CD74

CD74
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1A6A, 1ICF, 1IIE, 1L3H, 1MUJ, 3PDO, 3PGC, 3PGD, 3QXA, 3QXD, 4AEN, 4X5W
Ідентифікатори
Символи	CD74, DHLAG, HLADG, II, Ia-GAMMA, CD74 molecule, p33, CLIP
Зовнішні ІД	OMIM: 142790 MGI: 96534 HomoloGene: 3209 GeneCards: CD74
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nitric-oxide synthase binding; • identical protein binding; • MHC class II protein binding, via antigen binding groove; • cytokine receptor activity; • macrophage migration inhibitory factor binding; • protein folding chaperone; • MHC class II protein complex binding; • amyloid-beta binding; • GO:0001948 protein binding; • MHC class II protein binding; • cytokine binding; • CD4 receptor binding;
Клітинна компонента	• lysosomal lumen; • Екзосома; • MHC class II protein complex; • lysosomal membrane; • late endosome; • endocytic vesicle membrane; • transport vesicle membrane; • integral component of membrane; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • multivesicular body; • комплекс Ґольджі; • Golgi membrane; • trans-Golgi network membrane; • macrophage migration inhibitory factor receptor complex; • мембрана; • cell surface; • внутрішньоклітинний; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • Ендоплазматичний ретикулум; • endoplasmic reticulum membrane; • клітинна мембрана; • Лізосома; • Вакуоля; • Ендосома; • clathrin-coated endocytic vesicle membrane; • NOS2-CD74 complex; • external side of plasma membrane;
Біологічний процес	• Імунна відповідь; • positive regulation of T cell differentiation; • negative regulation of apoptotic process; • Сигнальна трансдукція; • positive thymic T cell selection; • chaperone cofactor-dependent protein refolding; • T cell selection; • positive regulation of type 2 immune response; • positive regulation of dendritic cell antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • adaptive immune response; • antigen processing and presentation; • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • negative regulation of mature B cell apoptotic process; • regulation of macrophage activation; • negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; • immunoglobulin mediated immune response; • leukocyte migration; • positive regulation of neutrophil chemotaxis; • positive regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production; • macrophage migration inhibitory factor signaling pathway; • prostaglandin biosynthetic process; • проліферація; • antigen processing and presentation of endogenous antigen; • immune system process; • defense response; • negative regulation of peptide secretion; • negative regulation of T cell differentiation; • positive regulation of macrophage cytokine production; • positive regulation of B cell proliferation; • negative thymic T cell selection; • positive regulation of fibroblast proliferation; • intracellular protein transport; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; • positive regulation of cytokine-mediated signaling pathway; • positive regulation of protein phosphorylation; • positive regulation of kinase activity; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of MAPK cascade; • positive regulation of monocyte differentiation; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of viral entry into host cell; • protein heterotetramerization; • protein trimerization; • protein-containing complex assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	972
	16149
	ENSG00000019582
	ENSMUSG00000024610
	P04233
	P04441
	NM_004355; NM_001025158; NM_001025159; NM_001364083; NM_001364084
	NM_001042605; NM_010545
	NP_001020329; NP_001020330; NP_004346; NP_001351012; NP_001351013
	NP_001036070; NP_034675
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CD74 (англ. CD74 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 296 амінокислот, а молекулярна маса — 33 516[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHRRRSRSCR	EDQKPVMDDQ	RDLISNNEQL	PMLGRRPGAP	ESKCSRGALY
TGFSILVTLL	LAGQATTAYF	LYQQQGRLDK	LTVTSQNLQL	ENLRMKLPKP
PKPVSKMRMA	TPLLMQALPM	GALPQGPMQN	ATKYGNMTED	HVMHLLQNAD
PLKVYPPLKG	SFPENLRHLK	NTMETIDWKV	FESWMHHWLL	FEMSRHSLEQ
KPTDAPPKVL	TKCQEEVSHI	PAVHPGSFRP	KCDENGNYLP	LQCYGSIGYC
WCVFPNGTEV	PNTRSRGHHN	CSESLELEDP	SSGLGVTKQD	LGPVPM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Claesson L., Larhammar D., Rask L., Peterson P.A. (1983). cDNA clone for the human invariant gamma chain of class II histocompatibility antigens and its implications for the protein structure.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80: 7395 — 7399. PubMed DOI:10.1073/pnas.80.24.7395
Kudo J., Chao L.-Y., Narni F., Saunders G.F. (1985). Structure of the human gene encoding the invariant gamma-chain of class II histocompatibility antigens.. Nucleic Acids Res. 13: 8827 — 8841. PubMed DOI:10.1093/nar/13.24.8827
O'Sullivan D.M., Larhammar D., Wilson M.C., Peterson P.A., Quaranta V. (1986). Structure of the human Ia-associated invariant (gamma)-chain gene: identification of 5' sequences shared with major histocompatibility complex class II genes.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 4484 — 4488. PubMed DOI:10.1073/pnas.83.12.4484
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Riberdy J.M., Newcomb J.R., Surman M.J., Barbosa J.A., Cresswell P. (1992). HLA-DR molecules from an antigen-processing mutant cell line are associated with invariant chain peptides.. Nature 360: 474 — 477. PubMed DOI:10.1038/360474a0
Berger A.C., Roche P.A. (2009). MHC class II transport at a glance.. J. Cell Sci. 122: 1 — 4. PubMed DOI:10.1242/jcs.035089

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1697 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.
UniProt, P04233 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1697 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P04233 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.