Pc2-mediated sumoylation of Smad-interacting protein 1 attenuates transcriptional repression of E-cadherin.. J. Biol. Chem. 280: 35477 — 35489. PubMed DOI:10.1074/jbc.M504477200
Papadopoulou V., Postigo A., Sanchez-Tillo E., Porter A.C., Wagner S.D. (2010). ZEB1 and CtBP form a repressive complex at a distal promoter element of the BCL6 locus.. Biochem. J. 427: 541 — 550. PubMed DOI:10.1042/BJ20091578
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432 — 12437. PubMed DOI:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage.. Cell Rep. 10: 1778 — 1791. PubMed DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Chung D.W., Frausto R.F., Ann L.B., Jang M.S., Aldave A.J. (2014). Functional impact of ZEB1 mutations associated with posterior polymorphous and Fuchs' endothelial corneal dystrophies.. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 55: 6159 — 6166. PubMed DOI:10.1167/iovs.14-15247

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11642 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P37275 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11642 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P37275 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.