Лімфотоксин альфа

LTA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1TNR, 4MXV, 4MXW
Ідентифікатори
Символи	LTA, LT, TNFB, TNFSF1, Lymphotoxin alpha, TNLG1E
Зовнішні ІД	OMIM: 153440 MGI: 104797 HomoloGene: 497 GeneCards: LTA
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity; • tumor necrosis factor receptor binding; • signaling receptor binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • клітинна мембрана; • extracellular region; • extracellular space;
Біологічний процес	• positive regulation of chronic inflammatory response to antigenic stimulus; • response to hypoxia; • response to nutrient; • cell-cell signaling; • positive regulation of humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin; • positive regulation of interferon-gamma production; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • response to lipopolysaccharide; • humoral immune response; • Імунна відповідь; • positive regulation of apoptotic process; • lymph node development; • positive regulation of glial cell proliferation; • negative regulation of fibroblast proliferation; • Сигнальна трансдукція; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium; • Апоптоз; • regulation of signaling receptor activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	4049
	16992
ENSG00000231408; ENSG00000223919; ENSG00000173503; ENSG00000226275; ENSG00000230279;
	ENSG00000238130; ENSG00000226979
	ENSMUSG00000024402
	P01374
	P09225
	NM_000595; NM_001159740
	NM_010735
	NP_000586; NP_001153212
	NP_034865
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LTA (англ. Lymphotoxin alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 205 амінокислот, а молекулярна маса — 22 297[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTPPERLFLP	RVCGTTLHLL	LLGLLLVLLP	GAQGLPGVGL	TPSAAQTARQ
HPKMHLAHST	LKPAAHLIGD	PSKQNSLLWR	ANTDRAFLQD	GFSLSNNSLL
VPTSGIYFVY	SQVVFSGKAY	SPKATSSPLY	LAHEVQLFSS	QYPFHVPLLS
SQKMVYPGLQ	EPWLHSMYHG	AAFQLTQGDQ	LSTHTDGIPH	LVLSPSTVFF
GAFAL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

Matsuyama N., Okawa N., Tsukii Y., Endo T., Kaji A. (1992). Nucleotide sequence of a cDNA encoding human tumor necrosis factor beta from B lymphoblastoid cell RPMI 1788.. FEBS Lett. 302: 141 — 144. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(92)80425-G
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Voigt C.G., Maurer-Fogy I., Adolf G.R. (1992). Natural human tumor necrosis factor beta (lymphotoxin). Variable O-glycosylation at Thr7, proteolytic processing, and allelic variation.. FEBS Lett. 314: 85 — 88. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(92)81467-Z
Abraham L.J., Du D.C., Zahedi K., Dawkins R.L., Whitehead A.S. (1991). Haplotypic polymorphisms of the TNFB gene.. Immunogenetics 33: 50 — 53. PubMed DOI:10.1007/BF00211695
Kobayashi Y., Miyamoto D., Asada M., Obinata M., Osawa T. (1986). Cloning and expression of human lymphotoxin mRNA derived from a human T cell hybridoma.. J. Biochem. 100: 727 — 733. PubMed
Neville M.J., Campbell R.D. (1999). A new member of the Ig superfamily and a V-ATPase G subunit are among the predicted products of novel genes close to the TNF locus in the human MHC.. J. Immunol. 162: 4745 — 4754. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6709 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P01374 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6709 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P01374 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.