ZKSCAN1

ZKSCAN1
Ідентифікатори
Символи	ZKSCAN1, 9130423L19Rik, KOX18, PHZ-37, ZNF139, ZNF36, ZSCAN33, zinc finger with KRAB and SCAN domains 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601260 MGI: 1921820 HomoloGene: 34523 GeneCards: ZKSCAN1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • nucleic acid binding; • зв'язування з іоном металу; • DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	7586
	74570
	ENSG00000106261
	ENSMUSG00000029729
	P17029
	Q8BGS3
NM_001287054; NM_001287055; NM_003439; NM_001346579; NM_001346580;
	NM_001346581
	NM_029869; NM_133906
NP_001273983; NP_001273984; NP_001333508; NP_001333509; NP_001333510;
	NP_003430
	NP_084145; NP_598667
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZKSCAN1 (англ. Zinc finger with KRAB and SCAN domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 563 амінокислот, а молекулярна маса — 63 630[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMTAESREAT	GLSPQAAQEK	DGIVIVKVEE	EDEEDHMWGQ	DSTLQDTPPP
DPEIFRQRFR	RFCYQNTFGP	REALSRLKEL	CHQWLRPEIN	TKEQILELLV
LEQFLSILPK	ELQVWLQEYR	PDSGEEAVTL	LEDLELDLSG	QQVPGQVHGP
EMLARGMVPL	DPVQESSSFD	LHHEATQSHF	KHSSRKPRLL	QSRALPAAHI
PAPPHEGSPR	DQAMASALFT	ADSQAMVKIE	DMAVSLILEE	WGCQNLARRN
LSRDNRQENY	GSAFPQGGEN	RNENEESTSK	AETSEDSASR	GETTGRSQKE
FGEKRDQEGK	TGERQQKNPE	EKTRKEKRDS	GPAIGKDKKT	ITGERGPREK
GKGLGRSFSL	SSNFTTPEEV	PTGTKSHRCD	ECGKCFTRSS	SLIRHKIIHT
GEKPYECSEC	GKAFSLNSNL	VLHQRIHTGE	KPHECNECGK	AFSHSSNLIL
HQRIHSGEKP	YECNECGKAF	SQSSDLTKHQ	RIHTGEKPYE	CSECGKAFNR
NSYLILHRRI	HTREKPYKCT	KCGKAFTRSS	TLTLHHRIHA	RERASEYSPA
SLDAFGAFLK	SCV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Tommerup N., Vissing H. (1995). Isolation and fine mapping of 16 novel human zinc finger-encoding cDNAs identify putative candidate genes for developmental and malignant disorders.. Genomics 27: 259 — 264. PubMed DOI:10.1006/geno.1995.1040
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage.. Cell Rep. 10: 1778 — 1791. PubMed DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Thiesen H.-J. (1990). Multiple genes encoding zinc finger domains are expressed in human T cells.. New Biol. 2: 363 — 374. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13101 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, P17029 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13101 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P17029 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.