CD44

CD44
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1POZ, 1UUH, 2I83, 4PZ3, 4PZ4
Ідентифікатори
Символи	CD44, CDW44, CSPG8, ECMR-III, HCELL, HUTCH-I, IN, LHR, MC56, MDU2, MDU3, MIC4, Pgp1, CD44 molecule (Indian blood group)
Зовнішні ІД	OMIM: 107269 MGI: 88338 HomoloGene: 508 GeneCards: CD44
Онтологія гена
Молекулярна функція	• collagen binding; • GO:0001948 protein binding; • hyaluronic acid binding; • cytokine receptor activity; • transmembrane signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • комплекс Ґольджі; • macrophage migration inhibitory factor receptor complex; • мембрана; • focal adhesion; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • Екзосома; • гіалоплазма; • secretory granule membrane; • apical plasma membrane; • lamellipodium membrane; • cell projection; • Мікроворсинки; • basolateral plasma membrane;
Біологічний процес	• negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • monocyte aggregation; • positive regulation of heterotypic cell-cell adhesion; • hyaluronan catabolic process; • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • extracellular matrix disassembly; • extracellular matrix organization; • negative regulation of apoptotic process; • cellular response to fibroblast growth factor stimulus; • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • cartilage development; • адгезія клітин; • negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • cell-matrix adhesion; • positive regulation of monocyte aggregation; • leukocyte migration; • neutrophil degranulation; • wound healing, spreading of cells; • regulation of lamellipodium morphogenesis; • cell-cell adhesion; • inflammatory response; • cell migration; • T cell activation; • positive regulation of kinase activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	960
	12505
	ENSG00000026508
	ENSMUSG00000005087
	P16070
	P15379
NM_000610; NM_001001389; NM_001001390; NM_001001391; NM_001001392;
	NM_001202555; NM_001202556; NM_001202557
NM_001039150; NM_001039151; NM_001177785; NM_001177786; NM_001177787;
	NM_009851
NP_000601; NP_001001389; NP_001001390; NP_001001391; NP_001001392;
	NP_001189484; NP_001189485; NP_001189486
NP_001034239; NP_001034240; NP_001171256; NP_001171257; NP_001171258;
	NP_033981
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CD44 (англ. CD44 molecule (Indian blood group)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 742 амінокислот, а молекулярна маса — 81 538[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDKFWWHAAW	GLCLVPLSLA	QIDLNITCRF	AGVFHVEKNG	RYSISRTEAA
DLCKAFNSTL	PTMAQMEKAL	SIGFETCRYG	FIEGHVVIPR	IHPNSICAAN
NTGVYILTSN	TSQYDTYCFN	ASAPPEEDCT	SVTDLPNAFD	GPITITIVNR
DGTRYVQKGE	YRTNPEDIYP	SNPTDDDVSS	GSSSERSSTS	GGYIFYTFST
VHPIPDEDSP	WITDSTDRIP	ATTLMSTSAT	ATETATKRQE	TWDWFSWLFL
PSESKNHLHT	TTQMAGTSSN	TISAGWEPNE	ENEDERDRHL	SFSGSGIDDD
EDFISSTIST	TPRAFDHTKQ	NQDWTQWNPS	HSNPEVLLQT	TTRMTDVDRN
GTTAYEGNWN	PEAHPPLIHH	EHHEEEETPH	STSTIQATPS	STTEETATQK
EQWFGNRWHE	GYRQTPKEDS	HSTTGTAAAS	AHTSHPMQGR	TTPSPEDSSW
TDFFNPISHP	MGRGHQAGRR	MDMDSSHSIT	LQPTANPNTG	LVEDLDRTGP
LSMTTQQSNS	QSFSTSHEGL	EEDKDHPTTS	TLTSSNRNDV	TGGRRDPNHS
EGSTTLLEGY	TSHYPHTKES	RTFIPVTSAK	TGSFGVTAVT	VGDSNSNVNR
SLSGDQDTFH	PSGGSHTTHG	SESDGHSHGS	QEGGANTTSG	PIRTPQIPEW
LIILASLLAL	ALILAVCIAV	NSRRRCGQKK	KLVINSGNGA	VEDRKPSGLN
GEASKSQEMV	HLVNKESSET	PDQFMTADET	RNLQNVDMKI	GV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Stamenkovic I., Amiot M., Pesando J.M., Seed B. (1989). A lymphocyte molecule implicated in lymph node homing is a member of the cartilage link protein family.. Cell 56: 1057 — 1062. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(89)90638-7
Harn H.-J., Isola N., Cooper D.L. (1991). The multispecific cell adhesion molecule CD44 is represented in reticulocyte cDNA.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 178: 1127 — 1134. PubMed DOI:10.1016/0006-291X(91)91009-2
Dougherty G.J., Lansdorp P.M., Cooper D.L., Humphries R.K. (1991). Molecular cloning of CD44R1 and CD44R2, two novel isoforms of the human CD44 lymphocyte 'homing' receptor expressed by hemopoietic cells.. J. Exp. Med. 174: 1 — 5. PubMed DOI:10.1084/jem.174.1.1
Kugelman L.C., Ganguly S., Haggerty J.G., Weissman S.M., Milstone L.M. (1992). The core protein of epican, a heparan sulfate proteoglycan on keratinocytes, is an alternative form of CD44.. J. Invest. Dermatol. 99: 886 — 891. PubMed DOI:10.1111/1523-1747.ep12614896
Tanabe K.K., Nishi T., Saya H. (1993). Novel variants of CD44 arising from alternative splicing: changes in the CD44 alternative splicing pattern of MCF-7 breast carcinoma cells treated with hyaluronidase.. Mol. Carcinog. 7: 212 — 220. PubMed DOI:10.1002/mc.2940070403
Chiu R.K., Carpenito C., Dougherty S.T., Hayes G.M., Dougherty G.J. (1999). Identification and characterization of CD44RC, a novel alternatively spliced soluble CD44 isoform that can potentiate the hyaluronan binding activity of cell surface CD44.. Neoplasia 1: 446 — 452. PubMed DOI:10.1038/sj.neo.7900045

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1681 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P16070 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1681 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P16070 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.