APOBEC3H

APOBEC3H
Ідентифікатори
Символи	APOBEC3H, A3H, ARP-10, ARP10, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3H
Зовнішні ІД	OMIM: 610976 HomoloGene: 52306 GeneCards: APOBEC3H
Онтологія гена
Молекулярна функція	• hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines; • cytidine deaminase activity; • zinc ion binding; • GO:0001948 protein binding; • каталітична активність; • hydrolase activity; • зв'язування з іоном металу; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • P-body; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• negative regulation of transposition; • Вроджений імунітет; • defense response to virus; • DNA cytosine deamination; • negative regulation of viral process; • negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate; • immune system process; • cytidine deamination; • cytidine to uridine editing; • DNA demethylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	164668
	н/д
	ENSG00000100298
	н/д
	Q6NTF7
	н/д
	NM_001166002; NM_001166003; NM_001166004; NM_181773
	н/д
	NP_001159474; NP_001159475; NP_001159476; NP_861438
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

APOBEC3H (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3H) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 200 амінокислот, а молекулярна маса — 23 531[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALLTAETFR	LQFNNKRRLR	RPYYPRKALL	CYQLTPQNGS	TPTRGYFENK
KKCHAEICFI	NEIKSMGLDE	TQCYQVTCYL	TWSPCSSCAW	ELVDFIKAHD
HLNLGIFASR	LYYHWCKPQQ	KGLRLLCGSQ	VPVEVMGFPK	FADCWENFVD
HEKPLSFNPY	KMLEELDKNS	RAIKRRLERI	KIPGVRAQGR	YMDILCDAEV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Harari A., Ooms M., Mulder L.C., Simon V. (2009). Polymorphisms and splice variants influence the antiretroviral activity of human APOBEC3H.. J. Virol. 83: 295 — 303. PubMed DOI:10.1128/JVI.01665-08
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business.. Trends Genet. 19: 207 — 216. PubMed DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4
OhAinle M., Kerns J.A., Malik H.S., Emerman M. (2006). Adaptive evolution and antiviral activity of the conserved mammalian cytidine deaminase APOBEC3H.. J. Virol. 80: 3853 — 3862. PubMed DOI:10.1128/JVI.80.8.3853-3862.2006
Dang Y., Wang X., Esselman W.J., Zheng Y.-H. (2006). Identification of APOBEC3DE as another antiretroviral factor from the human APOBEC family.. J. Virol. 80: 10522 — 10533. PubMed DOI:10.1128/JVI.01123-06
Chiu Y.L., Greene W.C. (2008). The APOBEC3 cytidine deaminases: an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements.. Annu. Rev. Immunol. 26: 317 — 353. PubMed DOI:10.1146/annurev.immunol.26.021607.090350

Примітки

Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24100 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
UniProt, Q6NTF7 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 22

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24100 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

[UniProt-3] UniProt, Q6NTF7 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.