Експортин-5
XPO5 (англ. Exportin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 204 амінокислот, а молекулярна маса — 136 311[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MAMDQVNALC | EQLVKAVTVM | MDPNSTQRYR | LEALKFCEEF | KEKCPICVPC | ||||
| GLRLAEKTQV | AIVRHFGLQI | LEHVVKFRWN | GMSRLEKVYL | KNSVMELIAN | ||||
| GTLNILEEEN | HIKDALSRIV | VEMIKREWPQ | HWPDMLIELD | TLSKQGETQT | ||||
| ELVMFILLRL | AEDVVTFQTL | PPQRRRDIQQ | TLTQNMERIF | SFLLNTLQEN | ||||
| VNKYQQVKTD | TSQESKAQAN | CRVGVAALNT | LAGYIDWVSM | SHITAENCKL | ||||
| LEILCLLLNE | QELQLGAAEC | LLIAVSRKGK | LEDRKPLMVL | FGDVAMHYIL | ||||
| SAAQTADGGG | LVEKHYVFLK | RLCQVLCALG | NQLCALLGAD | SDVETPSNFG | ||||
| KYLESFLAFT | THPSQFLRSS | TQMTWGALFR | HEILSRDPLL | LAIIPKYLRA | ||||
| SMTNLVKMGF | PSKTDSPSCE | YSRFDFDSDE | DFNAFFNSSR | AQQGEVMRLA | ||||
| CRLDPKTSFQ | MAGEWLKYQL | STFLDAGSVN | SCSAVGTGEG | SLCSVFSPSF | ||||
| VQWEAMTLFL | ESVITQMFRT | LNREEIPVND | GIELLQMVLN | FDTKDPLILS | ||||
| CVLTNVSALF | PFVTYRPEFL | PQVFSKLFSS | VTFETVEESK | APRTRAVRNV | ||||
| RRHACSSIIK | MCRDYPQLVL | PNFDMLYNHV | KQLLSNELLL | TQMEKCALME | ||||
| ALVLISNQFK | NYERQKVFLE | ELMAPVASIW | LSQDMHRVLS | DVDAFIAYVG | ||||
| TDQKSCDPGL | EDPCGLNRAR | MSFCVYSILG | VVKRTCWPTD | LEEAKAGGFV | ||||
| VGYTSSGNPI | FRNPCTEQIL | KLLDNLLALI | RTHNTLYAPE | MLAKMAEPFT | ||||
| KALDMLDAEK | SAILGLPQPL | LELNDSPVFK | TVLERMQRFF | STLYENCFHI | ||||
| LGKAGPSMQQ | DFYTVEDLAT | QLLSSAFVNL | NNIPDYRLRP | MLRVFVKPLV | ||||
| LFCPPEHYEA | LVSPILGPLF | TYLHMRLSQK | WQVINQRSLL | CGEDEAADEN | ||||
| PESQEMLEEQ | LVRMLTREVM | DLITVCCVSK | KGADHSSAPP | ADGDDEEMMA | ||||
| TEVTPSAMAE | LTDLGKCLMK | HEDVCTALLI | TAFNSLAWKD | TLSCQRTTSQ | ||||
| LCWPLLKQVL | SGTLLADAVT | WLFTSVLKGL | QMHGQHDGCM | ASLVHLAFQI | ||||
| YEALRPRYLE | IRAVMEQIPE | IQKDSLDQFD | CKLLNPSLQK | VADKRRKDQF | ||||
| KRLIAGCIGK | PLGEQFRKEV | HIKNLPSLFK | KTKPMLETEV | LDNDGGGLAT | ||||
| IFEP |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, РНК-залежне заглушення генів, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК, тРНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Brownawell A.M., Macara I.G. (2002). Exportin-5, a novel karyopherin, mediates nuclear export of double-stranded RNA binding proteins.. J. Cell Biol. 156: 53 — 64. PubMed DOI:10.1083/jcb.200110082
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Calado A., Treichel N., Mueller E.-C., Otto A., Kutay U. (2002). Exportin-5-mediated nuclear export of eukaryotic elongation factor 1A and tRNA.. EMBO J. 21: 6216 — 6224. PubMed DOI:10.1093/emboj/cdf620
- Yi R., Qin Y., Macara I.G., Cullen B.R. (2003). Exportin-5 mediates the nuclear export of pre-microRNAs and short hairpin RNAs.. Genes Dev. 17: 3011 — 3016. PubMed DOI:10.1101/gad.1158803
- Chen T., Brownawell A.M., Macara I.G. (2004). Nucleocytoplasmic shuttling of JAZ, a new cargo protein for exportin-5.. Mol. Cell. Biol. 24: 6608 — 6619. PubMed DOI:10.1128/MCB.24.15.6608-6619.2004
- Bohnsack M.T., Czaplinski K., Goerlich D. (2004). Exportin 5 is a RanGTP-dependent dsRNA-binding protein that mediates nuclear export of pre-miRNAs.. RNA 10: 185 — 191. PubMed DOI:10.1261/rna.5167604
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17675 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
- UniProt, Q9HAV4 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.