Лізил-тРНК-синтаза

KARS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3BJU, 4DPG, 4YCU, 4YCW
Ідентифікатори
Символи	KARS1, CMTRIB, DFNB89, KARS2, KRS, Lysyl-tRNA synthetase, KARS, lysyl-tRNA synthetase 1, LEPID, DEAPLE
Зовнішні ІД	OMIM: 601421 MGI: 1934754 HomoloGene: 4053 GeneCards: KARS1
Пов'язані генетичні захворювання
	Charcot-Marie-Tooth disease recessive intermediate B, autosomal recessive nonsyndromic deafness 89[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• aminoacyl-tRNA ligase activity; • nucleotide binding; • amino acid binding; • tRNA binding; • lysine-tRNA ligase activity; • ligase activity; • GO:0001948 protein binding; • nucleic acid binding; • ATP binding; • ATP adenylyltransferase activity; • protein homodimerization activity; • transferase activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • клітинна мембрана; • extracellular region; • мітохондріальний матрикс; • мітохондрія; • extracellular space; • aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• Біосинтез білків; • tRNA processing; • tRNA aminoacylation for protein translation; • lysyl-tRNA aminoacylation; • GO:0022415 viral process; • basophil activation involved in immune response; • negative regulation of cell population proliferation; • positive regulation of macrophage chemotaxis; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • positive regulation of macrophage activation; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response; • positive regulation of p38MAPK cascade; • positive regulation of metallopeptidase activity; • diadenosine tetraphosphate biosynthetic process; • response to X-ray;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3735
	85305
	ENSG00000065427
	ENSMUSG00000031948
	Q15046
	Q99MN1
	NM_005548; NM_001130089; NM_001378148
	NM_001130868; NM_001286384; NM_053092; NM_001363429; NM_001363430
	NP_001123561; NP_005539; NP_001365077
	NP_001124340; NP_001273313; NP_444322; NP_001350358; NP_001350359
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

KARS (англ. Lysyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людини на короткому плечі 16-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 597 амінокислот, а молекулярна маса — 68 048[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAVQAAEVK	VDGSEPKLSK	NELKRRLKAE	KKVAEKEAKQ	KELSEKQLSQ
ATAAATNHTT	DNGVGPEEES	VDPNQYYKIR	SQAIHQLKVN	GEDPYPHKFH
VDISLTDFIQ	KYSHLQPGDH	LTDITLKVAG	RIHAKRASGG	KLIFYDLRGE
GVKLQVMANS	RNYKSEEEFI	HINNKLRRGD	IIGVQGNPGK	TKKGELSIIP
YEITLLSPCL	HMLPHLHFGL	KDKETRYRQR	YLDLILNDFV	RQKFIIRSKI
ITYIRSFLDE	LGFLEIETPM	MNIIPGGAVA	KPFITYHNEL	DMNLYMRIAP
ELYHKMLVVG	GIDRVYEIGR	QFRNEGIDLT	HNPEFTTCEF	YMAYADYHDL
MEITEKMVSG	MVKHITGSYK	VTYHPDGPEG	QAYDVDFTPP	FRRINMVEEL
EKALGMKLPE	TNLFETEETR	KILDDICVAK	AVECPPPRTT	ARLLDKLVGE
FLEVTCINPT	FICDHPQIMS	PLAKWHRSKE	GLTERFELFV	MKKEICNAYT
ELNDPMRQRQ	LFEEQAKAKA	AGDDEAMFID	ENFCTALEYG	LPPTAGWGMG
IDRVAMFLTD	SNNIKEVLLF	PAMKPEDKKE	NVATTDTLES	TTVGTSV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії. Також секретований назовні.

Література

Tolkunova E., Park H., Xia J., King M.P., Davidson E. (2000). The human lysyl-tRNA synthetase gene encodes both the cytoplasmic and mitochondrial enzymes by means of an unusual alternative splicing of the primary transcript.. J. Biol. Chem. 275: 35063 — 35069. PubMed DOI:10.1074/jbc.M006265200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Zamecnik P.C., Stephenson M.L., Janeway C.M., Randerath K. (1966). Enzymatic synthesis of diadenosine tetraphosphate and diadenosine triphosphate with a purified lysyl-tRNA synthetase.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 24: 91 — 97. PubMed DOI:10.1016/0006-291X(66)90415-3
Quevillon S., Robinson J.-C., Berthonneau E., Siatecka M., Mirande M. (1999). Macromolecular assemblage of aminoacyl-tRNA synthetases: identification of protein-protein interactions and characterization of a core protein.. J. Mol. Biol. 285: 183 — 195. PubMed DOI:10.1006/jmbi.1998.2316
Tan M., Wei C., Price C.M. (2003). The telomeric protein Rap1 is conserved in vertebrates and is expressed from a bidirectional promoter positioned between the Rap1 and KARS genes.. Gene 323: 1 — 10. PubMed DOI:10.1016/j.gene.2003.08.026
Lee Y.N., Nechushtan H., Figov N., Razin E. (2004). The function of lysyl-tRNA synthetase and Ap4A as signaling regulators of MITF activity in FcepsilonRI-activated mast cells.. Immunity 20: 145 — 151. PubMed DOI:10.1016/S1074-7613(04)00020-2

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з KARS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6215 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
UniProt, Q15046 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з KARS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6215 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q15046 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.