ATG5

ATG5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4GDK, 4GDL, 4NAW, 4TQ0, 4TQ1, 5D7G
Ідентифікатори
Символи	ATG5, APG5, APG5-LIKE, APG5L, ASP, hAPG5, autophagy related 5, SCAR25
Зовнішні ІД	OMIM: 604261 MGI: 1277186 HomoloGene: 3566 GeneCards: ATG5
Пов'язані генетичні захворювання
	ревматоїдний артрит, spinocerebellar ataxia, autosomal recessive 25[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• Atg8 ligase activity; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • phagophore assembly site membrane; • гіалоплазма; • phagocytic vesicle membrane; • мембрана; • Atg12-Atg5-Atg16 complex; • autophagosome; • GO:0035085 Аксонема; • mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane;
Біологічний процес	• immune system process; • negative regulation of cell death; • C-terminal protein lipidation; • autophagy of nucleus; • cellular response to nitrogen starvation; • Апоптоз; • autophagosome assembly; • autophagy of mitochondrion; • blood vessel remodeling; • cellular response to starvation; • response to fungus; • macroautophagy; • cellular homeostasis; • antigen processing and presentation of endogenous antigen; • negative regulation of protein ubiquitination; • aggrephagy; • negative stranded viral RNA replication; • vasodilation; • negative regulation of apoptotic process; • посттрансляційна модифікація; • negative thymic T cell selection; • otolith development; • negative regulation of phagocytosis; • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol; • ventricular cardiac muscle cell development; • heart contraction; • protein lipidation involved in autophagosome assembly; • positive regulation of mucus secretion; • cellular response to nitrosative stress; • regulation of cilium assembly; • regulation of reactive oxygen species metabolic process; • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process; • negative regulation of histone H4-K16 acetylation; • Автофагія;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	9474
	11793
	ENSG00000057663
	ENSMUSG00000038160
	Q9H1Y0
	Q99J83
	NM_001286106; NM_001286107; NM_001286108; NM_001286111; NM_004849
	NM_053069; NM_001314013; NM_001358596
	NP_001273035; NP_001273036; NP_001273037; NP_001273040; NP_004840
	NP_001300942; NP_444299; NP_001345525
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ATG5 (англ. Autophagy related 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 275 амінокислот, а молекулярна маса — 32 447[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTDDKDVLRD	VWFGRIPTCF	TLYQDEITER	EAEPYYLLLP	RVSYLTLVTD
KVKKHFQKVM	RQEDISEIWF	EYEGTPLKWH	YPIGLLFDLL	ASSSALPWNI
TVHFKSFPEK	DLLHCPSKDA	IEAHFMSCMK	EADALKHKSQ	VINEMQKKDH
KQLWMGLQND	RFDQFWAINR	KLMEYPAEEN	GFRYIPFRIY	QTTTERPFIQ
KLFRPVAADG	QLHTLGDLLK	EVCPSAIDPE	DGEKKNQVMI	HGIEPMLETP
LQWLSEHLSY	PDNFLHISII	PQPTD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Mizushima N., Sugita H., Yoshimori T., Ohsumi Y. (1998). A new protein conjugation system in human. The counterpart of the yeast Apg12p conjugation system essential for autophagy.. J. Biol. Chem. 273: 33889 — 33892. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.51.33889
Tanida I., Tanida-Miyake E., Ueno T., Kominami E. (2001). The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein-activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3.. J. Biol. Chem. 276: 1701 — 1706. PubMed DOI:10.1074/jbc.C000752200
Tanida I., Nishitani T., Nemoto T., Ueno T., Kominami E. (2002). Mammalian Apg12p, but not the Apg12p.Apg5p conjugate, facilitates LC3 processing.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296: 1164 — 1170. PubMed DOI:10.1016/S0006-291X(02)02057-0
Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p.. J. Biol. Chem. 277: 13739 — 13744. PubMed DOI:10.1074/jbc.M200385200
Shao Y., Gao Z., Feldman T., Jiang X. (2007). Stimulation of ATG12-ATG5 conjugation by ribonucleic acid.. Autophagy 3: 10 — 16. PubMed DOI:10.4161/auto.3270

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з ATG5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:589 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, Q9H1Y0 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ATG5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:589 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9H1Y0 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.