Кератин-1

Кератин-1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4ZRY
Ідентифікатори
Символи	KRT1, CK1, EHK, EHK1, EPPK, K1, KRT1A, NEPPK, keratin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 139350 MGI: 96698 HomoloGene: 38146 GeneCards: KRT1
Пов'язані генетичні захворювання
	epidermolytic hyperkeratosis[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • structural molecule activity; • carbohydrate binding; • structural constituent of skin epidermis; • signaling receptor activity; • protein heterodimerization activity;
Клітинна компонента	• Проміжні філаменти; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • blood microparticle; • клітинна мембрана; • keratin filament; • Цитоскелет; • мембрана; • клітинне ядро; • Екзосома; • extracellular region; • extracellular space; • гіалоплазма; • ficolin-1-rich granule lumen; • cornified envelope; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• complement activation, lectin pathway; • retina homeostasis; • regulation of angiogenesis; • negative regulation of inflammatory response; • response to oxidative stress; • Фібриноліз; • establishment of skin barrier; • keratinization; • neutrophil degranulation; • cornification; • peptide cross-linking; • protein heterotetramerization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3848
	16678
	ENSG00000167768
	ENSMUSG00000046834
	P04264
	P04104
	NM_006121
	NM_008473
	NP_006112
	NP_032499
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Кератин-1 (англ. Keratin 1) — білок, який кодується геном KRT1, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 644 амінокислот, а молекулярна маса — 66 039[5]. Належить до великої родини кератинів — структурних білків цитоскелету.

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRQFSSRSG	YRSGGGFSSG	SAGIINYQRR	TTSSSTRRSG	GGGGRFSSCG
GGGGSFGAGG	GFGSRSLVNL	GGSKSISISV	ARGGGRGSGF	GGGYGGGGFG
GGGFGGGGFG	GGGIGGGGFG	GFGSGGGGFG	GGGFGGGGYG	GGYGPVCPPG
GIQEVTINQS	LLQPLNVEID	PEIQKVKSRE	REQIKSLNNQ	FASFIDKVRF
LEQQNQVLQT	KWELLQQVDT	STRTHNLEPY	FESFINNLRR	RVDQLKSDQS
RLDSELKNMQ	DMVEDYRNKY	EDEINKRTNA	ENEFVTIKKD	VDGAYMTKVD
LQAKLDNLQQ	EIDFLTALYQ	AELSQMQTQI	SETNVILSMD	NNRSLDLDSI
IAEVKAQYED	IAQKSKAEAE	SLYQSKYEEL	QITAGRHGDS	VRNSKIEISE
LNRVIQRLRS	EIDNVKKQIS	NLQQSISDAE	QRGENALKDA	KNKLNDLEDA
LQQAKEDLAR	LLRDYQELMN	TKLALDLEIA	TYRTLLEGEE	SRMSGECAPN
VSVSVSTSHT	TISGGGSRGG	GGGGYGSGGS	SYGSGGGSYG	SGGGGGGGRG
SYGSGGSSYG	SGGGSYGSGG	GGGGHGSYGS	GSSSGGYRGG	SGGGGGGSSG
GRGSGGGSSG	GSIGGRGSSS	GGVKSSGGSS	SVKFVSTTYS	GVTR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані.

Література

Johnson L.D., Idler W.W., Zhou X.-M., Roop D.R., Steinert P.M. (1985). Structure of a gene for the human epidermal 67-kDa keratin.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 82: 1896 — 1900. PubMed DOI:10.1073/pnas.82.7.1896
Whittock N.V., Eady R.A.J., McGrath J.A. (2000). Genomic organization and amplification of the human epidermal type II keratin genes K1 and K5.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 274: 149 — 152. PubMed DOI:10.1006/bbrc.2000.3110
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Senshu T., Kan S., Ogawa H., Manabe M., Asaga H. (1996). Preferential deimination of keratin K1 and filaggrin during the terminal differentiation of human epidermis.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 225: 712 — 719. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1996.1240
Wang W., Sumiyoshi H., Yoshioka H., Fujiwara S. (2006). Interactions between epiplakin and intermediate filaments.. J. Dermatol. 33: 518 — 527. PubMed DOI:10.1111/j.1346-8138.2006.00127.x
Chuang N.N., Huang C.C. (2007). Interaction of integrin beta1 with cytokeratin 1 in neuroblastoma NMB7 cells.. Biochem. Soc. Trans. 35: 1292 — 1294. PubMed DOI:10.1042/BST0351292

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з Кератин-1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6412 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.
UniProt, P04264 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з Кератин-1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6412 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P04264 (англ.). Процитовано 30 січня 2017.