Дистрофін

Дистрофін (англ. Dystrophin) – білок, який кодується геном DMD, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 685 амінокислот, а молекулярна маса — 426 750[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLWWEEVEDCYEREDVQKKTFTKWVNAQFSKFGKQHIENLFSDLQDGRRL
LDLLEGLTGQKLPKEKGSTRVHALNNVNKALRVLQNNNVDLVNIGSTDIV
DGNHKLTLGLIWNIILHWQVKNVMKNIMAGLQQTNSEKILLSWVRQSTRN
YPQVNVINFTTSWSDGLALNALIHSHRPDLFDWNSVVCQQSATQRLEHAF
NIARYQLGIEKLLDPEDVDTTYPDKKSILMYITSLFQVLPQQVSIEAIQE
VEMLPRPPKVTKEEHFQLHHQMHYSQQITVSLAQGYERTSSPKPRFKSYA
YTQAAYVTTSDPTRSPFPSQHLEAPEDKSFGSSLMESEVNLDRYQTALEE
VLSWLLSAEDTLQAQGEISNDVEVVKDQFHTHEGYMMDLTAHQGRVGNIL
QLGSKLIGTGKLSEDEETEVQEQMNLLNSRWECLRVASMEKQSNLHRVLM
DLQNQKLKELNDWLTKTEERTRKMEEEPLGPDLEDLKRQVQQHKVLQEDL
EQEQVRVNSLTHMVVVVDESSGDHATAALEEQLKVLGDRWANICRWTEDR
WVLLQDILLKWQRLTEEQCLFSAWLSEKEDAVNKIHTTGFKDQNEMLSSL
QKLAVLKADLEKKKQSMGKLYSLKQDLLSTLKNKSVTQKTEAWLDNFARC
WDNLVQKLEKSTAQISQAVTTTQPSLTQTTVMETVTTVTTREQILVKHAQ
EELPPPPPQKKRQITVDSEIRKRLDVDITELHSWITRSEAVLQSPEFAIF
RKEGNFSDLKEKVNAIEREKAEKFRKLQDASRSAQALVEQMVNEGVNADS
IKQASEQLNSRWIEFCQLLSERLNWLEYQNNIIAFYNQLQQLEQMTTTAE
NWLKIQPTTPSEPTAIKSQLKICKDEVNRLSDLQPQIERLKIQSIALKEK
GQGPMFLDADFVAFTNHFKQVFSDVQAREKELQTIFDTLPPMRYQETMSA
IRTWVQQSETKLSIPQLSVTDYEIMEQRLGELQALQSSLQEQQSGLYYLS
TTVKEMSKKAPSEISRKYQSEFEEIEGRWKKLSSQLVEHCQKLEEQMNKL
RKIQNHIQTLKKWMAEVDVFLKEEWPALGDSEILKKQLKQCRLLVSDIQT
IQPSLNSVNEGGQKIKNEAEPEFASRLETELKELNTQWDHMCQQVYARKE
ALKGGLEKTVSLQKDLSEMHEWMTQAEEEYLERDFEYKTPDELQKAVEEM
KRAKEEAQQKEAKVKLLTESVNSVIAQAPPVAQEALKKELETLTTNYQWL
CTRLNGKCKTLEEVWACWHELLSYLEKANKWLNEVEFKLKTTENIPGGAE
EISEVLDSLENLMRHSEDNPNQIRILAQTLTDGGVMDELINEELETFNSR
WRELHEEAVRRQKLLEQSIQSAQETEKSLHLIQESLTFIDKQLAAYIADK
VDAAQMPQEAQKIQSDLTSHEISLEEMKKHNQGKEAAQRVLSQIDVAQKK
LQDVSMKFRLFQKPANFEQRLQESKMILDEVKMHLPALETKSVEQEVVQS
QLNHCVNLYKSLSEVKSEVEMVIKTGRQIVQKKQTENPKELDERVTALKL
HYNELGAKVTERKQQLEKCLKLSRKMRKEMNVLTEWLAATDMELTKRSAV
EGMPSNLDSEVAWGKATQKEIEKQKVHLKSITEVGEALKTVLGKKETLVE
DKLSLLNSNWIAVTSRAEEWLNLLLEYQKHMETFDQNVDHITKWIIQADT
LLDESEKKKPQQKEDVLKRLKAELNDIRPKVDSTRDQAANLMANRGDHCR
KLVEPQISELNHRFAAISHRIKTGKASIPLKELEQFNSDIQKLLEPLEAE
IQQGVNLKEEDFNKDMNEDNEGTVKELLQRGDNLQQRITDERKREEIKIK
QQLLQTKHNALKDLRSQRRKKALEISHQWYQYKRQADDLLKCLDDIEKKL
ASLPEPRDERKIKEIDRELQKKKEELNAVRRQAEGLSEDGAAMAVEPTQI
QLSKRWREIESKFAQFRRLNFAQIHTVREETMMVMTEDMPLEISYVPSTY
LTEITHVSQALLEVEQLLNAPDLCAKDFEDLFKQEESLKNIKDSLQQSSG
RIDIIHSKKTAALQSATPVERVKLQEALSQLDFQWEKVNKMYKDRQGRFD
RSVEKWRRFHYDIKIFNQWLTEAEQFLRKTQIPENWEHAKYKWYLKELQD
GIGQRQTVVRTLNATGEEIIQQSSKTDASILQEKLGSLNLRWQEVCKQLS
DRKKRLEEQKNILSEFQRDLNEFVLWLEEADNIASIPLEPGKEQQLKEKL
EQVKLLVEELPLRQGILKQLNETGGPVLVSAPISPEEQDKLENKLKQTNL
QWIKVSRALPEKQGEIEAQIKDLGQLEKKLEDLEEQLNHLLLWLSPIRNQ
LEIYNQPNQEGPFDVKETEIAVQAKQPDVEEILSKGQHLYKEKPATQPVK
RKLEDLSSEWKAVNRLLQELRAKQPDLAPGLTTIGASPTQTVTLVTQPVV
TKETAISKLEMPSSLMLEVPALADFNRAWTELTDWLSLLDQVIKSQRVMV
GDLEDINEMIIKQKATMQDLEQRRPQLEELITAAQNLKNKTSNQEARTII
TDRIERIQNQWDEVQEHLQNRRQQLNEMLKDSTQWLEAKEEAEQVLGQAR
AKLESWKEGPYTVDAIQKKITETKQLAKDLRQWQTNVDVANDLALKLLRD
YSADDTRKVHMITENINASWRSIHKRVSEREAALEETHRLLQQFPLDLEK
FLAWLTEAETTANVLQDATRKERLLEDSKGVKELMKQWQDLQGEIEAHTD
VYHNLDENSQKILRSLEGSDDAVLLQRRLDNMNFKWSELRKKSLNIRSHL
EASSDQWKRLHLSLQELLVWLQLKDDELSRQAPIGGDFPAVQKQNDVHRA
FKRELKTKEPVIMSTLETVRIFLTEQPLEGLEKLYQEPRELPPEERAQNV
TRLLRKQAEEVNTEWEKLNLHSADWQRKIDETLERLQELQEATDELDLKL
RQAEVIKGSWQPVGDLLIDSLQDHLEKVKALRGEIAPLKENVSHVNDLAR
QLTTLGIQLSPYNLSTLEDLNTRWKLLQVAVEDRVRQLHEAHRDFGPASQ
HFLSTSVQGPWERAISPNKVPYYINHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNN
VRFSAYRTAMKLRRLQKALCLDLLSLSAACDALDQHNLKQNDQPMDILQI
INCLTTIYDRLEQEHNNLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFK
TGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASSTGFCDQRRLGLLLHDSIQIPRQLGE
VASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWMRLEPQSMVWLPVLHR
VAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGH
KMHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTV
LEGDNMETPVTLINFWPVDSAPASSPQLSHDDTHSRIEHYASRLAEMENS
NGSYLNDSISPNESIDDEHLLIQHYCQSLNQDSPLSQPRSPAQILISLES
EERGELERILADLEEENRNLQAEYDRLKQQHEHKGLSPLPSPPEMMPTSP
QSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLESQLHRLRQLLEQP
QAEAKVNGTTVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSDSMGEEDLLSPPQ
DTSTGLEEVMEQLNNSFPSSRGRNTPGKPMREDTM
Дистрофін
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи DMD, BMD, CMD3B, DXS142, DXS164, DXS206, DXS230, DXS239, DXS268, DXS269, DXS270, DXS272, MRX85, dystrophin
Зовнішні ІД OMIM: 300377 MGI: 94909 HomoloGene: 20856 GeneCards: DMD
Пов'язані генетичні захворювання
м'язова дистрофія Дюшена, dilated cardiomyopathy 3B, progressive muscular dystrophy[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1756
13405
Ensembl
ENSG00000198947
ENSMUSG00000045103
UniProt
P11532
P11531
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC) Хр. X: 31.1 – 33.34 Mb Хр. X: 82.95 – 85.21 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Цей білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

