ZFY

ZFY
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1KLR, 1KLS, 1XRZ, 5ZNF
Ідентифікатори
Символи	ZFY, ZNF911, zinc finger protein, Y-linked, zinc finger protein Y-linked
Зовнішні ІД	OMIM: 490000 HomoloGene: 88465 GeneCards: ZFY
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • зв'язування з іоном металу; • nucleic acid binding; • GO:0001948 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • Ядерце;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • transcription, DNA-templated; • regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7544
	н/д
	ENSG00000067646
	н/д
	P08048
	н/д
	NM_001145275; NM_001145276; NM_003411
	н/д
NP_001138747; NP_001138748; NP_003402; NP_001356631; NP_001356632;
	NP_001356633; NP_001356634; NP_001356635; NP_001356636; NP_001356637; NP_001356638; NP_001356639
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

ZFY (англ. Zinc finger protein, Y-linked) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на Y-хромосомі.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 801 амінокислот, а молекулярна маса — 90 505[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDEDEFELQP	QEPNSFFDGI	GADATHMDGD	QIVVEIQEAV	FVSNIVDSDI
TVHNFVPDDP	DSVVIQDVVE	DVVIEEDVQC	SDILEEADVS	ENVIIPEQVL
DSDVTEEVSL	PHCTVPDDVL	ASDITSTSMS	MPEHVLTSES	MHVCDIGHVE
HMVHDSVVEA	EIITDPLTSD	IVSEEVLVAD	CAPEAVIDAS	GISVDQQDND
KASCEDYLMI	SLDDAGKIEH	DGSTGVTIDA	ESEMDPCKVD	STCPEVIKVY
IFKADPGEDD	LGGTVDIVES	EPENDHGVEL	LDQNSSIRVP	REKMVYMTVN
DSQQEDEDLN	VAEIADEVYM	EVIVGEEDAA	VAAAAAAVHE	QQIDEDEMKT
FVPIAWAAAY	GNNSDGIENR	NGTASALLHI	DESAGLGRLA	KQKPKKKRRP
DSRQYQTAII	IGPDGHPLTV	YPCMICGKKF	KSRGFLKRHM	KNHPEHLAKK
KYHCTDCDYT	TNKKISLHNH	LESHKLTSKA	EKAIECDECG	KHFSHAGALF
THKMVHKEKG	ANKMHKCKFC	EYETAEQGLL	NRHLLAVHSK	NFPHICVECG
KGFRHPSELR	KHMRIHTGEK	PYQCQYCEYR	SADSSNLKTH	IKTKHSKEMP
FKCDICLLTF	SDTKEVQQHT	LVHQESKTHQ	CLHCDHKSSN	SSDLKRHVIS
VHTKDYPHKC	EMCEKGFHRP	SELKKHVAVH	KGKKMHQCRH	CDFKIADPFV
LSRHILSVHT	KDLPFRCKRC	RKGFRQQNEL	KKHMKTHSGR	KVYQCEYCEY
STTDASGFKR	HVISIHTKDY	PHRCEYCKKG	FRRPSEKNQH	IMRHHKEVGL
P

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Palmer M.S., Berta P., Sinclair A.H., Pym B., Goodfellow P.N. (1990). Comparison of human ZFY and ZFX transcripts.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 1681 — 1685. PubMed DOI:10.1073/pnas.87.5.1681
Erlandsson R., Wilson J.F., Paabo S. (2000). Sex chromosomal transposable element accumulation and male-driven substitutional evolution in humans.. Mol. Biol. Evol. 17: 804 — 812. PubMed DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a026359
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Grants J., Flanagan E., Yee A., Romaniuk P.J. (2010). Characterization of the DNA binding activity of the ZFY zinc finger domain.. Biochemistry 49: 679 — 686. PubMed DOI:10.1021/bi9018626
Kochoyan M., Keutmann H.T., Weiss M.A. (1991). Alternating zinc fingers in the human male associated protein ZFY: refinement of the NMR structure of an even finger by selective deuterium labeling and implications for DNA recognition.. Biochemistry 30: 7063 — 7072. PubMed DOI:10.1021/bi00243a005
Lau Y.-F.C., Chan K. (1989). The putative testis-determining factor and related genes are expressed as discrete-sized transcripts in adult gonadal and somatic tissues.. Am. J. Hum. Genet. 45: 942 — 952. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12870 (англ.). Процитовано 13 вересня 2017.
UniProt, P08048 (англ.). Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також

Хромосома Y

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12870 (англ.). Процитовано 13 вересня 2017.

[UniProt-3] UniProt, P08048 (англ.). Процитовано 13 вересня 2017.