APOBEC3A

APOBEC3A
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2M65, 4XXO
Ідентифікатори
Символи	APOBEC3A, A3A, ARP3, PHRBN, bK150C2.1, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3A
Зовнішні ІД	OMIM: 607109 HomoloGene: 82288 GeneCards: APOBEC3A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines; • cytidine deaminase activity; • zinc ion binding; • hydrolase activity; • GO:0001948 protein binding; • каталітична активність; • зв'язування з іоном металу; • deoxycytidine deaminase activity; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• cellular response to xenobiotic stimulus; • negative regulation of transposition; • DNA demethylation; • negative regulation of viral genome replication; • Вроджений імунітет; • defense response to virus; • DNA cytosine deamination; • immune system process; • cytidine deamination; • cytidine to uridine editing;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	200315
	н/д
	ENSG00000128383; ENSG00000262156
	н/д
	P31941
	н/д
	NM_145699; NM_001270406
	н/д
	NP_001257335; NP_663745
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

APOBEC3A (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 199 амінокислот, а молекулярна маса — 23 012[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEASPASGPR	HLMDPHIFTS	NFNNGIGRHK	TYLCYEVERL	DNGTSVKMDQ
HRGFLHNQAK	NLLCGFYGRH	AELRFLDLVP	SLQLDPAQIY	RVTWFISWSP
CFSWGCAGEV	RAFLQENTHV	RLRIFAARIY	DYDPLYKEAL	QMLRDAGAQV
SIMTYDEFKH	CWDTFVDHQG	CPFQPWDGLD	EHSQALSGRL	RAILQNQGN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business.. Trends Genet. 19: 207 — 216. PubMed DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4
Chiu Y.L., Greene W.C. (2008). The APOBEC3 cytidine deaminases: an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements.. Annu. Rev. Immunol. 26: 317 — 353. PubMed DOI:10.1146/annurev.immunol.26.021607.090350
Stenglein M.D., Burns M.B., Li M., Lengyel J., Harris R.S. (2010). APOBEC3 proteins mediate the clearance of foreign DNA from human cells.. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 222 — 229. PubMed DOI:10.1038/nsmb.1744
Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain.. Cell 145: 423 — 434. PubMed DOI:10.1016/j.cell.2011.03.022
Landry S., Narvaiza I., Linfesty D.C., Weitzman M.D. (2011). APOBEC3A can activate the DNA damage response and cause cell-cycle arrest.. EMBO Rep. 12: 444 — 450. PubMed DOI:10.1038/embor.2011.46

Примітки

Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17343 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
UniProt, P31941 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 22

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17343 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

[UniProt-3] UniProt, P31941 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.