  • Koenig M., Monaco A.P., Kunkel L.M. (1988). The complete sequence of dystrophin predicts a rod-shaped cytoskeletal protein.. Cell 53: 219 — 228. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(88)90383-2
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Feener C.A., Koenig M., Kunkel L.M. (1989). Alternative splicing of human dystrophin mRNA generates isoforms at the carboxy terminus.. Nature 338: 509 — 511. PubMed DOI:10.1038/338509a0
  • Chamberlain J.S., Gibbs R.A., Ranier J.A., Nguyen P.N., Caskey C.T. (1988). Deletion screening of the Duchenne muscular dystrophy locus via multiplex DNA amplification.. Nucleic Acids Res. 16: 11141 — 11156. PubMed DOI:10.1093/nar/16.23.11141
  • Austin R.C., Howard P.L., D'Souza V.N., Klamut H.J., Ray P.N. (1995). Cloning and characterization of alternatively spliced isoforms of Dp71.. Hum. Mol. Genet. 4: 1475 — 1483. PubMed DOI:10.1093/hmg/4.9.1475
  • Jung D., Yang B., Meyer J., Chamberlain J.S., Campbell K.P. (1995). Identification and characterization of the dystrophin anchoring site on beta-dystroglycan.. J. Biol. Chem. 270: 27305 — 27310. PubMed DOI:10.1074/jbc.270.45.27305

Примітки

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.