ATF6

ATF6
Ідентифікатори
Символи	ATF6, ATF6A, ACHM7, activating transcription factor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 605537 MGI: 1926157 HomoloGene: 32015 GeneCards: ATF6
Пов'язані генетичні захворювання
	хвороба Паркінсона, achromatopsia 7[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • GO:0001948 protein binding; • identical protein binding; • protein heterodimerization activity; • ubiquitin protein ligase binding; • cAMP response element binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • комплекс Ґольджі; • nuclear envelope; • мембрана; • endoplasmic reticulum membrane; • Golgi membrane; • Нуклеоплазма; • integral component of endoplasmic reticulum membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • клітинне ядро; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• розвиток ока; • regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • Відповідь на незгорнуті білки; • ATF6-mediated unfolded protein response; • response to unfolded protein; • Згортання білків; • Сигнальна трансдукція; • зір; • positive regulation of apoptotic process; • transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of ATF6-mediated unfolded protein response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	22926
	226641
	ENSG00000118217
	ENSMUSG00000026663
	P18850
	F6VAN0
	NM_007348
	NM_001081304
	NP_031374
	NP_001074773
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ATF6 (англ. Activating transcription factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 670 амінокислот, а молекулярна маса — 74 585[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGEPAGVAGT	MESPFSPGLF	HRLDEDWDSA	LFAELGYFTD	TDELQLEAAN
ETYENNFDNL	DFDLDLMPWE	SDIWDINNQI	CTVKDIKAEP	QPLSPASSSY
SVSSPRSVDS	YSSTQHVPEE	LDLSSSSQMS	PLSLYGENSN	SLSSAEPLKE
DKPVTGPRNK	TENGLTPKKK	IQVNSKPSIQ	PKPLLLPAAP	KTQTNSSVPA
KTIIIQTVPT	LMPLAKQQPI	ISLQPAPTKG	QTVLLSQPTV	VQLQAPGVLP
SAQPVLAVAG	GVTQLPNHVV	NVVPAPSANS	PVNGKLSVTK	PVLQSTMRNV
GSDIAVLRRQ	QRMIKNRESA	CQSRKKKKEY	MLGLEARLKA	ALSENEQLKK
ENGTLKRQLD	EVVSENQRLK	VPSPKRRVVC	VMIVLAFIIL	NYGPMSMLEQ
DSRRMNPSVS	PANQRRHLLG	FSAKEAQDTS	DGIIQKNSYR	YDHSVSNDKA
LMVLTEEPLL	YIPPPPCQPL	INTTESLRLN	HELRGWVHRH	EVERTKSRRM
TNNQQKTRIL	QGALEQGSNS	QLMAVQYTET	TSSISRNSGS	ELQVYYASPR
SYQDFFEAIR	RRGDTFYVVS	FRRDHLLLPA	TTHNKTTRPK	MSIVLPAINI
NENVINGQDY	EVMMQIDCQV	MDTRILHIKS	SSVPPYLRDQ	QRNQTNTFFG
SPPAATEATH	VVSTIPESLQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, відповідь на порушення конформації білку, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Zhu C., Johansen F.E., Prywes R. (1997). Interaction of ATF6 and serum response factor.. Mol. Cell. Biol. 17: 4957 — 4966. PubMed DOI:10.1128/MCB.17.9.4957
Yoshida H., Haze K., Yanagi H., Yura T., Mori K. (1998). Identification of the cis-acting endoplasmic reticulum stress response element responsible for transcriptional induction of mammalian glucose-regulated proteins; involvement of basic-leucine zipper transcription factors.. J. Biol. Chem. 273: 33741 — 33749. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.50.33741
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers.. Genes Dev. 3: 2083 — 2090. PubMed DOI:10.1101/gad.3.12b.2083
Haze K., Yoshida H., Yanagi H., Yura T., Mori K. (1999). Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress.. Mol. Biol. Cell 10: 3787 — 3799. PubMed DOI:10.1091/mbc.10.11.3787
Yoshida H., Matsui T., Yamamoto A., Okada T., Mori K. (2001). XBP1 mRNA is induced by ATF6 and spliced by IRE1 in response to ER stress to produce a highly active transcription factor.. Cell 107: 881 — 891. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(01)00611-0

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з ATF6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:791 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, P18850 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ATF6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:791 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P18850 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.