Триптофаніл-тРНК-синтаза

WARS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1O5T, 1R6T, 1R6U, 1ULH, 2AKE, 2AZX, 2DR2, 2QUH, 2QUI, 2QUJ, 2QUK
Ідентифікатори
Символи	WARS1, Tryptophanyl-tRNA synthetase, cytoplasmic, GAMMA-2, IFI53, IFP53, tryptophanyl-tRNA synthetase, HMN9, tryptophanyl-tRNA synthetase 1, WARS
Зовнішні ІД	OMIM: 191050 MGI: 104630 HomoloGene: 3084 GeneCards: WARS1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• aminoacyl-tRNA ligase activity; • nucleotide binding; • ligase activity; • GO:0001948 protein binding; • ATP binding; • tryptophan-tRNA ligase activity; • kinase inhibitor activity; • protein kinase binding; • protein domain specific binding; • protein homodimerization activity;
Клітинна компонента	• Екзосома; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• regulation of angiogenesis; • Біосинтез білків; • tRNA aminoacylation for protein translation; • Ангіогенез; • negative regulation of cell population proliferation; • tryptophanyl-tRNA aminoacylation; • negative regulation of protein phosphorylation; • negative regulation of protein kinase activity; • positive regulation of gene expression; • regulation of protein ADP-ribosylation; • positive regulation of protein-containing complex assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	7453
	22375
	ENSG00000140105
	ENSMUSG00000021266
	P23381
	P32921
	NM_004184; NM_173701; NM_213645; NM_213646
	NM_001164314; NM_001164488; NM_011710
	NP_004175; NP_776049; NP_998810; NP_998811
	NP_001157786; NP_001157960; NP_035840
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

WARS (англ. Tryptophanyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 471 амінокислот, а молекулярна маса — 53 165[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPNSEPASLL	ELFNSIATQG	ELVRSLKAGN	ASKDEIDSAV	KMLVSLKMSY
KAAAGEDYKA	DCPPGNPAPT	SNHGPDATEA	EEDFVDPWTV	QTSSAKGIDY
DKLIVRFGSS	KIDKELINRI	ERATGQRPHH	FLRRGIFFSH	RDMNQVLDAY
ENKKPFYLYT	GRGPSSEAMH	VGHLIPFIFT	KWLQDVFNVP	LVIQMTDDEK
YLWKDLTLDQ	AYSYAVENAK	DIIACGFDIN	KTFIFSDLDY	MGMSSGFYKN
VVKIQKHVTF	NQVKGIFGFT	DSDCIGKISF	PAIQAAPSFS	NSFPQIFRDR
TDIQCLIPCA	IDQDPYFRMT	RDVAPRIGYP	KPALLHSTFF	PALQGAQTKM
SASDPNSSIF	LTDTAKQIKT	KVNKHAFSGG	RDTIEEHRQF	GGNCDVDVSF
MYLTFFLEDD	DKLEQIRKDY	TSGAMLTGEL	KKALIEVLQP	LIAEHQARRK
EVTDEIVKEF	MTPRKLSFDF	Q

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ангіогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Fleckner J., Rasmussen H.H., Justesen J. (1991). Human interferon gamma potently induces the synthesis of a 55-kDa protein (gamma 2) highly homologous to rabbit peptide chain release factor and bovine tryptophanyl-tRNA synthetase.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 11520 — 11524. PubMed DOI:10.1073/pnas.88.24.11520
Frolova L.Y., Sudomoina M.A., Grigorieva A.Y., Zinovieva O.L., Kisselev L.L. (1991). Cloning and nucleotide sequence of the structural gene encoding for human tryptophanyl-tRNA synthetase.. Gene 109: 291 — 296. PubMed DOI:10.1016/0378-1119(91)90624-K
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Frolova L.Y., Grigorieva A.Y., Sudomoina M.A., Kisselev L.L. (1993). The human gene encoding tryptophanyl-tRNA synthetase: interferon-response elements and exon-intron organization.. Gene 128: 237 — 245. PubMed DOI:10.1016/0378-1119(93)90568-N
Bange F.-C., Flohr T., Buwitt U., Boettger E.C. (1992). An interferon-induced protein with release factor activity is a tryptophanyl-tRNA synthetase.. FEBS Lett. 300: 162 — 166. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(92)80187-L
Tolstrup A.B., Bejder A., Fleckner J., Justesen J. (1995). Transcriptional regulation of the interferon-gamma-inducible tryptophanyl-tRNA synthetase includes alternative splicing.. J. Biol. Chem. 270: 397 — 403. PubMed DOI:10.1074/jbc.270.1.397

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12729 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P23381 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12729 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P23381 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.