APOBEC3C

APOBEC3C (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 190 амінокислот, а молекулярна маса — 22 826[3].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNPQIRNPMKAMYPGTFYFQFKNLWEANDRNETWLCFTVEGIKRRSVVSW
KTGVFRNQVDSETHCHAERCFLSWFCDDILSPNTKYQVTWYTSWSPCPDC
AGEVAEFLARHSNVNLTIFTARLYYFQYPCYQEGLRSLSQEGVAVEIMDY
EDFKYCWENFVYNDNEPFKPWKGLKTNFRLLKRRLRESLQ
APOBEC3C
Наявні структури
PDBПошук для людей: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи APOBEC3C, A3C, APOBEC1L, ARDC2, ARDC4, ARP5, PBI, bK150C2.3, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C
Зовнішні ІД OMIM: 607750 HomoloGene: 129856 GeneCards: APOBEC3C
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
27350
н/д
Ensembl
ENSG00000244509
н/д
UniProt
Q9NRW3
н/д
RefSeq (мРНК)
NM_014508
н/д
RefSeq (білок)
NP_055323
н/д
Локус (UCSC) Хр. 22: 39.01 – 39.02 Mb н/д
PubMed search [1] н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Chiu Y.L., Greene W.C. (2008). The APOBEC3 cytidine deaminases: an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements.. Annu. Rev. Immunol. 26: 317 — 353. PubMed DOI:10.1146/annurev.immunol.26.021607.090350
  • Bonvin M., Greeve J. (2008). Hepatitis B: modern concepts in pathogenesis--APOBEC3 cytidine deaminases as effectors in innate immunity against the hepatitis B virus.. Curr. Opin. Infect. Dis. 21: 298 — 303. PubMed DOI:10.1097/QCO.0b013e3282fe1bb2
  • Stenglein M.D., Burns M.B., Li M., Lengyel J., Harris R.S. (2010). APOBEC3 proteins mediate the clearance of foreign DNA from human cells.. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 222 — 229. PubMed DOI:10.1038/nsmb.1744
  • Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain.. Cell 145: 423 — 434. PubMed DOI:10.1016/j.cell.2011.03.022
  • Arias J.F., Koyama T., Kinomoto M., Tokunaga K. (2012). Retroelements versus APOBEC3 family members: No great escape from the magnificent seven.. Front. Microbiol. 3: 275 — 275. PubMed DOI:10.3389/fmicb.2012.00275

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17353 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
  3. UniProt, Q9NRW3 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.