CD4

CD4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1CDH, 1CDI, 1CDJ, 1CDU, 1CDY, 1G9M, 1G9N, 1GC1, 1JL4, 1Q68, 1RZJ, 1RZK, 1WIO, 1WIP, 1WIQ, 2B4C, 2JKR, 2JKT, 2KLU, 2NXY, 2NXZ, 2NY0, 2NY1, 2NY2, 2NY3, 2NY4, 2NY5, 2NY6, 2QAD, 3B71, 3CD4, 3JWD, 3JWO, 3LQA, 3O2D, 3S5L, 3T0E, 4JM2, 1WBR, 3S4S, 4H8W, 4P9H, 4Q6I, 4R2G, 4R4H, 4RQS, 3J70, 5A7X, 5A8H, 5CAY
Ідентифікатори
Символи	CD4, CD4mut, CD4 molecule, OKT4D, IMD79
Зовнішні ІД	OMIM: 186940 MGI: 88335 HomoloGene: 513 GeneCards: CD4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transmembrane signaling receptor activity; • virus receptor activity; • protein homodimerization activity; • zinc ion binding; • extracellular matrix structural constituent; • enzyme binding; • immunoglobulin binding; • GO:0001948 protein binding; • coreceptor activity; • interleukin-16 binding; • interleukin-16 receptor activity; • MHC class II protein binding; • identical protein binding; • protein tyrosine kinase binding; • signaling receptor activity; • protein kinase binding; • signaling receptor binding;
Клітинна компонента	• endoplasmic reticulum lumen; • integral component of membrane; • early endosome; • мембрана; • cell surface; • endoplasmic reticulum membrane; • membrane raft; • T cell receptor complex; • external side of plasma membrane; • клітинна мембрана; • clathrin-coated vesicle membrane; • integral component of plasma membrane;
Біологічний процес	• transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • positive regulation of protein kinase activity; • regulation of defense response to virus by virus; • positive regulation of calcium-mediated signaling; • Сигнальна трансдукція; • helper T cell enhancement of adaptive immune response; • T cell selection; • response to estradiol; • induction by virus of host cell-cell fusion; • adaptive immune response; • response to vitamin D; • T cell differentiation; • cell surface receptor signaling pathway; • positive regulation of T cell proliferation; • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • enzyme linked receptor protein signaling pathway; • T cell activation; • positive regulation of T cell activation; • maintenance of protein location in cell; • cytokine production; • T cell receptor signaling pathway; • immune system process; • positive regulation of calcium ion transport into cytosol; • regulation of T cell activation; • Імунна відповідь; • адгезія клітин; • GO:0022415 viral process; • fusion of virus membrane with host plasma membrane; • membrane organization; • positive regulation of protein phosphorylation; • positive regulation of kinase activity; • interleukin-15-mediated signaling pathway; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of MAPK cascade; • positive regulation of monocyte differentiation; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of viral entry into host cell; • regulation of calcium ion transport; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • cellular response to granulocyte macrophage colony-stimulating factor stimulus; • cytokine-mediated signaling pathway; • macrophage differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	920
	12504
	ENSG00000010610
	ENSMUSG00000023274
	P01730
	P06332
NM_000616; NM_001195014; NM_001195015; NM_001195016; NM_001195017;
	NM_001382705; NM_001382706; NM_001382707; NM_001382714
	NM_013488
NP_000607; NP_001181943; NP_001181944; NP_001181945; NP_001181946;
	NP_001369634; NP_001369635; NP_001369636; NP_001369643
	NP_038516
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CD4 (англ. CD4 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 458 амінокислот, а молекулярна маса — 51 111[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNRGVPFRHL	LLVLQLALLP	AATQGKKVVL	GKKGDTVELT	CTASQKKSIQ
FHWKNSNQIK	ILGNQGSFLT	KGPSKLNDRA	DSRRSLWDQG	NFPLIIKNLK
IEDSDTYICE	VEDQKEEVQL	LVFGLTANSD	THLLQGQSLT	LTLESPPGSS
PSVQCRSPRG	KNIQGGKTLS	VSQLELQDSG	TWTCTVLQNQ	KKVEFKIDIV
VLAFQKASSI	VYKKEGEQVE	FSFPLAFTVE	KLTGSGELWW	QAERASSSKS
WITFDLKNKE	VSVKRVTQDP	KLQMGKKLPL	HLTLPQALPQ	YAGSGNLTLA
LEAKTGKLHQ	EVNLVVMRAT	QLQKNLTCEV	WGPTSPKLML	SLKLENKEAK
VSKREKAVWV	LNPEAGMWQC	LLSDSGQVLL	ESNIKVLPTW	STPVQPMALI
VLGGVAGLLL	FIGLGIFFCV	RCRHRRRQAE	RMSQIKRLLS	EKKTCQCPHR
FQKTCSPI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Littman D.R., Maddon P.J., Axel R. (1988). Corrected CD4 sequence.. Cell 55: 541 — 541. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(88)90211-5
Ansari-Lari M.A., Shen Y., Muzny D.M., Lee W., Gibbs R.A. (1997). Large-scale sequencing in human chromosome 12p13: experimental and computational gene structure determination.. Genome Res. 7: 268 — 280. PubMed DOI:10.1101/gr.7.3.268
Hodge T.W., Sasso D.R., McDougal J.S. (1991). Humans with OKT4-epitope deficiency have a single nucleotide base change in the CD4 gene, resulting in substitution of TRP240 for ARG240.. Hum. Immunol. 30: 99 — 104. PubMed DOI:10.1016/0198-8859(91)90077-M
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Fomsgaard A., Hirsch V.M., Johnson P.R. (1992). Cloning and sequences of primate CD4 molecules: diversity of the cellular receptor for simian immunodeficiency virus/human immunodeficiency virus.. Eur. J. Immunol. 22: 2973 — 2981. PubMed DOI:10.1002/eji.1830221132
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites.. Protein Sci. 13: 2819 — 2824. PubMed DOI:10.1110/ps.04682504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1678 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P01730 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1678 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P01730 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.