CCL13

CCL13
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2RA4
Ідентифікатори
Символи	CCL13, CKb10, MCP-4, NCC-1, NCC1, SCYA13, SCYL1, C-C motif chemokine ligand 13
Зовнішні ІД	OMIM: 601391 HomoloGene: 2241 GeneCards: CCL13
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity; • chemokine activity; • CCR chemokine receptor binding; • signaling receptor binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• extracellular region; • extracellular space;
Біологічний процес	• monocyte chemotaxis; • cell-cell signaling; • eosinophil chemotaxis; • хемотаксис; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • cytoskeleton organization; • Імунна відповідь; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • regulation of cell shape; • Сигнальна трансдукція; • inflammatory response; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; • cellular calcium ion homeostasis; • neutrophil chemotaxis; • lymphocyte chemotaxis; • chemokine-mediated signaling pathway; • cellular response to interferon-gamma; • cellular response to interleukin-1; • cellular response to tumor necrosis factor; • regulation of signaling receptor activity; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • cell chemotaxis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6357
	24770
	ENSG00000181374
	ENSRNOG00000007159
	Q99616
	P14844
	NM_005408
	NM_031530
	NP_005399
	NP_113718
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CCL13 (англ. C-C motif chemokine ligand 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 98 амінокислот, а молекулярна маса — 10 986[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKVSAVLLCL		LLMTAAFNPQ		GLAQPDALNV		PSTCCFTFSS		KKISLQRLKS
YVITTSRCPQ		KAVIFRTKLG		KEICADPKEK		WVQNYMKHLG		RKAHTLKT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, хемотаксис. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Barinka C., Prahl A., Lubkowski J. (2008). Structure of human monocyte chemoattractant protein 4 (MCP-4/CCL13).. Acta Crystallogr. D 64: 273 — 278. PubMed DOI:10.1107/S0907444907066164
Power C.A., Meyer A., Rison S.C.G., Guye-Coulin F., Wells T.N.C. (1996). Cloning and characterization of MCP-4, a novel CC chemokine related to MCP-1 and eotaxin.. Eur. Cytokine Netw. 7: 513 — 513.

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10611 (англ.). Процитовано 21 вересня 2017.
UniProt, Q99616 (англ.). Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10611 (англ.). Процитовано 21 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q99616 (англ.). Процитовано 21 вересня 2017.